月21日，也就是肯尼迪遇刺的前一天晚上，馬德萊娜參加了一個為胡佛舉行的晚會。那天約翰遜到得很晚，他一到就把亨特等人叫到一個小屋子裡開了十幾分鐘的密會，與會者中有一人後來還參加了調查肯尼迪遇刺事件的沃倫委員會。
實際上正是這次密會制定了刺殺肯尼迪的計劃。當約翰遜走出來的時候，他湊到馬德萊娜的耳邊小聲說：“從明天起，那個該死的肯尼迪就不會再妨害我。這不是威脅，而是說到做到。”第二天上午，在肯尼迪遇刺之前4小時，馬德萊娜接到約翰遜從他與肯尼迪一起下榻的旅館打來的電話，他將前一天晚上說的話又重複了一遍。馬德萊娜當時並沒弄清這句話的深刻含義，但在肯尼迪被殺後她一切都明白了。馬德萊娜還回憶說，大約一個月後，她問約翰遜是否介入刺殺肯尼迪的案件，他頓時勃然大怒，責怪她不該談論這個話題。接著，他對馬德萊娜說：“你不是認識我的朋友嗎？是他們殺了他。”他提到亨特的名字。
肯尼迪遇刺身亡後，約翰遜憑藉手中的總統大權，控制了對這個案件的調查，不僅自己逃脫了罪責，也保護了他的同謀。
案發後，當肯尼迪還在醫院搶救的時候，約翰遜就下達了清洗肯尼迪乘坐的敞篷車的命令。接著，約翰遜委派他的親信將康納利州長帶血的衣服取回洗淨，並再次下令銷燬物證。
此後，以最高法院*官沃倫為首的7人調查委員會成立，而沃倫委員會實際上受到了約翰遜的暗中操縱。儘管當時人們提出許多疑點，但在調查委員會後來提出的一份報告中，竟然武斷地把行刺說成是一個“獨立的事件”，“沒有什麼證據證明有任何人幫助奧斯瓦爾德”，一個舉世震驚的案件就這樣畫上了句號，從而掩蓋了真正的兇手和幕後策劃者。
肯尼迪：震動世界的刺殺迷案（14）
而比利·索爾·埃斯蒂斯則向記者披露，他不僅知道殺害肯尼迪的兇手，還掌握一些證據。
當時已是億萬富翁的埃斯蒂斯1948年與約翰遜相識時還很年輕，那時候，約翰遜是國會參議員身份，已經是美國最有權勢的人物之一。約翰遜的政治顧問克利夫·卡特為他營造了一個堅實的得克薩斯網路，裡面聚集了政治、金融、司法等領域的一批精英。埃斯蒂斯進入約翰遜的政治經濟網路後，曾從財政上給予約翰遜很大的支援，先後給過他幾百萬美元。
而這些付出也換來了約翰遜豐厚的回報。埃斯蒂斯說，“利用約翰遜在華盛頓的地位，我獲得了許多政府合同，條件是所賺的錢有一部分要打入約翰遜的黑金庫。這主要是為了給機器上潤滑油，保證得克薩斯集團的利益在華盛頓得到很好的體現。”依賴於和約翰遜之間的穩固關係，埃斯蒂斯的農業生意1961年達到了頂峰。
在埃斯蒂斯的眼中，肯尼迪的遇刺其重點在於約翰遜的得克薩斯集團擔心喪失在華盛頓的利益，“他們覺得必須採取行動”。肯尼迪甚至已經為自己連任選舉重新選擇了副總統夥伴——北卡羅來納州州長賽弗爾斯，而不再是約翰遜。“一旦擺脫了林登·約翰遜，肯尼迪陣營將竭盡全力，建立新的權力結構。顯然，這將妨礙得克薩斯的利益。”
1963年年初，和約翰遜有關的貪汙案件傳播開來，幾個贊助人也惹上了麻煩，到了只能進不能退的地步。此外，肯尼迪決定進行財政改革，向國會提交議案准備大幅削減得克薩斯石油大亨在稅收上享受的優待。該議案如果獲得透過，將使這些石油巨頭失去上億美元的利潤，約翰遜會失去他們的錢和網路。
肯尼迪決心按照自己的意志行事，卻不明白自己是在“玩火”。漸漸地，在達拉斯，竊竊私語變成了驚慌的抱怨：“應當趁時間還不晚，殺死肯尼迪這個蠢貨！”慢慢地，約翰遜與他的支持者之間達成了一致，約翰遜於是建議肯尼迪去一趟得克薩斯。
後來的一切已無須再說。
美國總統歷來是壟斷資本集團的代言人，刺殺肯尼迪實際上反映了不同利益集團之間不可調和的激烈鬥爭。肯尼迪便是這種鬥爭的犧牲品。肯尼迪的身後是美國北方馬薩諸塞州的大財團，而約翰遜的支持者是南部的大資本家和大農場主。約翰遜憑藉得克薩斯州一批億萬富翁財政上的大力資助，在官場上步步擢升，並聚集了三四千萬美元的私人財產。1963年10月，肯尼迪宣佈要對稅收政策進行改革，觸犯了德克薩斯石油大亨們的利益，這也許就是他們決心幹掉肯尼迪的主要原因。
肯尼迪之死，迄今已將近半個世紀。在過去的40多年裡，關於肯尼迪遇刺的內幕至少有36