7日，莫希齊茨基總統在越過國境以前，發表了一項宣告，宣佈“為了保護共和國的象徵和保護憲法權力的泉源”，他已決定離開波蘭，並且宣佈他將在某個可以保證政府行使主權的地方建立行政中心，政府從那裡可以關注共和國的利益。在這一階段，莫希齊茨基總統顯然打算把政府遷到巴黎。他們這時正以難民的身分進入羅馬尼亞，總統希望羅馬尼亞政府能尊重它與波蘭的同盟，准許他偕同閣僚們從羅馬尼亞離境。
然而羅馬尼亞政府立刻受到德國的強大壓力，要它拘留波蘭領導人，波蘭的西方盟國也提出相反的建議，但毫無效果。9月20日，布加勒斯特宣佈，將照德國的要求把斯米格萊…雷茲拘留在羅馬尼亞直到戰爭結束。同時羅馬尼亞公安當局宣佈，只有不是政府官員的平民難民才能獲准離開羅馬尼亞。莫希齊茨基進入羅馬尼亞不到一個星期，就放棄了在法國重建政府的希望，並決定，必須採取其他措施以保證維持波蘭共和國的主權。
1935年4月23日的波蘭共和國憲法規定，如果發生戰爭，總統應當指定一個繼承人，一旦總統亡故或者無法行使職權時，繼承人便當立刻就職。看來，當德國一進攻波蘭，莫希齊茨基總統就執行了這一條規定，指定已經名列波蘭第二號人物的斯米格萊…雷茲元帥為繼承人。然而，當時這一指定不能發生效力，因為斯米格萊…雷茲象莫希齊茨基一樣，也無法執行國家元首的職責。
9月29日，在巴黎出版的波蘭官方報紙《波蘭箴言報》釋出一項命令，根據憲法，指定這時在巴黎的波蘭參議院前任議長瓦迪斯瓦夫·拉奇基耶維奇為莫希齊茨基的繼承人，並宣佈莫希齊茨基自9月30日起辭職。這項命令有莫希齊茨基的簽字，日期是1939年9月17日，簽署的地點在庫特。鑑於各種情況，特別是上述莫希齊茨基9月17日的文告，看來德國人斷言那個命令倒填日期，斷言莫希齊茨基到羅馬尼亞政治避難之前並沒有把政權交出，這些判斷大概是正確的。
9月30日，拉奇基耶維奇在巴黎的波蘭大使館宣誓就任波蘭共和國總統，並立即任命了一個新政府。西科爾斯基將軍同意擔任總理。各部部長的人選，目的在使內閣能代表各種不同的政治見解和各階層的人民。新政權立刻獲得了波蘭的西方盟國的正式承認，也獲得了華盛頓的正式承認，美國國務卿10月2日宣佈，美國政府打算同巴黎的波蘭政府保持外交關係。10月底，波蘭政府決定從巴黎遷到昂熱，並宣佈曾在華沙派駐外交使節的各國政府（當然除開德蘇政府）都將派使節到昂熱。
12月間，總統下令成立國民參議會，以對政府提出的問題發表意見。參議員的名額限定二十四人，從各政黨內遴選。帕戴賴夫斯基不顧年事已高，還是接受邀請，主持了參議會。參議會的第一次會議在1940年1月23日舉行。
波蘭流亡政府在成立後的最初幾個星期內，公開地否認與戰前在華沙實行的政策有關係。在10月和11月的第一個星期內，它釋出了一系列命令，宣佈凡因反對政府而被判刑的波蘭政治領袖一律完全恢復名譽；宣佈解除斯米格萊…雷茲的波蘭武裝部隊總司令兼軍隊總監的職務，任命西科爾斯基擔任此職，宣佈解散1935年9月選出的議會上下兩院。11月底，拉奇基耶維奇對波蘭人民廣播，答應戰後新波蘭將尊重個人的自由和權利，實行社會改革；幾個星期以後，政府公佈了西科爾斯基1940年1月3日在內閣會議上作出的宣告，宣稱波蘭戰前的政權已遭到全國一致的譴責，它的劣跡無疑乃是波蘭戰敗的主要原因之一。
波蘭流亡政府一面這樣煞費苦心地表明它和過去決裂的立場，一面採取一切可能的措施以維護波蘭共和國的主權和保護它的利益。為了這一目的，它正式抗議德國和蘇聯併吞波蘭領土，它也進行準備，使波蘭武裝部隊能在陸上、海上、空中參加對德作戰。
他們在釋出命令指定拉奇基耶維奇為總統的那天（9月29日），就發表了第一個公開宣告，聲言保留波蘭國家的權利。那天駐伯爾尼的波蘭公使館發表了一項宣告，宣稱波蘭政府不承認佔領波蘭領土的國家採取完全不屬行政需要的任何行動。9月30日，又向所有與波蘭有外交關係的各國政府遞交了一份反對9月28日德蘇邊界協定的抗議書。10月間，波蘭政府向國際聯盟抗議德蘇瓜分波蘭的安排；向國際聯盟及其成員國政府提出抗議，反對把維爾紐斯交給立陶宛；又向法國、英國和美國等政府抗議，反對根據1939年10月8日希特勒的命令把波蘭西部各省併入德國。當在俄國佔領的土地上舉