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小智在小霞的陪伴下，度過了躺在醫院的一個星期。
“啊！！！復活了！！”
“皮卡————皮卡————”
小智和站在他肩膀上的皮卡丘在三洋市的醫院門口前大聲呼喊，後面的小霞受不了小智，拉了拉小智的手。
小智呵呵一笑，順勢反抓住小霞的手，緊緊的握住。
“走吧，小霞。”
小智緊緊握住小霞柔軟的小手，面不改色的牽著小霞的手向前走去。現在的小霞已經漸漸習慣，倒是沒有像開始的時候，羞得滿臉通紅。
“喂喂，我說你們，不要把我們忘了啊。”
跟在小智和小霞後面的就是小智初到伊修地區認識的夥伴，真林和愛麗絲，以及三洋道館身穿侍應服的綠髮丹特。
丹特在輸給小智後，心有不甘，可是卻無可奈何。第二天的真林再次跑到三洋道館發起道館挑戰賽，憋屈的丹特毫不客氣地虐起真林。在困難艱苦的戰鬥下，真林憑著他的毅力和決心，苦戰了許久後，終於勉強擊敗了丹特。當然真林不是和三個道館的館主進行道館挑戰賽，他又不是像小智那樣的名人和變態，一個就夠他和一壺了。
而丹特再一次戰敗後，感到了自己的不足，於是向真林詢問，自己可不可以和他們一起旅行，當然，丹特事後才知道真林是和小智一起的，但這並沒有打消他一起旅行的念頭，反而鬥志更加昂揚。
“啊？你們還在啊，不要打攪我們的二人世界啊。”
小智拉了拉頭上紅色的帽簷，擺出一副你們十分不識時務的樣子。
“可惡，不要在我面前顯擺啊。”真林“切”了一聲，小聲嘀咕著，然後轉過頭望向愛麗絲。他與愛麗絲的發展還是保持原樣，沒有絲毫髮展。
“你說什麼？”明顯小智已經聽清楚她說什麼了，漆黑的雙眼帶著戲虐看著真林。
真林頓時嚇了一跳，我靠，我這麼小聲你也能聽到？！小智你真是個變態！！真林不斷地在心裡腹誹著小智，臉上則擺出一副嚴肅的樣子。
“小智，什麼時候和我對戰啊！”
小智一聽，現在哪有時間陪你啊，沒看我現在很忙嗎。小智拉著小霞的手走進了一家飾品店，然後從飾品店內穿出了小智清脆的聲音。
“沒看我現在很忙嗎！！”
真林霎時恨得牙癢癢，你這是在顯擺嗎，小智！！！
不提真林有多鬱悶，身後的丹特不由笑了出來。感覺丟了臉面的真林在飾品店外大呼小叫，然後被身後的愛麗絲一記愛麗絲鐵拳狠狠一拳，砸在了馬路上的水泥地面上。
此時，隔著小智所在數條街道上的街道，火箭隊的小次郎、武藏和喵喵怪，身穿一身黑色特務服裝，戴著漆黑的墨鏡，頭上是圓圓的黑帽。難道就沒有警察攔一下它們盤問一下嗎？
三人大搖大擺地走在街道上，討論著關於上頭的命令。
“到達三洋市後，馬上與總部聯絡，上面是這樣說的吧。”武藏
“沒錯，在規定的時間到規定的地點聯絡。”走在兩人中間微前，猶如三人之中的老大一般的喵喵怪點了點頭。然後三人來到一個昏暗小巷的轉了進去，接著迅速的跑了起來。
三人來到位於昏暗小巷中間的地下水道的井蓋旁停了下來。
“好，按時到達了。”小次郎看了一下右手手腕處的手錶，向著另外兩人點了點頭。
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另外一方面，曾經散播神奇寶貝自由主義的等離子團，同時迅速的行動著。
“這次，我們的目的地是郊外的夢之遺蹟，清楚這次的任務了嗎！”
身為等離子團的七賢者之一的哥吉斯，對著身前的身微藍制服，頭上戴著制服上的藍色連衣帽，十幾個等離子團的隊員。
三洋市某處下水道中
黑暗的下水道中，手提電腦上散發的微光映照著小次郎、武藏和喵喵怪的臉龐，顯出詭異的白，三人圍坐在手提電腦旁。
“夢之遺蹟嗎？”小次郎的聲音在黑暗的下水道中響起，臉上微微露出疑惑之色。緊接著坂木的聲音從手提電腦內的喇叭響了起來，一如既往讓人感到梟雄的味道。
“沒錯，曾經在三洋市的大規模的研究所的遺蹟。聽說在那裡進行過未來能源的研究。”
“未來研究？？？”武藏、小次郎、喵喵怪
“根據絕密情報