成功摧毀幻夢星團中的封印樞紐後，秦宇和特別行動小組成為了宇宙的英雄。他們返回聯盟總部，受到了熱烈的歡迎和讚譽。然而，秦宇和隊員們並沒有沉浸在勝利的喜悅中，他們深知，只要還有可能威脅宇宙和平的因素存在，就不能放鬆警惕。
聯盟高層召開緊急會議，商討應對後續可能出現的危機。會議上，各方代表對秦宇等人的英勇行為表示感謝，並決定加大對宇宙未知區域的探索和研究力度，以防止類似的邪惡力量再次威脅宇宙和平。
秦宇在會議上提出，雖然目前已摧毀兩個關鍵的封印樞紐，但神秘勢力留下的隱患可能不止於此。為了徹底消除威脅，他們需要組建一支長期執行宇宙巡邏和探索任務的隊伍，深入宇宙的各個角落，尋找並解決潛在的危機。
這個提議得到了聯盟的一致認可。隨後，聯盟開始著手組建宇宙守護者聯盟軍，秦宇被推選為聯盟軍的總指揮。他帶領著來自不同種族、擁有不同技能的精英們，開啟了新的使命。
宇宙守護者聯盟軍的第一站，是一片位於宇宙邊緣的神秘星雲。據聯盟的情報顯示，這片星雲時常出現異常的能量波動，可能與神秘勢力的殘餘活動有關。秦宇帶領聯盟軍小心翼翼地進入星雲，發現這裡的能量環境極為複雜，各種奇異的能量流相互交織，干擾著飛船的探測裝置。
在探索過程中，他們發現了一艘廢棄的神秘勢力飛船。飛船表面佈滿了歲月的痕跡，但內部的一些裝置依然在執行。隊員們對飛船進行了全面的掃描和分析，從中獲取了一些關於神秘勢力下一步計劃的線索。
原來，神秘勢力在被擊敗前，曾在宇宙中多個隱蔽的星球上埋下了“黑暗種子”。這些種子一旦被啟用，就會釋放出強大的黑暗能量，腐蝕周圍的星球和生命，進而引發宇宙的動盪。
秦宇意識到問題的嚴重性，他立即將這個訊息傳達給聯盟，並帶領聯盟軍根據線索，開始在宇宙中尋找這些“黑暗種子”。在接下來的日子裡，他們穿梭於各個星系之間，與時間賽跑。每找到一顆“黑暗種子”，隊員們都要小心翼翼地進行處理，防止其提前啟用。
在尋找“黑暗種子”的過程中，宇宙守護者聯盟軍也與一些受到黑暗能量影響的外星生物發生了衝突。這些生物被黑暗能量侵蝕，失去了理智，對聯盟軍發起瘋狂的攻擊。秦宇和隊員們憑藉著團結協作和先進的武器裝備，一次次擊退了外星生物的攻擊。
經過一段時間的艱苦搜尋，宇宙守護者聯盟軍成功銷燬了大部分已知的“黑暗種子”。然而，就在他們以為危機逐漸消散之時，一艘偵察飛船在遙遠的未知星系探測到一系列異常訊號。這些訊號呈現出一種奇特的波動模式，與此前所接觸到的任何能量訊號都截然不同，秦宇敏銳地察覺到，新的危機或許正在悄然降臨。
他果斷率領聯盟軍主力前往該星系。當艦隊靠近時，眼前的景象讓眾人不禁倒吸一口涼氣。星系內的恆星閃爍著詭異的光芒，彷彿被一層無形的陰影所籠罩。行星的表面出現了奇怪的紋路，彷彿是某種未知力量刻意留下的印記。
聯盟軍的飛船小心翼翼地駛入星系，開始對周邊環境展開全面探測。在靠近一顆氣態巨行星時，探測器捕捉到行星內部存在強大的能量反應，似乎有什麼東西正在孕育。與此同時，飛船的通訊系統突然受到強烈干擾，發出刺耳的電流聲，螢幕上的訊號指示瘋狂跳動。
“保持警惕，隨時準備應對突發情況。”秦宇透過通訊頻道向全體隊員下達指令。話音剛落，一群形似水母的外星生物從氣態行星的大氣層中竄出，它們周身散發著幽藍色的光芒，以極快的速度朝著聯盟軍艦隊衝來。這些外星生物的身體看似柔軟，卻能在宇宙真空環境中自如穿梭，而且它們的觸鬚上還帶有強烈的電流，一旦接觸到飛船，便會引發劇烈的電磁干擾。
“開啟護盾，準備攻擊！”秦宇迅速做出反應。聯盟軍的飛船立刻啟動護盾，形成一層透明的能量屏障，抵禦外星生物的衝擊。武器系統也隨即開火，一道道能量光束射向來襲的外星生物。然而，這些外星生物行動極為敏捷，它們巧妙地躲避著攻擊，同時不斷釋放電流衝擊飛船護盾。
在激烈的交火中，一名隊員發現這些外星生物似乎是受到某種訊號的引導而行動。秦宇當機立斷，下令集中部分探測裝置尋找訊號源。經過一番努力，他們發現訊號來自氣態行星內部的一個神秘裝置。看來，要徹底解決眼前的危機，就必須深入行星內部，摧毀這個神秘裝置。但氣態行星內部環境惡劣，充滿了高壓、高溫的氣體和強大