大蛇丸叛逃，自來也離開，掀起波瀾巨浪，一股看不見的影響力從火影辦公室輻射至整個木葉忍者村。
首當其衝的是波風水門，剛當上火影那幾天，他充滿幹勁準備大展宏圖。可是他很快就發現，以火影助理猿飛日斬為首，長老團轉寢小春和水戶炎門為輔的三人組，在他頒發命令時推三阻四。還有陰在暗處的志村團藏，和他掌控的根部置身事外，對火影的命令陽奉陰違。
一開始，水門不疑有他，認為是自己的經驗不足，能力沒有得到認可。但隨著時間漸漸推移，水門才驚覺，他想的太美好了。
火影、火影輔助、長老團，猿飛日斬四人把控著木葉大權，將大大小小的權力瓜分地一乾二淨，駕駛這輛戰車按照他們的想法衝鋒陷陣。
波風水門接班成為新火影，猿飛日斬退位擔任火影輔助，志村團藏被踢到長老團，木葉高層重新洗牌，又增加了一人，這意味著四人手中的權力要分出去一部分。
那麼把誰的權力分出去呢？
答案是：沒有！不可能！
權力是令人上癮的毒藥，好像讓飛蛾獻身的燭火。大家趨之若鶩，願意為之犧牲一切，事業、名聲、甚至生命。即便是最完美的聖人，手中握著權力，也會被私心腐蝕，墮落成魔鬼。
權力可怕且讓人著迷，大權在握成為棋手掌控萬千生死，這是多麼可怕的誘惑。嚐到了權力的美味，四人沒有一個肯放手，於是乎……
水門被架空了。
連直屬火影的暗部他都插不進手，更悲催的是暗部部長還是杜克的養父，水門念及同門情意，除了搖頭苦笑別無他法。水門的性格決定了他是個合格的隊友、合格的老師、合格的父親、合格的護妻狂魔，但他絕對不會是合格的政客。
不過，大蛇丸和自來也相繼離開，卻讓水門看到了一絲轉機。兩名愛徒相繼出走，猿飛日斬一夜之間蒼老了十年，傴僂消瘦的身子骨，臉上甚至出現了老人斑，昔年忍雄的霸氣蕩然無存。
也許是看破了名利，也許是老了喪失雄心壯志，猿飛日斬開始將手裡的權力交替給水門，他盡心盡力做好火影輔助的本分，再也沒有逾越。甚至還幫助水門打壓兩位長老，給水門收回了不少權力。唯有志村團藏，在權力交替的動盪時期，拉攏了不少人馬，權力不降反增。
權力的勾心鬥角，如同鋼絲上跳舞，動輒死無全屍。大蛇丸就是犧牲品之一，看破這些的自來也心灰意冷，隨之離去。就如同當年的旗木朔茂，他們都是權力的犧牲品。
不過，這些和杜克都沒關係，他最近忙著安撫紅豆。大蛇丸叛逃後，木葉最傷心的人裡，必有紅豆一席之地。未滿12歲的紅豆想不通，為何好好的老師，突然就變成了人人喊打的叛忍。在她的小腦袋瓜裡，大蛇丸雖為人陰沉，性格不合群，但難掩其獨特的人格魅力，總的來說是個值得尊敬的忍者，在木葉有很多簇擁。
“大蛇丸老師真的是壞人？”紅豆問向杜克，據她所知，杜克和大蛇丸關係不錯，經常一起沒日沒夜的探討實驗研究，說一些她聽不懂的名詞。
大蛇丸不是壞人……誰是壞人？他就是個變態，以後還會變性！
杜克很想這麼告訴紅豆，但看著紅豆希翼的眼神，話到嘴邊又咽了回去。揉著紅豆的腦袋，昧著良心說道：“可能是誤會，自來也老師不是追他去了嘛！”
大蛇丸東窗事發，跑得歡快，可憐紅豆在木葉不被待見，過得很不開心。就好像鳴人娶妻雛田，在日向家每天受盡白眼。
以她大大咧咧的性格，找不著願意和她說話的人，著實讓她很不自在，嘴巴翹得能掛上油瓶。杜克不得已，每天帶她出任務，全是c級的小任務，就為了哄她開心。當杜克把隊友紅介紹給她後，杜克發現自己白操心了，兩人很快就成了無話不談的閨蜜，然後沒有利用價值的杜克被一腳踢開，和阿斯瑪湊成了一對。
杜克還在懵逼之中，水門就找上了他。權力日重的水門言行舉止之間帶上了幾分威嚴，好在和杜克一起的時候，他還是曾經溫暖貼心的好師兄。水門是以同門師兄的身份來的，他直言挑明，希望杜克加入暗部，將來接手紫霄的職位，輔助他掌管木葉暗部。
現在的暗部部長仍是紫霄，水門對猿飛日斬的放權心有感激，沒有把他一擼到底，讓他去看大門。但被幾個老傢伙折騰這麼久，天然呆的水門久病成醫，明白自己必須要找幾個可靠親信，而他真正信賴的人就那麼幾個，同門的杜克是不二人選。
杜克像拒絕自來也一樣，拒絕了