如此下去繁殖出幾千個共生體大軍，統治藍星還不是輕輕鬆鬆？
不過他們兩個雖然知道了這個計劃，但他們打算由他們兩個出擊，跟著尼克弗瑞想要找出叛變的人。
經過一番折騰，美國隊長見到了一個強大的蒙面男。
這個男人憑藉一個金屬手臂單手接住了他的一拳，要知道他可是穿著戰甲，爆發出的力量不可同日而語。
不過儘管這個人很神秘，和美國隊長史蒂夫打得五五開，但卻被蜘蛛俠彼得帕克一拳撂倒，當場倒地昏迷不醒。
這一幕讓史蒂夫陷入了沉默，他覺得是不是得考慮融合共生體了。
他們回到了史蒂夫當初訓練的基地，見到了佐拉博士，這個把自己的意識上傳到電腦上的狠人。
可以說是另一種意義上的永生！
從佐拉博士口中他們得知了神盾局為什麼會被九頭蛇入侵的真正原因以及他自己搞出來的佐拉演算法。
還知道了巴基為什麼沒死，正是被佐拉博士所救。
他們離開了，也炸燬了這座殘留的九頭蛇基地。
後來又遇到了那個蒙面男，一番惡戰之後美隊發現這個強大的蒙面男居然就是心心念唸的好基友巴基。
他們打暈了巴基，找到了潛藏的希爾特工，並制定了一個一舉殲滅九頭蛇和神盾局的計劃，尼克福瑞一開始是反對，不過在幾人的勸說下最終同意了這個計劃。
經過一番驚險又刺激的戰鬥和鬥智鬥勇，九頭蛇和神盾局最終一起消失在了藍星上。
神盾局，這個因美隊而建立的部門最終也因為美隊而滅亡。
不過九頭蛇是不可能真正被消滅的，他們號稱砍掉一個頭還有無數個頭。
暗地裡還有很多基地潛伏在世界各處，比如東歐的基地，那裡就關押著一對超能力姐弟。