戰區最重要的城市，一旦被華夏攻佔，華夏將會在長江中下游站穩腳跟，華夏軍向北可以與直屬1師（也就是天津派遣軍）、第9師等部隊會師，向南可以與第9師、第900師等部隊會合，對李鴻章所部清軍完成戰略合圍。
華夏軍還可以沿著長江西進，進攻安徽重鎮安慶，江西重鎮九江，兵鋒直逼武漢，與廣西、廣東、雲南的華夏軍一起，對湖南和湖北的張之洞所部完成戰略合圍，到那時候，張之洞也不可能擋得住華夏軍，張之洞就只有一條路可以走，那就是西進入蜀，避讓林飛的兵鋒。
一旦張之洞退入四川，駐守在開封洛陽一線的袁世凱就將陷入南北兩面受敵的戰略死地，到時候袁世凱也沒有回天之力，只能西進，退入陝西，這樣一來，清廷擁有的土地，就只剩下了山西、陝西、四川、甘肅等西北和西南省份。
李鴻章明白，自己必須不惜一切代價守住南京，否則整個清國就完蛋了。
五月一日，李鴻章在南京守軍大營召開軍事會議，商討華夏軍的進軍路線和防禦策略，李鴻章的幕僚們一致認定，華夏軍想要進攻南京，有三條路線可以選擇，第一，沿著長江逆流而上，這是最方便最快捷的。
第二，沿著陸路進攻南京東部。
第三，迂迴到南京南側發動攻擊。
李鴻章認為，華夏採取第三條進軍路線的可能性最小，如果華夏軍想要攻擊南京南部，那就要多走近百公里，期間要遭受清兵的層層阻擊，而且迂迴的路線上到處都是江南特有的水網地形，進軍極其不便。
華夏軍採取第二條路線的可能性也不大，因為南京城的東部有一座山，名叫鐘山，鐘山是南京重要的地理屏障，正所謂“鐘山龍蟠，石頭虎踞”，鐘山就像一條龍，橫亙在南京之東。
華夏軍火力強悍，士兵作戰驍勇，特別善於在平原地區打野戰，如果進入山地作戰，那華夏軍的優勢將無法發揮。
李鴻章認為，華夏軍採取第一條進攻路線的可能性最大，華夏軍很有可能利用手中強大的海軍力量，沿著長江逆流而上，在南京附近登陸，而登陸地點，必然選在燕子磯。
燕子磯是長江三大名磯之一，歷來是長江重要渡口，是兵家必爭之地，宋金對抗之時，金兀朮率領十萬大軍南下，宋軍將領韓世忠、梁紅玉率部發起黃天蕩戰役，大敗金兀朮，宋代時期的黃天蕩，就在燕子磯一帶。
在第一次鴉片戰爭時期，英軍正是從燕子磯登陸，攻破南京城，一路燒殺搶掠，迫使清廷簽訂了喪權辱國的《中英南京條約》。
李鴻章決心選派一名得力干將，鎮守燕子磯，由於在燕子磯發生的戰鬥，必然既有陸戰，也有水戰，所以李鴻章想要派遣一名海軍軍官鎮守燕子磯，思來想去，羅榮光最為合適，可是羅榮光被譚嗣同打了個半死，羅榮光的親衛營被譚嗣同盡數擊斃，羅榮光對清廷已然滿是恨意，所以不能再用他了。
李鴻章環顧帳下，劉坤一擅於陸戰，不善水戰，譚嗣同乃是一介書生，忠勇有餘，才能不足，都不是鎮守燕子磯的上佳人選，此時李鴻章突然看到一人，此人文質彬彬，戴著一副眼鏡，身材瘦削，目光炯炯。
原來此人名叫謝葆璋，當年是北洋海軍來遠艦駕駛二副，作戰驍勇，劉公島戰役時，來遠艦被日軍魚雷艇偷襲，壯烈沉沒，陣亡三十餘人，謝葆璋在來遠艦沉沒之時，縱身躍下大海，在冰冷的海水中游了數個小時，竟然游回了劉公島。
此事李鴻章深以為奇，特地約見謝葆璋，暢談一番，深感此人之能力，擔任駕駛二副實在是暴殄天物，於是將此人留在帳下，此時李鴻章決定，派出謝葆璋，鎮守燕子磯。
李鴻章於是委任謝葆璋為燕子磯總兵，統領水陸部隊，務必擋住華夏軍，謝葆璋冷靜地接受了命令。
在林飛時代，提起這個謝葆璋，知道的人可能很少，不過提起他的女兒，卻是家喻戶曉，一九零零年十月五日，他的妻子生下一個女嬰，他為這個女嬰起名叫“謝婉瑩”，這個女嬰長大之後起了一個筆名——冰心。
李鴻章又把南京城十萬清軍全部調動到燕子磯，加上燕子磯原有的十萬守軍，僅在燕子磯，清軍就集結了二十萬兵力。
李鴻章又派劉坤一鎮守鐘山，鐘山兵力十五萬左右，整個南京，已經投入了三十五萬兵力，李鴻章又命令南京周圍各州府縣的清兵，嚴加防禦，防止華夏軍從南京南側迂迴，這些州府的兵力，總計也有十五萬，南京一役，清軍已然集結了五十萬兵力。
謝葆璋到達燕子磯之後，立刻命令