8月18日，廬山會議結束後的第二天。
北京。軍委第一次大會，人數不多。第二次大會在懷仁堂召開，到會者有兩千多人。
彭德懷和黃克誠一起被批判。對中央決議，他們只能認帳。對許多“揭批”的不實之辭，彭德懷和黃克誠都進行答辯。
會場顯得很亂，開不下去了。於是，會議主持者決定把彭德懷和黃克誠分成兩個會場批鬥。
批鬥黃克誠的會場設在紫光閣。
會議調整了對策，集中了所有和黃克誠關係多的人，要他們揭發批判。
為了避免包庇“反黨分子”之嫌，許多人都得表現一下，於是，這個說黃克誠是“怕死鬼”，那個說他是“殺人犯”。
對此，黃克誠能夠理解。他明白，除非個別人另有個人目的，大多數人是迫於形勢不得不如此。
忽然，吳法憲提出了所謂黃金問題：“黃克誠曾經貪汙大量黃金！”
這樣一來，會場上像爆炸了一顆炸彈，一片譁然。
黃克誠一向被人認為清正廉潔，這回一下子似乎成了大貪汙犯。
原來，所謂的黃金問題，是指新四軍三師奉令從蘇北開往東北時所帶的一部分經費。
當時，數萬大軍遠征東北，當然得帶許多錢。但是，當地的抗幣只能在本地使用，離開根據地就成為廢紙。於是，大軍出發前，除換了些法幣外，還設法換了一部分黃金，以備緊急情況之用。
由於用得節省，一直到東北根據地建立，部隊改編，師部所帶的黃金還有剩餘。黃克誠徵得組織同意後，將這一部分經費帶到西滿軍區。
東北解放後，黃克誠出任天津市軍管會主任兼市委書記。當時剩餘的黃金，仍在負責保管它的翁徐文手中。翁徐文請示黃克誠如何處理。黃克誠當時已經得知中央任命其為湖南省委書記，他想，湖南革命烈士很多，從前是老蘇區，現在又是新解放地區。黃克誠一向多考慮困難，怕有特殊需要，就讓翁徐文請示並取得李富春的批准，把這筆錢又帶到湖南。
到湖南後，開始還用過少許救濟軍屬、烈屬。後來由於湖南經濟情況較快好轉，問題均能解決，這筆錢就用不著了。於是，黃克誠要翁徐文把這筆錢交給湖南財政部門。
這筆款項，黃克誠有批用權，但從未直接經手過。自始至終，均由翁徐文經管。
這個問題揭發出來以後，黃克誠非常擔心。黃克誠恐怕翁徐文年紀大了記不清來龍去脈，又恐怕他已經把帳目銷燬。而且，萬一翁徐文已不在人世，他就是跳進黃河也洗不清了。黃克誠已經背上“右傾反黨”的罪名，但是實在恥於背個“貪汙”的罪名。因此，他寫信給代替彭德懷主持軍委工作的林彪，要求迅速派人查清此案。
羅瑞卿受命率領一批人馬親赴湖南。
他們把當年曾擔任過財會工作的人員均召到長沙去查對，把多年的老帳翻出來，一天一天地查問。
幸好，翁徐文仍然健在，而且他十分小心，事關錢財，怕有非議，帳薄、單據都完好無損地儲存著，連李富春批准的字據都在。
這樣，一直查了半年，什麼問題也沒查出來，最後不了了之。
軍委鬥爭會停止後，黃克誠一直賦閒在家。
1959年後，他曾寫詩自娛：七律自況少無雄心老何求，摘掉烏紗更自由。
蟄居矮屋看世界，漫步小園度白頭。
書報詩棋能消遣，吃喝穿住不發愁。
但願天公勿作惡，五湖四海慶豐收。
黃克誠有時閱讀書報，有時默默散步，有時悄悄到郊外察看莊稼長勢。
下雨時，他常常用臉盆接水測量降水量，關心農民的生產。
在當時，黃克誠也只能用這種方式關心國事了。1960年以後，大躍進等政策的惡果顯露了出來。經濟上比例失調，生產下降，供應匱乏，尤其是糧食嚴重短缺，城市減量供應，農村死於饑荒的人不斷增加。
1961年1月，八屆九中全會在北京召開。黃克誠也參加了會議。
會議提出了“調整、鞏固、充實、提高”的八字方針。會上，黃克誠見到了陶鑄。陶鑄再三勸他給毛澤東寫封有點內容的檢討信。
黃克誠考慮再三，決定接受陶鑄的勸告。他從別人的發言和檔案中得到啟示，著重檢查犯錯誤的思想認識根源，談他過去對階級、政黨、領袖的看法，檢查自己沒能從馬克思主義高度上來認識問題等等。
黃克誠罷職閒