艦隊的各主要下屬司令部。基地西岸的科羅納多設有兩棲作戰基地，北島設有海軍航空站。周圍還建有海軍訓練中心、補給中心、艦隊反潛訓練中心、海軍兩棲作戰訓練學校、海軍醫院以及為軍事目的服務的海豚訓練中心等。
李從他們的目標自然就是這裡的海豚訓練中心了，要是以前他們小打小鬧的弄一點海豚什麼的，李從也不會這樣大動干戈的，實在是現在的這個烏賊對自己的全球戰略構成了巨大的威脅了，所以李從要冒天下之大不韙對這裡開刀，就算是面對歐羅巴和骷髏會的聯軍也必須要進行，掃除對自己一切有威脅的東西就是李從必須做的。
一直以來，聖迭戈基地還始終承擔著保護美國西海岸。防止敵人從太平洋海域向美國本土發動攻擊的任務。但冷戰結束後，伴隨著美國戰略方向的調整，聖迭戈基地與y太地區的聯絡越來越緊密。
世紀90年代。聖迭戈基地和y太地區的聯絡主要是透過航母實現的，該基地部署的三艘航母——“星座”號、“斯坦尼斯”號和“尼米茲”號每年都會輪流到y太地區進行戰備訓練，以熟悉y太地區的作戰環境，演練作戰預案。並顯示美國海軍在y太地區的軍事存在。2003年，美海軍耗資近45億美元建造的、效能最先進的“里根”號航母選擇了聖迭戈基地作為母港，正式接替“星座傳更新當年半年，“里根”號航母開始了在y太地區的“巡航之旅”。除了航母，潛艇也是聖迭戈關注的物件。近年來。美國每年都會出臺《華夏軍力報告》，渲染華夏的潛艇威脅。美國參議院軍事委員會主席鄧肯曾在國會高呼：“聖迭戈和戰區部隊應該看到這一點。”對此，美太平洋艦隊立即做出了反應。2004年4月，太平洋艦隊正式成立了艦隊反潛戰司令部，全面負責在y太地區的反潛作戰，而這個司令部就設在聖迭戈基地。反潛戰司令部成立後，積極研究反潛戰方法，制定反潛作戰計劃。並在聖迭戈設立了反潛作戰訓練中心。在這個中心接受訓練的不僅有美國海軍作戰人員。還有前扶桑派出的自衛隊隊員。2005年年初，前扶桑自衛隊還首次派人前往美國本土，同美軍共同演練“奪島戰”，演練地點就選在了聖迭戈基地。
2006年2月，隨著美國國防部《四年防務評估報告》的出臺和能源集團勢力的擴大，美軍正式明確將戰略重心移至y太地區。聖迭戈基地也進一步加快了和y太地區的融合。聖迭戈由美國海軍面向y太地區的力量投送基地和練兵場，轉變成為美國海軍在y太實施作戰不可或缺的一個重要組成部分。《四年防務評估報告》提出。要改變美國海軍在太平洋和大西洋的核潛艇分佈比例各佔一半的狀況，在2010年前將60％的潛艇部署在y太地區。根據這一要求。美海軍計劃將6艘部署在大西洋的核潛艇轉移到位於太平洋沿岸的基地。據美國《防務新聞》報道，在這6艘潛艇中，有3艘將被部署在聖迭戈基地。與此同時，美國海軍還宣佈，將一直設在得克薩斯州的美海軍水雷戰司令部和訓練中心也遷往聖迭戈，並將於今年10月與反潛戰司令部合併，成立“反潛掃雷聯合司令部”。對此，美軍聲稱，潛艇和水雷是美國海軍面臨的最主要威脅，而y太地區的部分國家目前正在重點發展這類裝備。在這種情況下，將兩者融合，可成為美國海軍的“戰鬥力倍增器”，充分確保美軍在y太地區的軍事主動權。日前，美國海軍又宣佈，每艘價值2億美元、主要用於近海作戰的“近海戰鬥艦”即將投入部署，首批4艘將全部部署在聖迭戈基地。在解釋原因時，美海軍官員表示，這是根據《四年防務評估報告》“突出y太地區重要性”的精神而作出的。把“近海戰鬥艦”部署在聖迭戈基地，主要是考慮聖迭戈基地不但指揮控制和配套設施完備，更重要的是海軍水下作戰和水雷作戰的指揮中心均設在這一基地，這樣便於提高水面、水下和水雷作戰的合成與協調能力，開創“21世紀水下戰爭新紀元”。
對於聖迭戈面向y太地區的變化，美海軍太平洋艦隊潛艇部隊的司令卡西亞斯海軍少將說：“y太地區出現的‘新興威脅’正在增強，我們必須為此做好準備。這個新威脅自然就是說的李從了，李從自己也是有這個覺悟的，所以李從感覺自己有必要把這個海軍基地給直接打掉的，雖然以前的時候李從都有直接對歐羅巴和大俄羅斯動武的事情，可這次仍然是要打起十分的精神的。因為自己眼前的這個敵人可是歐羅巴跟大俄羅斯加起來都趕不的，他必須要防止骷髏會魚死網破的，那個時候可能自己就會進入自己的圈套了。
“長官。總部那邊轉過來的電話，是元首。”話務員激動著