開頭前，小智就和一個大叔打了起來，來了場神奇寶貝對戰。
“妙蛙草，使用能源球”。
“鐵甲暴龍，使用猛撞攻擊”。
但是鐵甲暴龍還並未使出猛撞攻擊的時候，小智的妙蛙草已經使用了能源球將他打倒。
小智則上去摸了摸妙蛙草的頭，而一旁的大叔則走過來來表示稱讚
“認輸了，小弟弟，你很了不起，而且你的妙蛙草居然快要比普通的妙蛙花還要大，以後必然是優秀的神奇寶貝大師。”
小智也是禮尚往來的說道：“哪裡了？鐵甲暴龍其實也是很厲害的。”
而此時的妙蛙草背上的草包，好像開始發出了亮光，而妙蛙草顯得很痛苦的樣子，彷彿是在積蓄能，這就表明快進化。
大叔則說道：“我聽說這一帶有個叫做不可思議花園的地方，但是從來沒有人找到這個地方，小弟弟，你快把他送到神奇寶貝中心。”
小智把妙蛙種子送到了附近的神奇寶貝中心，喬伊小姐反覆檢查了一番，並給他裝上了儀器，檢視電波。”
說道：“不用擔心了，你的妙蛙草只是出現進化的徵兆了，而已有進化的妙蛙草，據說好像都要到一個什麼叫做不可思議花園的地方。“
此時，小剛也識趣的並沒有上前搭訕，而是拿起了一本書說道：“這個地方我有聽說過，據說所有快要進化的妙蛙種子，都會前往這個叫做不可思議花園的地方，完成進化。”
“而且據說不可思議，花園裡的妙蛙種子進化之後會彷彿產生一股神秘的力量，只是誰都不知道這力量到底是什麼？”。
而小智已經猜到了那股力量，正是那股能夠控制大自然的力量。
前世妙蛙種子因為看到了噴火龍進化之後不聽話的情況，所以就放棄了進化，同時也放棄了這種控制大自然的力量。
小智心想：“這一世，它估計要進化，畢竟它都已經進化成為了妙蛙草，馬上應該就可以進化成妙蛙花。”
小智想想就興奮了，畢竟他看到妙蛙種子的資料之後，覺得它前世沒進化，實在太可惜。
而此時的喬伊小姐開啟了一個窗戶，開啟了一個窗戶，外面的鮮花直接瞬間綻放。
小霞驚呼道：“跟剛才很像，剛剛桌子上的花也是瞬間綻開了花瓣。”
此時，草地上那些本來已經收攏了花瓣的花朵，忽然全部都綻放開來，且花海正在迅速的蔓延，散發出一股白色的光點。
“說妙蛙種子到達了某個時期會從四面八方聚集在一塊，舉辦者類似一個類似於進化的祭典，對了，他們不見得是每年的同樣的季節舉行。”
此時，小霞則問道：“那個不思議花園到底是在什麼地方？”
喬伊小姐則開心的說道：“可是從目前為止，從來就沒有人看到過那個地方，所以被認為甚至只是幻影而已。“
而此時在甲板上的妙蛙草，忽然感覺到了什麼，開始起身離開了神奇寶貝中心。
小智一行人尾隨著他來到了一個平原地帶，此時，天上正是滿月無數的白色粉光，正在閃耀。
此時小智他們看到了妙蛙草，被無數的藤鞭給拽進了叢林裡，小霞剛想出聲阻攔，被小智打斷了
“不用擔心了，小霞，那些並不是什麼生物，而是妙蛙草的同類妙蛙種子，他們是來迎接妙蛙草的”。
所有妙蛙種子，把妙蛙草放在了隊伍的前面，妙蛙草帶領著隊伍不斷的往樹叢深處前進。
小智則說：“看來妙蛙草現在已經成為了一個小首領，帶領著他們前往。”
此時，在一旁的火箭隊還想出手抓住妙蛙種子他們，結果無數的妙蛙種子都使出藤鞭，把他們打飛了
“好討厭的感覺”～～
小次郎說道：“明我們什麼東西都還沒有開始做呢。“
此時叢林裡面開始閃爍著無數的白色花粉，小吃走後，有無數的藤鞭圍起了樹林。
此時，小剛說道：“怪沒有人看到過真正的不可思議花園，原來是有原來是有這些巨大的藤鞭呢。
此時小智他們來到了一塊高原之上，看著底下有一大片的妙蛙種子，其中，小智的妙蛙草正在最前面。
夜晚本來是黑夜的，結果被無數閃著白光的花粉給照了個透亮，此時，無數的花朵開始綻放。
所有的花朵彷彿像是有目的的般前往了那棵巨大的枯樹面前。
空中那些漂浮的光點立馬開始聚集在一棵巨大