第三艦隊 司令長官:高橋伊望中將
用以攻佔菲律賓的艦隊
第一六戰隊 重巡/足柄 輕巡/長良、球磨
第一七戰隊 敷設艦/?島、八重山 特設敷設艦/辰宮丸
第五水雷戰隊 輕巡/名取
第五驅逐隊 驅逐艦/朝風、春風、松風、旗風
第二二驅逐隊 驅逐艦/皋月、水無月、文月、長月
第六潛水戰隊 潛水母艦/長鯨
第九潛水隊 潛水艦/伊-123、伊-124
第一三潛水隊 潛水艦/伊-121、伊-122
第一根據地隊 敷設艦/白鷹、蒼鷹 掃海艇、驅潛艇、水雷艇
第二根據地隊 敷設艦/若鷹 掃海艇、驅潛艇、水雷艇
第四艦隊 司令長官:井上成美中將
內南洋防衛用艦隊
旗艦 練習巡/鹿島
第一八戰隊 輕巡/天龍、龍田
第一九戰隊 敷設艦/衝島、海防艦/常盤、津輕
第六水雷戰隊 輕巡/夕張
第二九驅逐隊 驅逐艦/追風、疾風、朝?、夕?
第三?驅逐隊 驅逐艦/睦月、如月、彌生、望月
第七潛水戰隊 潛水母艦/迅鯨
第二六潛水隊 潛水艦/呂-60、呂-61、呂-62
第二七潛水隊 潛水艦/呂-65、呂-66、呂-67
第三三潛水隊 潛水艦/呂-63、呂-64、呂-68
第三根據地隊 掃海艇、驅潛艇
第四根據地隊 掃海艇、驅潛艇
第五根據地隊 掃海艇、驅潛艇
第六根據地隊 掃海艇、驅潛艇
第五艦隊 司令長官:細萱戊子郎中將
北方防衛用艦隊
第二一戰隊 輕巡/多摩、木曾
第二二戰隊 輸送艦/粟田丸、淺香丸
第七根據地隊 掃海艇、驅潛艇
第六艦隊 司令長官:清水光美中將
潛水艦隊
旗艦 練習巡/香取
第一潛水戰隊 特設潛水母艦 靖國丸、伊-9
第一潛水隊 潛水艦/伊-15、伊-16、伊-17
第二潛水隊 潛水艦/伊-18、伊-19、伊-20
第三潛水隊 潛水艦/伊-24、伊-25、伊-26
第二潛水戰隊 特設潛水母艦 さんとす丸、伊-7、伊-10
第七潛水隊 潛水艦/伊-1、伊-2、伊-3
第八潛水隊 潛水艦/伊-4、伊-5、伊-6
第三潛水戰隊 潛水母艦/大鯨、伊-8
第一一潛水隊 潛水艦/伊-74、伊-75
第一二潛水隊 潛水艦/伊-68、伊-69、伊-70
第二?潛水隊 潛水艦/伊-71、伊-72、伊-73
第一航空艦隊 司令長官:南雲忠一中將
空母機動部隊
第一航空戰隊 空母/赤城、加賀
第七驅逐隊 驅逐艦/曙、潮、漣
第二航空戰隊 空母/蒼龍、飛龍
第二三驅逐隊 驅逐艦/菊月、夕月、卯月
第四航空戰隊 空母/龍驤、春日丸
第三驅逐隊 驅逐艦/汐風、帆風
第五航空戰隊 空母/翔鶴、瑞鶴
第?驅逐隊 驅逐艦/朧、秋雲
第十一航空艦隊 司令長官:冢原二四三中將
基地(陸上)航空部隊
第21航空戰隊
第22航空戰隊
第23航空戰隊
驅逐艦峰風、衝風
南遣艦隊 司令長官:小澤治三郎中將
輕巡/香椎 海防艦/佔守
第九根?地隊 掃海艇、驅潛艇
第四潛水戰隊 輕巡洋艦/鬼怒
第一八潛水隊 潛水艦/伊-53、伊-54、伊-55
第十九潛水隊 潛水艦/伊-56、伊-57、伊-58
第二一潛水隊 潛水艦/呂-33、呂-34
第五潛水戰隊 輕巡洋艦/由良
第二八潛水隊 潛水艦/伊-59、伊-60