著詰�糶プ嘔髦辛恕案皇可健焙諾姆汕牛�2名薩摩軍官和1名水手被當場打死，上村彥之丞和大副蒼野則萬分僥倖的毫髮無損。
兩艘薩摩軍艦繼續向政府軍艦隊的方向靠近，不斷的實施炮擊，一艘接一艘的小輪船被擊沉，政府軍官兵們計程車氣開始崩潰了。一些小輪船試圖退往海岸炮臺一帶避險，“一些小輪船因它們的排水量輕微，正好又趕上了順風，得以脫離戰鬥。駛回岸邊，但它們有的側面受了重傷，當它們急速逃走時，不少船隻擱淺在了海岸邊，後來也都被薩摩人用火炮擊毀。”
停泊在東京島岸邊的民用船隻因為根本沒有武裝，也毫無懸念地倒在了薩摩軍艦的炮口下。這些民用船隻上的大量水手事前已逃離登岸，才避免了重大傷亡。“至於那些停泊在堤岸的運輸船和商船，船員全部都逃掉了。薩摩人的炮火毀掉了其中的大部分，只有少量船隻倖免。”
儘管政府軍艦隊遭到了毀滅性的打擊，但很多英勇的官兵一直堅持戰鬥，根據當時觀戰的外國商船上的人們的一些記述，政府軍官兵最後堅持作戰的場面極其慘烈。
“一艘飄揚著日本帝國國旗的日本海軍的小輪船被薩摩人的炮彈擊中了，開始下沉，但指揮它的軍官還在努力堅持作戰，向敵人開炮射擊，看到一些膽小的水兵準備跳水逃生，這位軍官憤怒地拔出佩刀劈砍，最後這艘船沉沒了，這位英勇的軍官也掉進了大海里，……一陣炮聲過後，水面上只剩下了片片木板，和滿海的血紅……”
“戰鬥結束了，海面上到處是漂浮的屍體和待救的落水者，經過的中立國軍艦和船隻，立刻放下舢舨，不管是日本軍人還是平民百姓，均極力搭救，但殺紅了眼的薩摩軍艦，此時卻沒有一絲一毫紳士的表現，兩艘薩摩軍艦不斷傳出步槍射擊的聲音，他們在殘酷地屠殺海水中的政府軍官兵，……海面上滿是木塊、折斷的桅和帆船的碎片，攀援在這些漂流破物上的是那些想法活命的可憐的帝國士兵們，他們的頭部浮出水面，像些小黑點。薩摩軍艦上的水兵自開戰以來即表現出了他們的野蠻和兇殘，現在因戰鬥過於興奮，要阻止他們對這些在水上漂流的黑點用槍射擊，是非常困難的事。”
在全殲了政府軍的護岸艦隊之後，上村彥之丞隨即下令進攻政府軍海岸部隊的炮臺，隨著薩摩軍艦的射擊，山本權兵衛事前佈署埋設在附近的地雷，被薩摩軍艦的射擊引爆，產生了劇烈爆炸。這其實就是英國公使威利斯和參贊薩道義在公使館看到的那場劇烈的爆炸。
薩摩軍艦在引爆了地雷後，隨即開始攻擊附近的政府軍炮臺。
海面上的戰鬥打響後，政府軍各炮臺上的炮兵都嚴陣以待。見到薩摩軍艦來攻，都立即開炮應戰，步兵都嚴守在事前挖掘的戰壕中待命。薩摩軍艦開始炮擊時，步兵依舊隱蔽不發，只有炮兵在不屈不撓的進行還擊。但因為火力薄弱，在激戰多時之後，兩處主炮臺都被擊毀，炮臺內的一處彈藥庫也被擊中。發生劇烈爆炸。但當薩摩軍艦的炮火稍一停歇，政府軍步兵的克虜伯行營炮也開始聚焦“富士山”號發起猛烈炮擊，包括上村彥之丞的大副蒼野在內的多名薩摩海軍官兵被擊傷。經過近一個小時的交火，這座英勇的炮臺最後也被薩摩軍艦炮火壓制，火炮被摧毀。海面和海岸的炮聲最終沉寂下來。
“他們的炮臺都被摧毀了。長官。”
一位軍官看著滿是濃煙的海面和海岸，對上村彥之丞說道。
“好！現在開始炮擊城區！”上村彥之丞放下了望遠鏡，大聲的說道。
“您說什麼？”聽了上村彥之丞的命令，軍官不由得大吃一驚。
“我說了，炮擊城區！”上村彥之丞轉過頭，臉上滿是猙獰之色，一雙眼睛放射出兇狠的光芒，此時看去，已然不是人的模樣。
軍官猶豫了一下，還是服從了上村彥之丞的命令。下令升起“炮擊城區”的訊號旗。
很快，兩艘薩摩軍艦便開始了向岸上城市居民區的炮擊。
“薩摩人這是在做什麼？難道他們瘋了麼？”
在乾國巡洋艦“鏡清”號上，管帶呂文經看到薩摩艦隊竟然開始向東京居民區開始了炮擊，不由得極是吃驚。
“大人，我認為我們應該採取行動阻止他們的野蠻行為。”大副鄭元森說道，“不管是在什麼戰爭中，攻擊和屠殺平民，都是難以原諒的罪行。我大乾水師，為保護僑民來此，為我大乾僑民安危計。必須阻止他們。”
“問問法國人，要不要和我們一起採取行動？”呂文經點了點頭，看了看不遠處的法國炮艦