第二條，人類使家畜發生的那些變化，如為載重培育的轅馬，為達到高速度培育的跑馬；人們還培育出各種品種的狗：勇猛和力氣大的（鬥犬）、有特別敏銳嗅覺的（獵犬和西班牙狗）、賓士特別迅速的（靈狸）、能拖出溺水者屍體或被打死的獵物的、北極地區的拉套狗；培育出改變了形態和顏色的動物和鳥類（家兔、鴿子）。在氣候的直接影響下發生的變化也算到這裡來了，他指出在溫暖氣候下的長著較細羊毛的綿羊，冬季裡雪白的野兔和沙雞。他還把鍛鍊和生活方式對人的影響算入這些變化之列，如鍛工、划槳人、紡織人、搬運工和馬戲雜技演員的四肢發生的變化。
第三條，畸形的出現和後代對畸形的繼承。他舉的例子有：每隻爪子上都額外長著一隻爪的貓，也有額外長著一個爪的雞、腿上長羽毛的雞、羅馬和那波利的無尾狗（按布豐的觀點，大概是從被砍掉尾巴的狗那裡繼承來的特徵）。
第四條，“從老鼠和蝙蝠到大象和鯨魚”等所有溫血動物——四足動物、鳥、兩棲動物以及人類在構造上驚人的相同之處。這都使伊拉司馬斯·達爾文認為所有這些形體起源於一條“動物纖維”（他曾是一位精原論者）。“這條纖維在一些動物身上，在其成熟之前的發展過程中開始有了手和有敏銳觸覺的手指，如人類，在另一種動物身上這條纖維成了爪子……在第三種動物身上成了帶有中間組織或者蹼的趾……在第四種動物身上則成了對生的蹄……而在另一些動物身上則成了囫圇的蹄，然而，這條原始纖維在鳥類身上卻沒有發育成手或者腳，而發育成了翅膀，沒有發育成毛髮，而發育成了羽毛”等等。
第五條，他實質上是重複他在確定第一條和第二條因素時說過的東西，這就是一切生物從它生命的開始到結束都在變化著，並把已具有的特徵遺傳下去。
發生變異的理由是動物的三個基本本能：性感、飢餓和求安全。伊拉司馬斯·達爾文把雄性想專門佔有雌性的這種意圖作為一種衝動提出來。這種意圖引起雄性間的互相爭鬥，其中誰有最好的格鬥工具誰就能獲取。他認為屬於這方面的有：野豬肩上厚得象甲殼一樣的皮，這塊皮僅僅為了用以抵禦其他想用獠牙斜著向上挑刺情敵的野豬；牡鹿的長成枝叉般的角，是用來擊退情敵進攻的，還有雄禽（公雞）的距。伊拉司馬斯·達爾文說，因此，進行繁殖的就會是最強壯和最活躍的動物，這樣，這種動物也就會日臻完善。
動物還會因獲取食物的方法不同而發生變異，豬鼻孔長在硬硬的拱嘴上，好在泥土裡搜尋昆蟲和草根；象的長鼻子是用來折斷象賴以為生的樹枝的；食肉類野獸有強有力的頜骨和爪子；牛在啃吃成把的青草的過程中，使粗糙的舌頭和不光滑的上顎發達起來。
第三需要，即實現防衛，就使救生工具發達起來，如靠加長了的鰭和翼下的膜（飛魚、蝙蝠），或者加長了的腿（兔）來實現。防衛也可以靠堅硬的甲殼或刺來實現（烏龜、海刺蝟）。
伊拉司馬斯·達爾文在《動物生物學》裡指出，對溫血動物的結構中的重大相同之處的考慮，對溫血動物在出生之前和出生之後所經受的各種變化的考慮，以及對地球形成時代起到人類形成止有一個極大的時間間隔的考慮，這些都使他得出推論說，所有的溫血動物都起源於一條“活纖維”。
“偉大的始因”使這種“活纖維”具有生活能力，使它有能力長出帶有新習性（由刺激、感受、願望和聯想引起的）的新的部分，使它有能力把歷代以自身的積極活動獲得的東西傳給後代。
林納的“昆蟲”和“蠕蟲動物”可能也有一個共同的起源，然而卻起源於另外一條活纖維。他認為植物可能也是這樣，在植物中，樹木是由草本植物在爭奪陽光和空氣的鬥爭中發展起來的；而有些植物“學會了”逐漸附著在自己鄰居身上，或者象常青藤那樣纏繞著，或者象葡萄那樣靠卷鬚纏著，或者象槲寄生植物那樣長在其他植物身上並從中吸取養分。伊拉司馬斯提出一個問題，原生動物纖維是不是對所有這些植物和低階、高階動物來說都是特殊的呢，還是應該認為可能這些動植物界是逐漸出現的？很可能，它們起源於有機界所有東西的起因的同一條活纖維。
他在《動物生物學》裡引證了大衛·休謨的思想，認為生殖能力在世界上比備受讚頌的智慧重要，因為智慧能造出機器，例如指南針，而生殖能力則創造出機器的創造者。
伊拉司馬斯·達爾文的最後一部敘事詩是《大自然的神殿》，這是在他去世之後，查理·達爾文誕生之前六年，即一八○三年出版的。我