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由於渡劫沒有仙人的幫助，變的非常困難，使得大部份修真者都害怕渡劫，進而造成修魔者轉投入魔界而放棄修仙。投身魔界是十分簡單的事情，根本不需要渡劫，然而修魔之後本身就會變的非常暴戾偏激。
在經歷千年之後，終於爆發修真界的最大戰役，也是大部份世人所知道的戰爭，就是正派由護天門的姜子牙帶領，而魔道的頭領則是妲己。這個事件人們只當成神話，其實卻是真正為世人所知的第二次修真者之戰。
修魔者經歷此戰後元氣大傷，為世人所唾罵，不得不由明轉暗。而修仙之人也漸漸的開始淡忘修魔者的威脅。第一次神話戰爭是皇帝與蚩尤之戰，那是真正的仙與魔的戰爭，但是中間原由卻不太為人知。
在經歷了商周之戰後平安了近八百多年，修仙者得到了前所未有的壯大，也就是歷史上的春秋時期，修仙者無論門派還是門人都達到了前所未有的頂峰。
這時，修魔者偷偷透過朝廷勢力滲入秦國，並利用人的私慾挑起了各國紛爭。當時修魔者控制了秦朝有名的名將白起，偷偷將自己的門人安插在軍隊裡，再利用軍隊與修魔者一起的特殊性和隱蔽性，突然發難，殺了韓魏兩國修真門派一個措手不急，同時秦國也順利的滅掉了兩國，使得在這兩國內修真門派無法立足。只得將剩下的門人轉移到趙國，當時趙國是修真繁華之地也是正道領袖護天門的根基所在，沒有哪個國家敢輕易招惹。
那些修真門派都認為自己只是一時不察讓魔門佔了先機，以為躲在趙國休養一陣之後就能馬上反撲魔門。正是因為他們的輕敵之心加上太低估了魔門經過近千年休養後的實力，不但被白起滅了趙國，而且白起所坑殺的四十萬趙國人中就有近十萬的修仙者。
這時各國的修真門派才意識到了這前所未有的危機，終於聯合起來廣派人手查出了當時的原兇居然是秦始皇，他才是真正的魔門之主。
可惜為時已晚，他已經修煉了魔界的怨念滅天訣，修煉這種功法就是需要無數的怨靈和修真者的元嬰，在屠殺了眾多凡人和修真者之後也使得他的功力飛速增長，怨念滅天訣也到了大成階段。
當時的修真界論單打獨鬥已無一人是他的對手，因此所有修真者空前大團結。憑藉著邪不勝正的這股信念與秦始皇一戰，可惜中了圈套，被魔門屠殺了大部份的修真者，經歷此役後，有不少修真者都遁入山林不問世事，只有為數不多的門派仍與秦始皇爭鬥，畢竟強弱太懸殊了，能做的事情也非常有限，秦始皇終於順利統一了中國。
可惜他始終不滿意現狀，害怕仙界會開啟通道來對付他，所以決定仙魔同修，以備有一天能同天界一戰，藉著統一國家制度和思想的口號，拼命的蒐羅修真秘籍，同時也害怕修仙者伺機反撲，因此拼命殘害修仙者及與之相關的一切，這就是歷史上有名的始皇帝的焚書坑儒，其實應該是坑修仙者才對。
秦始皇可以說得上是天縱英才，他竟然把蒐羅到的修仙典籍經過綜合修改創出了新的功法，為了加快急於求成，派人四處搜尋煉製靈丹的仙草、靈藥。靠著大量靈丹的幫助，沒幾年就順利修到了渡劫期，開創了修真界的最大奇蹟。
由於這種修煉方法的極端危險，加上修真根基不穩，秦始皇連第一個天劫都沒有渡過，就形神俱滅了。始皇一死，魔門也經歷了難以想象的動盪，為了爭奪魔門之主之位，魔人自相殘殺，結果也落得一蹶不振。可惜經歷此劫後的修仙門派大部份功法和上品靈器失傳的失傳、消失的消失，據說連護天門都失傳一些極機密的秘典。
修真界也因此得到一千多年的安穩，並靠這一千多年的喘息在俗世收了些弟子，開始慢慢恢復生機。
可惜到了明朝末年，吳三桂不知從何得到怨念滅天訣，以陳圓圓為幌子，引清兵入關，利用各種陰險的手段，在修真者聚居地造成揚州三日，嘉定十屠的慘劇。
雖然吳三桂修煉魔功有所小成，但因為他格局已定，很難循序再進，所以決定謀反，企圖利用戰爭讓自己的魔功能大成，幸虧各大門派及時發現