面對這些保守勢力的攻擊和誣陷，徐光啟並沒有退縮。他堅信自己的改革計劃是正確的，是為了大明的長遠利益。他向朱見深申訴，表明自己的立場和決心。朱見深對徐光啟的遭遇表示同情和支援，他嚴厲斥責了那些保守勢力，保護了徐光啟的改革計劃。
在朱見深的支援下，徐光啟繼續堅持推行他的改革計劃。他不斷地擴大學堂的規模，培養了更多的科技人才。同時，他還積極與西方的學者和傳教士進行交流與合作，引進了更多的西方先進科技和文化。
在海疆方面，俞大猷率領明軍水師繼續與倭寇和西方列強進行艱苦的鬥爭。在抗倭鬥爭中，明軍逐漸佔據了上風，倭寇的勢力被進一步削弱。而在與西方列強的鬥爭中，明軍雖然面臨著巨大的壓力，但也在不斷地學習和進步。他們逐漸掌握了西方列強的作戰戰術和武器裝備的使用方法，戰鬥力得到了一定的提升。
經過多年的努力，大明終於在海疆取得了一定的勝利。倭寇被基本平定，西方列強的侵略也得到了一定程度的遏制。朱見深的威望在這場海疆保衛戰中得到了進一步的提升。他深知，這些勝利來之不易，是全體軍民共同努力的結果。
戰爭結束後，朱見深並沒有放鬆對海疆的防禦。他下令在沿海地區繼續加強防禦工事建設，駐紮大量的軍隊，加強巡邏和管控。同時，他還大力支援徐光啟的改革計劃，推動大明在科技和文化方面的進一步發展。他希望，大明能夠透過改革和創新，不斷地強大自身，在這個複雜多變的世界中保衛自己的繁榮與安寧。
在國內，朱見深利用海疆勝利的契機，進一步推動其他方面的改革。他繼續整頓吏治，打擊貪汙腐敗，促進政治的清明。加強農業生產，興修水利，提高糧食產量，保障百姓的溫飽。鼓勵商業發展，開放市場，促進貿易繁榮，增加國家的財政收入。在文化教育方面，他進一步加大對教育的投入，培養更多的人才，提高國民的素質。
朱見深站在皇宮的城樓上，望著遠方的海疆，心中充滿了感慨。他知道，大明面臨的挑戰依然很多，但他相信，只要全體軍民團結一心，勇於改革，不斷創新，大明一定能夠在這個充滿機遇和挑戰的時代中崛起，實現國家的繁榮與昌盛。