眾將一一領命，這時劉國軒說道：“施琅而今移師西嶼洋麵，甚為不智，西嶼頭有本藩陸師炮臺，其正好為本藩水陸兩師夾擊，明日決戰當一鼓而定”
可是劉國軒料錯了，因為傅為霖的通風報信，清軍方面對鄭軍在澎湖的不知一清二楚，因此第二天清晨，當劉國軒準備出動全軍出動跟施琅所部清軍決一死戰的時候，卻得到了清軍不知去向的訊息，劉國軒無奈的收兵回營，並派出十餘隻快哨船四下打探。
清軍由於船隻眾多，所以很快就暴露了位置，劉國軒聞訊便率鄭軍水師主力南下，進駐虎井嶼、桶盤嶼與清軍在八罩嶼的水營隔海對峙。由於先前的勝利，劉國軒錯誤的認為清軍不堪一擊，於是不待己方營盤扎穩便全力向八罩嶼進攻。
此時清軍以逸待勞，發揮船多的優勢，林賢和朱天貴等部與施琅通力合作，自辰至午奮戰不止，縱然是劉國軒親冒矢石也未能開啟局面，最終劉國軒力戰不勝帶著輕傷和十五條船的損失退回了虎井嶼、桶盤嶼。
當天夜裡，施琅實施夜襲，用火攻船直襲鄭軍水營，劉國軒猝不及防，雖幾經搏殺，當最終未能守住兩島，天明之後劉國軒被迫撤回娘媽宮，此時鄭軍大中型戰船已經不到一百八十艘，而清軍依然保有近二百艘，戰力的天平開始傾斜了。
六月二十日清晨，施琅派人以慰問劉國軒傷勢的名義前來實施招降。
對於施琅的圖謀，劉國軒明確予以拒絕：“尊侯仕明遊擊，亡歸延平，復主逋逃，臣事三姓，此足下智若轉圜，勇於舍舊，捷出尋常萬萬，猥欲策駑末步驥塵，殷殷意厚，敢不拜嘉。國軒老矣，君存與存，君亡與亡，若一旦背而他之，卒然反噬，雖犬馬有不忍為，而謂國軒不犬馬若也？詰朝相遇，不盡欲言。”
儘管招降被劉國軒用辛辣的語言給頂了回去，但施琅卻依舊沒有放棄臨陣策反的念頭，他不斷派人以向故舊問安的名義給鄭軍各部送去招降的書信，姚啟聖也恰好此時派人過來誘降，在兩廂夾攻的情況下，鄭軍中的高階武官開始動搖了，其中左衝鎮鎮將楊德率部叛逃，造成鄭軍上下極大的震動。
為此劉國軒再度召集眾將，苦口婆心的告誡道：“以功，則三桂莫大，然以撤藩窘死，他皆殲殄，唯琅與天貴廑存，假以毒我。海氛朝以靖，兩人夕以誅耳。且兩軍殺掠相當，勝敗未卜，何餒然即欲投燼若斯？願共諸將軍決一死戰，以定去就何如？”
劉國軒語重心長的話語打動了猶豫不定的鄭軍諸將，於是軍心重新穩定下來，然而此時施琅得到來自大陸的增援，戰船總數更是達到了二百四十艘，佔有絕對優勢的他便不在等待鄭軍從內部瓦解，六月二十二日，最終的決戰開始了。
120。澎湖海戰（下）
決戰當日，施琅將所部分為四個部分。中路共有五十六艘大型戰船，分為八隊，每隊有七艘船，由施琅親自指揮，作為主力進攻娘媽宮。右路由朱天貴指揮，共轄有五十艘戰船，從東蒔攻入雞籠嶼、四角嶼，之後會合中央部隊夾攻鄭軍。左路由林賢指揮，也有五十艘船，計劃從內塹攻入牛心灣，讓鄭軍誤判清軍要在此地登陸。另外施琅還將八十艘較小的廣船、鳥船組成預備隊，隨時準備增援各路清軍。
在發現了清軍的動態後，劉國軒當即作出了調整，以江勝所部應對數量較多的中路清軍，以陳諒部對付內塹洋麵之敵，以邱輝和陳啟明兩部合力對方出現在雞籠嶼、四角嶼海面上的清軍，劉國軒則親率大艦作為預備隊並視各個方向的戰況予以增援。
明鄭方面的目的當然很明確，那在諸島炮臺的掩護下擋住清軍大部，先集中力量吃掉清軍一翼進而席捲全軍，在敵眾我寡的形勢下，不能不說，這個方略是正確。
雙方的戰鬥很快就打響了，這一天恰逢海上颳起了颱風，辰時（7時—9時）左右受颱風影響，海上吹的是西北風，鄭軍憑藉著順風一時佔據優勢，清軍左路李賢部和中路施琅本部為實力相差不大的鄭軍所阻撓，根本無力突破鄭軍的海上防禦。
右路戰場上則出現了一個戲劇性的場面，作為鄭軍水師前鋒的丘輝和林應為兒女親家，而林應和朱天貴也是兒女親家，大家又都為明鄭的舊日同僚，有這層關係，兩船相對的時候，朱天貴站於坐船尾樓上高聲大呼“親家”不止。
當然朱天貴的意思可能是想在戰場上招降了邱輝，但脾氣火爆的丘輝卻對這個叛徒痛恨不已，當即咬牙切齒回應道：“叛賊！背義之人，天所不容！”
說罷，邱輝即令舵工轉舵，發炮，說來也神了，這個時代的火炮從來就是機率殺