貴州、印州和阿州境內，山林或荒蕪之處還藏有不少成建制的敗軍，當初無暇剿滅，這些敗軍也知道漢卒厲害，根本沒有膽子與漢卒正面為敵。大量漢人平民遷來以後，敗軍成為地方隱患，近一段時間，各營漢軍和建設兵團，集中精力剿殺敗軍，肅清地方治安。在歸附部落協助下，各地肅清任務進展順利，捷報頻傳，敗軍主力幾乎全部剿除，只有少數潰兵逃亡山林之中，已不足以給漢人村落造成威脅。
貴州、阿州皆屬西部元帥府轄區，參與肅清的兵馬分為三類，一是隸屬元帥府直轄的野戰軍團，如關羽直轄的徵虜營、趙雲統領的追風營、馬超統領的攻堅營、徐晃統領的護北胡營、姜維統領的山地營、周瑜統領的南洋營等，這些部隊皆是大齊正規序列野戰營，裝備齊整，士兵皆是百戰老卒，戰鬥力十分強大。二是兩州兵曹管理的軍團，田疇統領的貴州軍團、夏侯淵統領的阿州軍團以及境內的建設兵團，除了夏侯淵部原是正規野戰部隊，貴州軍團和建設兵團組建時間不長，但將校皆是漢人老卒，軍紀嚴明，令行禁止，戰鬥力也不容小視。三是拔那族、律衍族、月城族、克族等很早依附漢軍的部落，按照人口比例，徵發隨軍的兵馬伕役，這些部落人馬裝備落後，不通戰陣，自由散漫，只能用為輔兵。
此時肅清地方，僅動用的附從異族人馬數量就多達十萬之眾，在指揮協同上有很大難度，但因西部元帥府準備工作充分，派遣老卒到異族人中擔任軍官，一邊執行任務一邊訓練兵馬，效果雖不盡如人意，但至少未拖後腿。
因為西部元帥府新建，軍團之間相互比較陌生，透過此次肅清地方，磨合各軍團各兵種，找出不足之處加以改進。這次肅清成績不錯，不像軍事行動，更似軍事演練，基本完成了行動前制訂的各項任務。
麥加城中，一名將領帶著部分校尉，正在送別即將歸鄉的將士。這些將士分為數類，或是超過服役年齡，或是因傷退伍，或是水土不服，或因為思鄉情重申請回鄉。此次退役的上千名將士，大半人選擇留在本州，他們依照軍功，將得到豐厚的封賜和土地，部分士兵退役以後，將在本地官府民兵司或賊曹衙門任職。
肅清過程中，一些潰兵對周圍漢人村鎮或異族部落發起進攻，但是規模很小，並未造成太大的損失。由於外部戰事結束，內州十分安定，這次行動整合了西部元帥府絕大部分資源，其間雖然有些波折，但是效果十分顯著。
忠於波斯薩珊散落在阿州境內的潰兵，在四國和議之後皆被召回國內，隱藏在荒蕪之地訊息閉塞的部分潰兵次第被尋找出來，通告之後依然敵對者皆不赫，生俘者皆貶為奴隸。
忠於貴霜王室的地下勢力此次被連根拔起，除了潰兵，窩藏者、知情不報者皆被扣上謀逆的大帽子，貴州境內受到牽連的異族部落多達二十餘個，除了軍屬之外，餘者皆貶為奴，被販賣到內州。
往西攻找紅海東岸區域的軍隊，奉行速戰速決之策，所有敵對勢力皆被迅速清空。敵對部落和城鎮受到致命打擊，短短月餘時間，佔領區南至大海，西至蘇伊士地區，羅馬新建的紅海行省區域基本被大齊佔據。
羅馬朝堂接到訊息，對於是否因此與大齊開戰形成兩派：一派認為大齊侵略紅海行省，嚴重侵犯了大羅馬帝國的利益和尊嚴，不戰會使名譽掃地；另一派認為紅海地區本非羅馬本土，是波斯薩珊的傳統勢力範圍，城邦、部落大多依附波斯薩珊，大齊兵馬佔領波斯薩珊南部地區，兼併這些附庸城邦和部落是順其自然。
兩派爭論的焦點從是否佔據大義，拓展到兩國實力對比，當一系列數字擺在羅馬帝國君臣眼前之時，眾臣集體失聲，與大齊帝國相比，羅馬帝國無論是人口、財富、裝備、兵力皆明顯落於下風，這給不可一世的羅馬人當頭一棒，羅馬皇帝也在朝堂上說，與大齊交戰羅馬或會失敗。
因為大齊異族政策十分強硬，順從者也要聽從大齊徵召，成為沒有自主權的附庸，敵對者下場只有一個，就是族滅人亡。在大齊兵威之下，中東範圍內的許多地方勢力，已經失去與大齊為敵的勇氣，許多百姓對城主或首領失去信心，開始向羅馬境內逃亡。
大齊軍隊早在要道上設立軍卡，一是徵收商稅，二是隔絕羅馬與境內部落、城邦的聯絡，三是抓捕逃亡的潰兵。逃亡百姓沒等進入羅馬境內，大半做了大齊俘虜，企圖反抗者則淪為刀下之鬼。
趙雲、馬超兩將主持中東之戰，獲得了足夠的戰功，部下也繳獲價值不菲的戰利品，但是並未讓他們停下腳步，兩將從南往北、從東到西，漸次攻打城邦與部落