營，直接劃撥給鄭家軍作為軍營，南京錦衣衛裁撤，所有的錦衣衛，一律遣送到京城去安置。
南京六部、都察院以及大理寺、國子監等機構，進行大規模的調整，所有的主官幾乎都進行了調整。
鄭勳睿依舊兼任南京兵部尚書，周延儒出任南京吏部尚書，徐望華出任南京戶部尚書，楊廷樞出任南京禮部尚書，鄭錦宏兼任南京刑部尚書，甘學闊出任南京工部尚書。
文震亨出任都察院左都御史，陳於泰出任國子監祭酒。
梁興力出任大理寺卿。
文坤出任陝西巡撫，趙單羽出任浙江巡撫，李巖出任四川巡撫，徐吉匡出任湖廣巡撫，馬祝葵出任山東巡撫。
曹馳出任漕運總督。
吳偉業出任應天府尹，原應天府尹林宗輝出任南京兵部左侍郎。
熊文燦出任戶部左侍郎。
裁撤應天巡撫、鳳陽巡撫、登萊巡撫等職務，浙江、山東、湖廣、四川、陝西等地，設定一個巡撫，以巡撫為最高長官，統領全省民生事物，巡撫歸南京六部統一管轄，代表南京六部管轄本地的各級官吏，四品以下官吏可酌情調整，報備南京六部，四品以上官員需呈報南京六部批准，方可調整。
各地設定的洪門錢莊以及洪門等機構，全部由南京六部統一管轄，為直屬機構，地方不得干預其正常業務，地方官府對洪門錢莊以及洪門有監督和彈劾之權力，且可以提出來處理之建議，南京六部在安排洪門以及錢莊諸多事情之時，需要徵求各地巡撫、總督和府尹之意見，需要考慮和尊重地方官員之想法。
南直隸各府州縣事物，由南京兵部代為管轄，依舊按照原來的區域劃分，漕運總督代表南京六部負責四府三州諸多事物，應天府代表南京六部負責其他地方事物。
地方官府依舊按照原來之設定，不做大的變動，各府州縣包括巡撫衙門，須單獨設立商貿房，或者商貿司，專管商貿賦稅事宜，獨立於原來的六房之外，商貿房（司）的設立，以州縣為主，加強人員之配置，巡撫衙門和府衙，重點進行商貿賦稅徵收之指導。
各地商貿房（司）之最高負責人，原則上由同知、知州和縣丞兼任。
都察院在南直隸、浙江、山東、陝西、湖廣和四川等地的所有府衙，派遣監督人員，代表都察院監督各級官吏，官吏凡是有貪汙賄賂、欺壓百姓、胡亂作為之行為，都察院派駐人員可隨時蒐集證據，且上報都察院進行懲處。
自崇禎十六年正月初一開始，南直隸、浙江、山東、陝西、湖廣和四川等地，糧食賦稅按照二十抽一的比例徵收，具體徵收辦法另行下達細則，商貿賦稅按照十五抽一的比例徵收，具體徵收辦法另行下達細則，嚴格推行官紳一體納糧之政策，上至王爺，下至尋常百姓，嚴格按照土地多少徵收農業賦稅。
廢除徭役，改為官府以錢糧招募的形式進行，各地不得強行以官府名義徵召百姓做事，凡屬於農田水利改造、運河疏通等工程，一律由官府拿錢僱傭勞力進行。
南直隸、浙江、山東、陝西、湖廣和四川等地各級官吏，全部實施新的俸祿政策，各地略有區別，但總體的俸祿差距不應高於百分之二十，允許各地發放一定數量的福利，但需要呈報南京六部批准。
各級官府務必以民生為主，保證百姓安寧生活，維持地方之穩定。
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所有的調整和要求，都是以南京六部和湘王敕書的形式下達，與之前大明朝廷的規定有了很大的不同。
其中有些關鍵地方，引發了極大的關注，周延儒、楊廷樞、甘學闊、熊文燦和陳於泰等人，居然能夠進入到核心層，這讓很多心存猶豫的官吏吃下了定心丸，只要跟著鄭勳睿踏踏實實做事情，以前是什麼出身是不會計較的。
這些人的任命，讓京城的官吏發生了極大的震動，這都是後話了。
鄭勳睿以南京六部和湘王敕書下達的諸多調整和命令，已經表明了態度，其已經徹底脫離了大明皇上和大明朝廷，按照自身的要求開始做事情了，南直隸等地方，不需要或者說不能夠遵從皇上聖旨和朝廷的敕書，一切以湘王敕書和六部的敕書為準，各級官吏的任命，南京六部與各地的巡撫、總督、府尹負責，且承擔責任。
這等於徹底脫離了大明朝廷。
至於說下一步的行動，只要不是傻子，都是應該明白的。
一直在鄭勳睿身邊，本不想出任官職的徐望華，毫無怨言的接受了任職，且排名在周延儒之後，不過他與周延儒等人，