開局面，金鐘虢不得不下令大軍暫時後撤，回到邊境線附近組織防禦，等待獲得充足的後勤補給後再作打算。
第一次漢城戰役結束，朝軍投入近三十萬兵力，一開始兇猛進攻，差一點攻入漢城，最終卻被迫後撤，一個月左右的時間，朝軍又回到出發點。損失了近四萬名士兵後，沒有獲得任何進展。
戰役結束後劉在世趁機對金鐘虢發難，要求金鐘虢為此次失敗負責，辭去陸軍總司令職務。金鐘虢在軍隊中聲望大跌，李光竹對總司令的位置虎視眈眈，但金鐘虢很快穩定了局勢，他在軍中多年的經營不會因為一次失敗就徹底消失。姜席間和河東訊在第一時間表達了對金鐘虢的支援，大部分中高階軍官還保持著對金鐘虢的敬畏。
眼看無法推翻金鐘虢，劉在世又生一計，邀請華國全面介入朝軍指揮系統，接管戰鬥指揮權和後勤指揮權，這相當於將所有的權利交給華國控制。軍官團呂奉將詳細彙報傳遞給國內後，華國也對朝軍的不配合表示失望，並表示如果朝軍繼續堅持**指揮，華國將減少對朝鮮的物資供應。
在各方面的壓力下，金鐘虢不得不交出朝軍指揮權，保留總司令的職務，在新成立的朝軍指揮部中擔任總指揮，不過真正的指揮工作由軍官團接手，呂奉擔任副指揮，樂非、何廣廈、吳佩孚、孫傳芳等中下級軍官抵達各個軍團，從事實上獲得了朝軍的控制權。
在高層解決內部存在的齷齪時，新的物資補給計劃和作戰計劃也在籌備中。日治時期修建的從平壤到漢城的鐵路在華國工程隊進入朝鮮後，修補速度加快，其中最關鍵的海州到開城一線基本完工。另外五百名朝鮮司機也在這一個月內完成了初步培訓，鐵路和公路同時打通，讓後勤運輸速度猛然加快，海州港堆積如山的物資得以轉運到戰爭前線，士兵們終於可以補充糧食和彈藥，或者換下一雙破破爛爛的軍靴。
平壤北方最關鍵的一條交通通道——丹東到平壤的鐵路也在加緊修建之中，這條不用經過朝鮮山區的鐵路，動員了數十萬名朝鮮勞工，他們在充足的糧食和低廉的工資吸引下，幹勁十足的勞作在鐵路工地上。不過即便如此，鐵路通車也要在1908年底，到時候戰爭很可能已經結束，所以現在主要的後勤運輸通道還是海路。
戰爭時期後勤補給線路往往是一方攻擊的重要節點，不過半島戰爭中雙方都沒有對海州和仁川這兩個關鍵港口動歪腦筋，站在幕後的華美兩國也只是出動戰艦護航，卻沒有對另一方的運輸船隊展開攻擊。有時候雙方偶爾在海面上相遇，還會拉響汽笛互相問候，然後滿載殺人用的物資前往半島。
第二次漢城戰役可以說是華日兩**官和華美兩國後勤能力的較量，第一次戰役如同鬧劇般結束，朝軍指揮部呂奉等人認為，必須要在半島的冬季到來之前結束這場戰爭，一旦進入寒冷的冬季，低溫和大雪會讓戰爭變得更加艱難和殘酷，華國也沒有做好為朝鮮提供一年以上物資支援的準備，那將會拖累華國經濟建設的步伐。
1908年11月3日，準備完畢的朝軍再次主動發動進攻，後勤運輸的通暢和更流暢的指揮體系讓朝軍信心十足，大量野戰通訊裝備、大功率無線電臺等裝備到朝軍。
進攻伊始，朝軍就將主要攻擊目標放在截斷漢城和仁川之間的運輸線上，漢城防禦力量強大，工事堅固，缺乏重火力的朝軍直接進攻漢城必然會承受巨大傷亡。而仁川那裡聚集著大量的美國人和日本人，按照雙方之間不成文的約定，運輸船隊、港口不應成為攻擊的目標，所以呂奉將目標放在了兩城之間的運輸線上。只要截斷運輸線，仁川的物資就無法運到韓軍主力盤踞的漢城。而南部其他大港口離漢城較遠，小港口無法滿足解除安裝需要，漢城以南又沒有成熟的鐵路公路交通系統。
也就是說，如果作戰成功，韓軍將陷入第一次戰役時朝軍面臨的尷尬局面。
韓軍的日本指揮官也看到了交通線的薄弱，將韓軍第三集團軍第九軍全部放置在此處，兵力多達四萬多人，擁有三百五十多門火炮，而且背靠仁川港，不用擔心後勤補給的問題。
李光竹軍團在第一次戰役時損失很大，雖然補充了新兵，但戰鬥力不可避免的下降，因此在此次作戰中負責守護主攻的側翼，防範來自漢城方面韓軍的增援。主攻則由一直休整的河東訊軍團負責，河東訊的部隊之前一直缺少補給，大部分師的裝備不齊，後來運輸通道通暢，大量華國物資得以運送到河東訊軍團手上。
補充了物資的河東訊軍團選擇韓軍第九軍第十七師的防禦陣地進行突破，他手裡有三十輛華