參謀軍官策劃好作戰行動。他當然不會放棄在中太平洋上地反擊行動，而第一個反擊重點就是中途島。
當時，第一特混艦隊還沒有離開中途島海域，因此美軍的反擊行動是針對第一特混艦隊制訂的，計劃的核心部分是由斯普魯恩斯親自完成的。斯普魯恩斯很清楚第一特混艦隊的戰鬥力，就算在其他條件基本上持平的情況下，斯普魯恩斯都認為，他必須要有兵力上的優勢才有把握殲滅第一特混艦隊。結果，在向尼米茲提出了兵力要求之後，他得到了一支規模龐大的艦隊。
隨後，第二特混艦隊前來調換了第一特混艦隊，這一情報也立即被送到了尼米茲的手裡。第二特混艦隊當時只是雙航母艦隊，可尼米茲沒有減少留下來的兵力，不管尼米茲是怎麼想的，他需要的是一次迅速的勝利，而不是一次在付出慘痛代價之後獲得的勝利，因此留下足夠的兵力是完全有必要的。
當時，尼米茲留給斯普魯恩斯的戰艦一共有四十五艘，其中六艘航母，三艘大型巡洋艦，十二艘巡洋艦，二十四艘驅逐艦。這些戰艦被編成了兩個特混艦隊，其中第51特混艦隊有三艘艦隊航母，三艘大型巡洋艦，六艘巡洋艦，十二艘驅逐艦。第52特混艦隊有三艘小型航母，六艘巡洋艦，十二艘驅逐艦。這兩支艦隊的規模都非常的龐大。斯普魯恩斯獲得了他所需要的兵力，也獲得了他去戰勝對手的兵力。
換句話說，當時派遣到西南太平洋上去的美軍艦隊航母就只有三艘，另外還有六艘小型航母，七艘戰列艦，三艘大型巡洋艦，十六艘巡洋艦，三十三艘驅逐艦。為了達到迷惑對手的目的，也為了達到孤立第一特混艦隊（後來是第二特混艦隊）的目的，美軍採用了很多偽裝，以及欺騙手段。
其中，三艘艦隊航母左右兩舷上的舷號都是不一樣的，艦島上左右兩側的舷號也是不一樣的。結果，唐帝國潛艇拍下的照片上就出現了六艘航母的舷號，而實際上只有三艘航母！另外三艘小型航母被偽裝成了萬噸級補給船，因此唐帝國一直判斷美軍只有三艘小型航母去了西南太平洋。留在中太平洋的是六艘小型航母。其他方面地偽裝與欺騙也非常多，比如故意暴露艦隊的行蹤。
當時，率領艦隊南下的是米切爾少將。他是美國海軍新提拔起來地航母特混艦隊司令官。在出發時，尼米茲就向他重點交代了一點。那就是透過兩片唐帝國潛艇重點活動的區域，但是不要過於接近唐帝國巡邏機地搜尋範圍。尼米茲的目的就是要唐帝國的潛艇發現艦隊，而唐帝國的偵察機卻不能發現艦隊。這樣一來，虛虛實實，真真假假。就讓唐帝國地情報部門無法準確的判斷出艦隊的規模了。
尼米茲的這個目的是達到了的，至少這讓唐帝國的情報系統多次相信了美軍主力艦隊正在快速南下，而且其中有大量的主力艦。同時，在中太平洋這邊，尼米茲一直讓三艘小型航母在夏威夷群島海域活動，而斯普魯恩斯指揮的第51特混艦隊在跟隨米切爾的艦隊離開珍珠港之後，並沒有南下，而是向東航行，繞到了夏威夷群島地東北面海域，在唐帝國潛艇幾乎不會出現的海域巡邏待機。
在這套計劃中。不得不提到麥克阿瑟的作用。
美國總統在暗地裡向尼米茲許諾之後，又與麥克阿瑟取得了聯絡，明確了太平洋戰場上陸海兩軍地指揮許可權。麥克阿瑟是太平洋戰場陸軍總司令。可以統轄指揮所有的陸軍部隊（美軍大部分的岸基航空兵都屬於陸軍指揮，只有少部分屬於海軍陸戰隊指揮，美國海軍航空兵指揮的只有艦隊航空兵），而海軍（陸戰隊在平時不屬於海軍編制。而在戰時則由海軍指揮）地指揮權是在尼米茲手上。另外，總統還明確的告訴了麥克阿瑟，西南太平洋戰區的反擊將是很艱鉅的任務，如果能夠在此期間在中太平洋上取得一定的成果的話，那麼對西南太平洋戰區的反擊是有很大幫助的。
隨後，麥克阿瑟就與尼米茲取得了聯絡。雖然兩人有很大的矛盾，但是在這個關鍵時刻，兩名上將都很清楚一點，不管是中太平洋，還是西南太平洋，哪個方向的失敗都將最終導致整個太平洋戰爭的失敗，這次反擊是隻能勝，不能敗的，而獲勝的唯一辦法就是通力合作，而不是相互扯後腿。
明確了這一點之後，麥克阿瑟就保證將首先在西南太平洋上牽制住唐帝國的主力部隊，甚至可以提前發動登陸索羅門群島的反擊行動，讓唐軍無暇顧及中太平洋戰場。而尼米茲也保證，在完成了中途島的反擊之後，他將立即出兵攻佔威克島，先掃蕩馬紹爾群島，吉爾伯特群島，完成打通前往西南太平洋航線的任務，從側翼威脅到索羅門群島，將兩