林羽解決星際大盜危機後，聯盟進入一段黃金髮展期。不曾想，一股神秘勢力暗中崛起，悄然滲透進聯盟高層，操縱著部分關鍵決策，引得諸多星球發展失衡，矛盾叢生。
林羽察覺到異樣，是在一場關乎新型能源分配的議會中。平日裡公正的議員們，這次卻各執一詞、互不相讓，甚至隱隱有劍拔弩張之勢，全然不像正常的討論分歧。憑藉敏銳直覺，林羽開始私下調查，神秘古盒微光閃爍，指引他前往一顆偏遠且被列為禁區的實驗星球。
抵達後，眼前是戒備森嚴的秘密基地，隱匿於山谷之中。林羽小心潛入，竟發現這裡在非法克隆強大戰士，那些克隆體眼神空洞卻武力超群，還被植入操控晶片，幕後黑手正是企圖掌控聯盟的神秘組織“破曉”。他們妄圖用武力裹挾議會，改寫星際規則，滿足私慾。
林羽撤離時不慎觸發警報，瞬間被克隆大軍圍堵。他在槍林彈雨中左衝右突，飛船遭受重創。好在關鍵時刻，他啟用古盒的防護屏障，驚險突圍。回到聯盟，林羽將證據公之於眾，民眾譁然。
聯盟即刻展開清剿行動，林羽率精銳艦隊直搗“破曉”老巢。激戰中，敵方憑藉克隆人的悍不畏死，一度佔據上風。林羽心生一計，利用古盒干擾克隆體晶片訊號，讓他們陣腳大亂。艦隊抓住時機，火力全開，將“破曉”連根拔起。
經此一役，聯盟重歸安寧。林羽沒鬆懈太久，因古盒又現異常波動，似在預警更遙遠星系的危機。他整頓行裝、修繕飛船，再度向著茫茫宇宙進發，準備迎接未知挑戰，續寫屬於他的星際傳奇，守護這片來之不易的璀璨星河。
林羽成了地球的英雄，可他無暇享受榮耀，神秘古盒在戰後頻頻震顫，幽光閃爍不定，似在預警更大危機。地球總督府內，氣氛凝重得仿若能擰出水來，數位星際聯盟派來協助重建的專員圍坐桌旁，全息投影上播放著一段令人膽寒的影像——星際軍閥“暗蠍”的艦隊如一片鋼鐵烏雲，正朝著地球氣勢洶洶地駛來。
“暗蠍”臭名昭著，所到之處燒殺搶掠，掠奪資源後將星球化作廢墟。其旗艦形如一隻巨大的毒蠍，猙獰外殼下藏著威力駭人的武器系統，周邊護衛艦、巡洋艦列陣整齊，浩浩蕩蕩，顯然是有備而來。這次盯上地球，只因聽聞林羽得了神秘古盒與先進飛船，妄圖據為己有，擴充軍備。
地球艦隊剛經歷大戰，殘破不堪，士兵們滿臉疲憊，彈藥儲備也捉襟見肘。總督愁眉不展，看向林羽：“孩子，這次怕是凶多吉少，‘暗蠍’實力太強，咱們拿什麼抵擋？”林羽緊攥拳頭，目光堅毅：“總督，躲不了，唯有一戰！我有古盒相助，定能找到他們破綻。”眾人眼中閃過一絲希望，但轉瞬又被憂慮替代。
林羽回到飛船，將古盒嵌入控制檯凹槽，剎那間，飛船各系統被啟用，光芒大亮，螢幕上浮現出複雜星圖與敵軍艦隊細節，是古盒解析出的敵方弱點——能源核心防護薄弱、指揮系統訊號易干擾。林羽嘴角上揚，有了主意。
“暗蠍”艦隊如期抵達地球軌道，二話不說便發起猛攻，鐳射炮齊射，火光瞬間吞沒周邊衛星。林羽駕駛飛船如離弦之箭般彈射出去，孤身衝入敵陣，引得敵軍火力紛紛朝他傾瀉。憑藉飛船超強機動性，他驚險閃躲，炮彈擦身而過，炸出團團火光。
瞅準時機，他按下按鈕，發射特製干擾彈，直擊“暗蠍”旗艦指揮艙。一陣電磁嗡鳴，敵方指揮系統陷入混亂，戰艦行動脫節。林羽乘勝追擊，調整船頭，朝著旗艦能源核心全力發射粒子炮。光束穿透薄弱防護，引發劇烈爆炸，旗艦搖搖欲墜，“暗蠍”大軍陣腳大亂。
但敵軍畢竟人多勢眾，回過神後瘋狂反撲。一艘重型巡洋艦鎖定林羽，炮口蓄勢待發。危機時刻，地球艦隊剩餘力量趕來支援，炮火交織成網，暫時逼退敵軍。林羽與同胞並肩作戰，穿梭在敵陣縫隙間，抓住每個攻擊機會，一艘艘敵艦在炮火下化作殘骸。
鏖戰持續數小時，戰場硝煙瀰漫，殘骸碎片四處飄散。“暗蠍”見佔不到便宜，又折損大半兵力，終於下令撤退。地球艦隊歡呼聲起，林羽懸著的心卻未放下，他知道這只是開端，宇宙暗處覬覦古盒與地球資源的勢力只多不少。
修整期間，林羽開始深挖古盒秘密。在飛船密室，他將意識沉浸其中，一幅幅陌生星圖、古老字元浮現腦海，似在訴說久遠文明故事，隱約指向一處神秘星域——禁忌之地“幻淵”，傳言那裡藏著足以顛覆宇宙戰局的終極武器。林羽決定，待地球稍穩，便奔赴“幻淵”探尋，主動出擊，才能將危機扼殺在搖籃。
與此同時，