如果不殺你，必定會成為後患！”於是命令左右侍從將於吉斬首。
張昭勸諫說：“於道人在江東數十年，並沒有犯過任何過錯，不應該殺害。”孫策說：“這種妖人，我殺他和屠豬狗有什麼區別！”眾官都苦苦相勸，陳震也出面相勸。但孫策的怒氣仍未平息，命令先將於吉囚禁在獄中。眾官都散去後，陳震回到驛館安歇。
孫策回到府中，早有內侍將此事傳說給孫策的母親吳太夫人知道。夫人叫來孫策，進入後堂對他說：“我聽說你要把一個神仙下獄。這個人曾經醫治過許多人的疾病，受到軍民的敬仰，不應該加害於他。”孫策說：“這是個妖人，能用妖術迷惑眾人，不能不除！”夫人再三勸解無果。孫策說：“母親不要聽信外人的妄言，我自有分寸。”
於是孫策出去叫來獄吏，要提審于吉。原來獄吏們都敬信于吉，在獄中時都除去了他的枷鎖。等到孫策提審時，才又給他帶上枷鎖帶出來。孫策得知此事後大怒，痛責了獄吏一頓，仍然將於吉用刑具拘禁在獄中。
張昭等數十人聯名上書請求孫策釋放于吉。孫策說：“你們都是讀書人，怎麼不明白事理？以前交州刺史張津聽信邪教，結果被敵軍所殺。這種事情毫無益處，只是你們自己還沒有醒悟罷了。我要殺于吉正是為了禁絕邪教、覺悟迷途之人。”
呂範說：“我一向知道於道人能祈風禱雨。現在天氣大旱為何不讓他祈雨來贖罪呢？”孫策說：“那我就看看這個妖人能如何。”於是命令從獄中取出于吉解開了他的枷鎖命令他登壇求雨。
于吉領命後即沐浴更衣取繩自縛在烈日之中。百姓觀看的人填街塞巷。于吉對眾人說：“我求三尺甘霖以救萬民但我終不免一死。”眾人說：“如果有靈驗主公必然會敬重你。”于吉說：“氣數至此恐怕不能逃脫了。”
不久孫策親自來到祭壇中下令：“如果午時沒有雨就焚死於吉。”先讓人堆積乾柴伺候。將到午時狂風驟起風過處四下陰雲漸合。孫策說：“時間已經到了午時空有陰雲而無甘雨正是妖人！”喝令左右將於吉扛上柴堆四下舉火火焰隨風而起。忽然看見一道黑煙衝上空中一聲響亮雷電齊發大雨如注。頃刻之間街市成河溪澗都滿了足有三尺深的甘雨。
于吉仰臥在柴堆之上大喝一聲雲收雨住又見到了太陽。於是眾官及百姓共將於吉扶下柴堆解去繩索再三拜謝。孫策看見官民都跪拜在水中不顧衣服於是勃然大怒喝道：“晴雨是天地的定數妖人只是偶然乘便你們為何要如此惑亂！”他拔出寶劍命令左右迅速斬了于吉。眾官極力相勸孫策發怒說：“你們都想跟從於吉造反嗎！”眾官才不敢再說什麼。孫策喝令武士將於吉一刀斬首落地只見一道青氣投向東北去了。孫策命令將於吉的屍體在市集示眾以正其妖妄之罪。
當晚風雨交加，到了第二天早晨，人們發現于吉的屍體不見了。守屍的軍士報告給孫策，孫策大怒，想要殺掉守屍的軍士。突然，他看見一個人從堂前慢慢地走來，一看，竟然是于吉。孫策大怒，正要拔劍砍他，卻忽然昏倒在地。左右的人急忙將他救入臥室，過了好一會兒他才甦醒過來。
吳太夫人來看望他，對他說：“我的兒子，你錯殺了神仙，所以才招來了這場禍患。”孫策笑著說：“我自幼隨父親出征，殺人如麻，何曾因為殺人而招來過禍患？現在殺了這個妖人，正是為了消除大禍，他怎麼能反而成為我的禍患呢？”夫人說：“因為你不信，所以才會有這樣的事情發生。現在你可以做些好事來祈求消災解厄。”孫策說：“我的命在天，妖人決不能成為我的禍患，何必去祈求什麼呢？”夫人見他勸說無效，就暗地裡命令左右的人去做好事來消災解厄。
當晚二更時分，孫策躺在內宅，忽然陰風驟起，燈滅了又亮。在燈影之下，他看見於吉站在床前。孫策大喝道：“我平生髮誓要誅殺妖邪，以安定天下！你既然是陰鬼，怎麼敢靠近我！”他取過床頭的劍扔向于吉，于吉卻忽然不見了。吳太夫人聽說後，更加憂愁悶悶不樂。孫策於是強撐著病體行動，以寬慰母親的心。
母親對他說：“聖人云：‘鬼神之為德，其盛矣乎！’又云：‘禱爾於上下神只。’鬼神的事情，不可不信。你錯殺了於先生，難道就沒有報應嗎？我已經讓人在郡中的玉清觀內設壇祭禱，你可以親自前去拜禱，自然就能安妥了。”孫策不敢違抗母親的命令，只得勉強乘轎前往玉清觀。道士將他接入觀內，請他焚香。孫策焚了香卻不謝神。忽然香爐中的煙起而不散，結成一座華蓋的形狀，上面端坐著于吉。孫策大怒，唾罵他；離開殿宇時，又看見於吉立在