以及各個支隊都配備佐級軍官負責，對一些重要部門都配備了少將級軍官負責。第七三一部隊分為八個部和四個支隊：
第一部（細菌研究）。菊地少將為部長。下屬有專門從事鼠疫研究的高橋班，從事研究的笠原班，從事細菌媒介……昆蟲研究的田中班，從事凍傷研究的吉村班，從事赤痢研究地江島班，從事脾脫疽研究的太田班，從事霍亂研究的湊班。從事病理研究的崗本班和石川班。從事血清研究的內海班，從事藥理研究的草味班，從事立克次氏體（包括跳蚤）研究的野口班。
第二部（細菌試驗），由太田大佐兼任部長。這個部下設一個分部，專門培育和繁殖供散佈鼠疫菌用地寄生蟲。下屬一個航空班和在安達東三十五里地鞠家窯的特別試驗場。這個部的主要任務是除了用人作細菌試驗之外，還透過八木澤班對植物進行病毒研究和試驗。
第三部（細菌武器製造），由江口中佐任部長。這個部下屬兩個工廠，一個是濾水器製造廠，這是為掩人耳目而設的。另一個是在楊馬架子的瓷彈殼製造廠。專門生產石井式細菌炸彈等細菌武器。
第四部（細菌生產），由川島少將任部長。這個部下設兩個分部，每一分部按照分工獨立地進行各種細菌的生產。
總務部，起初由中留中佐為部長，後由太田大佐兼任。該部是七三一部隊本部的綜合部門。權力很大。它不僅負責整個部隊的財務管理、生產計劃、人事分配，而且更重要的是直接與憲兵隊聯絡和接收作細菌試驗地人。
訓練教育部。起初由園田大佐任部長，後來由西中佐接任部長。這個部專門負責培訓從事細菌研究、生產和使用細菌武器的專業人材。據資料記載，僅少年隊員的培訓就進行了四期。
資料供應部，由大谷少將任部長。這個部負責各種器材、裝置的供應。
診療部，由永山大佐任部長。這個部負責對細菌傳染的預防和日本人地疾病醫療事宜。
“我不去行不？”魏元坤心中暗自嘀咕，這地方也太恐怖了，去了玩不好可就是不得好死，不過…………他這話可沒敢明說。當年這位和王鶴張昕他們還曾經到哪裡旅遊參觀過，裡面研究地什麼東西他也知道個大概…………這個地方，要是一個不小心，弄自己一身梅毒淋病尖銳溼疣那算是撿到，要是感染上一身鼠疫傷寒炭疽病，那可就熱鬧了。但是很明顯，這一次他們三個還是非去不行…………這也是上級調他們來的原因。從日軍內部得到了情報，日軍因為在這一段時間一來遭到了從未有過地慘敗，從上到下都氣急敗壞，因此有情報顯示，他們要對八路軍大規模使用這些生化武器，而經過內部人員偵查，這些武器，尤其是生物武器，就集中在哈爾濱一帶。隨著奉天的被攻克，以及隨後的猛烈進攻，日軍在東北的部隊已經被攔腰截斷，由於八路軍進展迅速，很大一部分部隊都沒能來得及撤退到朝鮮，而731部隊就是日軍被堵在吉林黑龍江的日軍部隊之一。
這一情報得到了延安方面的極度重視，共產黨的領導層從穿越者地口中也都知道了，這些生化武器遺留在中國，對中國的未來造成了多麼大的貽害，這個東西要是全撒出來。那對整個八路軍乃至於整個中國的傷害那都是小不了。根據估計，如果要是防護不當，那死的人可就要不計其數了，因此中央下定決心，不惜一切代價，也要消滅摧毀日軍的細菌戰部隊。
但是很顯然，時間非常的倉促。沒有長時間的準備，任務成功與否也就成了未知數，為了增加成功的機率，自然要使出殺手鐧…………或許，憑藉著穿越者的大能，能夠保證摧毀這個巨大地威脅。但是接著問題也來了，雖然穿越者這東西在延安藏著好幾十個。但是很明顯。能用得上的沒有幾個…………一來這些人沒有幾個是研究軍事會打仗的，二一來，對731部隊有詳細瞭解的人也不多，細想一想，只有魏元坤他們三個比較合適，一來有戰鬥經驗，二一來曾經也去過731部隊的遺址，對那裡也應該有了解，三一來。當然這不是最主要的，三個傢伙目前在軍中也算是小有名氣，這麼多大仗下來，幾個人連個像樣的傷都沒受過，很顯然。人品也過得去。而且所有人都相信。這三位，對國家對人民對黨都是無限地忠誠。肯定能執行好這個任務。
於是，在來自於延安的最高指示之下，幾個人就被一紙命令連夜調到了奉天，在分配了命令之後，和500名八路軍的精銳…………剛剛集訓完成的八路軍傘兵獨立營一同踏上飛往哈爾濱的飛機。
“對了，我們幾個不會跳傘啊！”在上飛機之前，魏元坤喊道，