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但是，西安交通大學造反派並沒放過他。一次，一些造反派代表在北京見到陳毅副總理時，列舉胡炳雲的“罪狀”，要求批鬥胡炳雲。陳老總說：
“這個人我瞭解，他是個工農幹部，作戰很勇敢，他對黨、對毛主席很忠誠，服從命令聽指揮，是個好乾部；如果打起仗來，還要用他們這些人。”
交大學生聽了陳老總這番話後，就不再寫胡炳雲的大字報了。
“文革”後，胡炳雲擔任過蘭州軍區副司令員兼陝西軍區司令員、陝西省委書記、省革委會副主任、省人大副主任等職務，1981年底正式離休。1996年2月28日凌晨6時，胡炳雲在北京逝世，終年85歲。