也有了一點的起色，可問題是施世倫這套法子並沒有得到雲貴總督蔡挺的認可，蔡挺一向是主張強硬政策，以殺戮來震懾當地苗民。
蔡、施二人政見不同，如此一來，問題可就麻煩了，施世倫這頭好不容易安撫了地方，那一頭蔡挺卻不時地發兵攻打那些苗寨，這一打就將施世倫忙乎了半天的成果給打沒了，兩人間關係能好才怪了，若不是施世倫是胤祚保舉之人，蔡挺不敢輕動，否則只怕蔡挺早就上本彈劾施世倫了，雲南七年換了八任巡撫，這裡頭除了一人丁憂，其他的可都是被蔡挺給參倒地。蔡、施二人不和原本也就這麼將就著下去了，可這回攤丁入畝的事兒一起，兩人間的矛盾就徹底地爆發了，起因就是施世倫強硬地在雲南推廣攤丁入畝和官紳一體納糧的事兒。
按李威烈的話來說，雲南的普通百姓乃至熟苗都很是贊同此舉，而此二法也確實減輕了當地百姓地負擔，可當地地富戶卻不幹了，聯成一氣，就是不答應此事，不但明著阻擾丈量田畝的工作，還打傷了不少敢於執行此事地官員、衙役，而手握重兵的蔡挺不但不出面控制局面，反倒將施世倫叫去痛罵了一番，雙方的關係已經惡劣