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蔣天樞後來在記述這段“事輯”的按語中寫道：“如非日本挑起太平洋戰爭，（陳寅恪）赴英倫之舉或終能成行。先生離北平時，右眼視網膜已發現剝離現象，若得至英倫，眼疾當可醫治痊復，不致終於失明。”蔣氏慨嘆：“天歟，際遇之不幸歟？”
【命運】
陳寅恪在清華國學院時的助手、後為清華中文系代主任浦江清說：“那時候左右分明，中間人難於立足。他（陳寅恪）不反對共產主義，但他不贊成俄國式共產主義。”這個記錄，與抗戰時期陳寅恪在成都燕大與學生石泉所談極其相似，此一思想觀念伴隨了陳氏一生。
1948年12月，當北平解放戰爭打響的時候，陳雪屏等人的“搶救學人”計劃也開始了，當浦江清告訴陳寅恪此事時，陳僅表示已知此事。隨後胡適找到北大校長辦公室不掛名的秘書鄧廣銘，急切地詢問能否找到陳寅恪，並謂昨日南京政府來電，說今日派專機抵達南苑機場，“搶救”胡與陳寅恪等著名教授離平。鄧廣銘在陳寅恪大嫂（陳師曾遺孀）找到陳，把胡適的囑託向陳複述一遍，並問是否願意與胡氏一起離平南飛。陳寅恪頗為乾脆地回答：“走。前許多天，陳雪屏曾專機來接我。他是國民黨的官僚，坐的是國民黨的飛機，我絕不跟他走！現在跟胡先生一起走，我心安理得。”
當晚，鄧廣銘到東廠衚衕與陳寅恪話別，陳對鄧意味深長地說了下面一段話：“其實，胡先生因政治上的關係，是非走不可的；我則原可不走。但是，聽說在共產黨統治區大家一律吃小米，要我也吃小米可受不了。而且，我身體多病，離開美國藥也不行。所以我也得走。”
1948年12月15日清晨，胡、陳兩家趕至中南海，下午從勤政殿門前換乘傅作義的坐駕，順利穿過宣武門抵達南苑機場，乘機飛離北平，抵達南京明故宮機場。當胡、陳等人及其家眷乘坐的飛機時，王世傑、朱家驊、傅斯年、杭立武、蔣經國等前往機場迎接。亂世紛紜中，陳寅恪只在南京住了一個晚上，第二天便攜家眷悄然赴上海，在俞大維弟弟俞大綱家中住了下來。一個月後，陳寅恪沒有踏上赴臺的船板，而是轉赴廣州嶺南大學任教，自此，終生留在了嶺南這塊潮溼溫熱的土地上。
按美籍華人學者、“國民黨的同道人”（李敖語）余英時的說法，身處嶺南的陳寅恪和夫人唐篔曾為去留問題發生強烈爭執，唐篔執意要走，因此隻身去了香港，住在“一家無招牌的私家旅館”，後來陳序經做工作後派人迎還。陳寅恪事後深深佩服夫人的遠見，後悔自己沒有及早謀身遠去，《柳如是別傳》就是陳氏的懺悔之作云云。但據美籍華人學者汪榮祖考證，陳和夫人並無去留爭執，因而餘氏的結論只能屬於胡言亂語一類。
【晚景】
1954年龍潛任中山大學副校長，在批判胡風的運動中，他點名批判陳寅恪的思想，過後不久他就受到了批判，後來龍潛在檢討時這樣表白道：“我對陳寅恪的問題考慮不周，和了他三首詩，在會場上唸了兩句，後來到了北京，許多領導同志都問到陳寅恪，我才知道問題不是那麼簡單。”
1961年陳寅恪與郭沫若見面。郭主動對過去兩人的不快作了“解釋”，並徵詢陳寅恪有何希望和要求。陳寅恪真摯地提出應組織力量整理出版《文苑英華》；並雲自己需要圖書資料和因寫《錢柳因緣》希望得到特製稿紙。郭沫若概允並踐諾。
1961年，陳寅恪辭別專門來探望自己的吳宓，為賦詩曰：“問疾寧辭蜀道難，相逢握手淚丸瀾。暮年一晤非容易，應作生死離別看。”其後果不復見。
1966年7月，陳寅恪由原來的大字號“走資派”、“資產階級反動學術權威”，水漲船高地被加封為“牛鬼蛇神”、“封建餘孽”、“死不改悔的走資派”，同時被指斥為大肆揮霍國家財產，享受高階護理待遇，非美帝國主義的藥物不吃，有意汙辱為其理療的年輕女護士等的“罪魁禍首”。而隨著陶鑄被打倒，一直頗受陶氏關懷的陳寅恪更是雪上加霜。助手黃萱被趕走，當年受陶鑄直接關懷而委派到陳家的三名護士被撤除，陳寅恪工資停發，存款凍結，陳家住居的校園內東南區一號樓被大字報覆蓋，遠遠望去如同一口巨大的白色棺材，兀立於樹木叢生的校園一隅，望之令人恐怖驚悚。接下來，大字報由樓外糊到了室內，門臉、衣櫃、床頭，甚至陳寅恪的衣服上皆由大字報貼蓋。面對此情，唐篔說：“人還沒死，已先開弔了。”
此後，陳寅恪後半生積攢的書籍全部查封，手