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三科必修的公共課程則是《素問》、《難經》、《諸病源候論》、《補註本草》、《千金要方》。
在針灸教學中採用王惟一發明鑄造的針灸銅人，進行直觀教學，也是歷代醫學教育的一大創舉。
考試訪大學之法，建立了嚴格的制度。每月一次私試，每年一次公試。成績分為優、平、否三等。優良者升為內舍，每年一次會試，及格者升為上舍。還根據學生的品德和技術水平，將上舍分為上、中、下三等。學生在學期間為使理論與實踐緊密結合，除課業學習外，還要參加臨診，輪流為太學、律學、武學的學生及各營將士治病，年終根據每個學生的臨床記錄考察其成績，按療效高低分為上、中、下三等，其失誤多者，酌量輕重給予處罰，嚴重者勒令退學。
元豐改制後，太醫局隸太常禮部，學生限額300人，設大方脈（120）人、風科（80）人、小方脈（20）人、眼科〔20）人、瘡腫兼折傷（20人）、產科（10人）、口齒兼咽喉科（10人）、針灸科（10人）、金鏃兼書禁科〔10人），神宗死後，王安石新法天折，醫學教育一度實行的“三舍升試法”也被廢止。
崇寧二年（1103）微宗詔令另在國子監設立“醫學”，吸收儒生學醫，造就有文化素養的醫學人才，以改變醫學的社會地位，醫學教育恢復“三舍升試法”。由於徽宗的倡導，當時五運六氣之說盛行。運氣也成為學習重點之一，列為各科必試科目。
公試合格後，選取醫療技術精良者充當藥局醫師以下職務，其餘各以其等第補官，或派為本學博士、正錄，或委為外州醫學教授。
（二）地方醫學教育
宋代地方醫學教育也較發達和普及，嘉祐六年（1061），各道、州、府仿照太醫局的教學方式，設立地方醫學，吸收本地學生習醫，選官管�