大臣建議，把建文朝的事蹟附錄於《太祖實錄》後面，朱棣略一思忖，便也允了。
隨後，朱棣又宣佈重開太祖時候的華益殿、武英殿、文淵閣、東閣大學士，以備顧問，命侍讀解縉、修撰楊榮入閣，這兩位閣臣的品秩官位雖在六部之下，且不設官屬、不轄諸司事務，卻是真正的天子近臣，當朱棣透露至少還要選用四至五人，以補充內閣的時候，百官都興奮起來。
編修《太祖實錄》的幾位大臣，無一例外，全部是建文舊臣，這兩位入閣的大臣也無一例外都是建文舊臣，這些人受到信賴和重用，給惶惶不可終日的滿朝文武打了一針強心劑，這幾天陳瑛和紀綱抓人抓得風風火火，以致人人自危，很多人都擔心出現洪武年間那種株連無數、綿延數年的政治災難。
而朱棣的這個政治訊號，顯然喻示著清洗將要終止了，百官都暗暗鬆了口氣。而入閣的兩位大臣都是有真才實學且年紀輕、資歷淺的官員，這樣唯才是舉，也令得許多自恃才學的官員產生了熱切的希望，暗暗摩拳擦掌，想要爭取入閣。
朱棣顯然不只擅長打仗，而且是個懂得四兩撥千斤的政治高手，透過這樣兩件事，他不但很容易地就左右了朝廷下一步的動向，轉移了大眾的視線，而且很容易地就調動了人心。這才是治大國若烹小鮮的上乘手段。
隨後，朱棣又令戶部核查山西各地沒有田地的民戶數量，分批遷徙北平。北平府因為四年的戰亂人口急劇減少，朱棣入主金陵後又把他的軍隊都帶到了南方，北平地方的勞動力更加減少，現在北平府已升格為北京，是僅次於金陵和中都鳳陽的所在，政策上自然要傾斜一些。
朱棣下旨，山西無田農戶遷徙北京，要按戶給鈔，以購買耕牛、糧種和農具，遷徙百姓頭五年免稅賦，五年後開始徵稅，同時從南直隸、蘇州等十郡、浙江等九省中挑選一批富戶到北京城，此外還制訂了罪囚謫佃條例，發流罪以下的囚犯開墾北京農田。
監督地方官員安置遷徙百姓、發放安置費用，監督各省官員挑選富戶遷徙北京，流謫罪囚到北京開荒，這一系事情自然是都察院的責任，陳瑛察覺皇帝有停止清洗，抓緊建設的意思，本來正擔心自己剛剛風光沒有兩天又得靠邊站，一聽皇上吩咐，這才放下心來。
至於紀綱卻是毫不擔心的，透過清洗，他已經初步為自己樹立了權威，接下來應該是鞏固階段。再說，因為景清刺駕的事情，皇上雖然對建文舊臣大力簡拔，以籠絡人心為己所用，對他們的忠心卻也大大地產生了疑慮，已經吩咐他錦衣衛要加強對百官的監察。
只憑這一道命令，他就成了懸在百官頭上的一把刀，誰敢把他紀綱如建文朝的羅克敵一般不放在眼裡？
溯本求源，最感激景清的，大概就是陳瑛和紀綱了。
只這三件大事頒佈、討論下來，早朝的時間就差不多了，臨近中午，要退朝的時候，朱棣笑顏一收，突又肅然道：“朕今天，有幾句推心置腹的話，要對靖難功臣們講！”
殿上登時一靜，文武百官都豎起了耳朵，尤其是北平系的功臣們，在朝堂上他們一向比建文舊臣散漫，這時一怔之下，也慢慢嚴肅起來，一時殿上鴉雀無聲。
朱棣沉聲道：“過去，以武功開創天下的君主，必然倚賴將臣的輔弼。可是，到後來往往難以保全將臣，為什麼呢？常有人說，這是帝王們狡兔死、走狗烹，屠戮權重功臣，以安宗室江山。真是這樣嗎？皇帝養功臣而弱其權柄的方法多得是，非得用殺戮的手段留萬載罵名嗎？”
朱棣的目光緩緩掃視群臣，北平系官員都有些忐忑起來。
朱棣道：“可曾有人查過，那些難以保全的將臣們，是否驕縱枉法、是否恃寵而驕呢？君主代天應物，一旦坐了江山，就不只是功臣們的君主，他是整個天下的君主，普天之下都是君主的子民，不能有所偏倚。
所以功臣犯法，一樣要依法嚴懲。我洪武高皇帝立法垂憲，目的是讓後世之人恪守不懈。倘若諸位功臣有違犯憲法，而且罰戒不悟者，自然也要按律誅殺。即使是至親至舊，也不得寬宥！
朕這幾天聽到不少訊息，我靖難功臣們恃功自傲、欺辱朝中舊臣者有之；驟登高位，貪慾滋生，嫌朕賜建的府邸太小，而侵佔民居違法擴建者有之；收受遭罷黜的犯官賄賂，為之上下打點、偷機鑽營者有之；結黨營私、籠絡朝臣者有之……”
能征慣戰的良將功臣，卻不代表個人品性高潔到了沒有瑕疵的地步，朱棣這番話，每一句都有所指，被他點到了有類似行為的北平系官員無不覺得心中凜凜，