宇宙恢復平衡後，聯盟各星球沉浸在久違的和平喜悅之中。人們舉辦盛大慶典，感恩探索隊的英勇付出，秦宇成為眾人敬仰的英雄。但他並未沉醉於讚譽，反而憂心忡忡。
為防止類似危機重演，秦宇聯合神秘文明，在宇宙關鍵節點設立監測站，部署先進裝置，對異常能量波動實時監測。同時，加強聯盟軍事力量，研發新型武器與防禦系統，提升應對未知威脅的能力。
表面的平靜之下，隱患卻悄然滋生。部分偏遠星球因在危機中受創嚴重，資源匱乏，重建困難重重。這些星球的居民對聯盟的援助分配產生不滿，認為核心星球佔據過多資源，導致他們被忽視。這種不滿情緒在暗中蔓延，逐漸形成一股反對聯盟的勢力。
與此同時，在宇宙深處，一股神秘的黑暗能量悄然聚集。這股能量似乎擁有自我意識，正窺視著恢復生機的宇宙，謀劃著新的陰謀。雖然監測站暫未察覺異常，但這股黑暗能量卻在巧妙地隱藏自身，等待合適時機發動攻擊。
秦宇在一次對偏遠星球的慰問考察中，察覺到了民眾的不滿情緒。他深知，若不及時處理，內部矛盾可能會削弱聯盟的凝聚力，給潛在的敵人可乘之機。回到聯盟總部後，他立即召開緊急會議，商討解決方案。
會議上，各方代表各抒己見。一些代表主張加大對偏遠星球的資源傾斜，儘快幫助它們恢復；另一些則擔心這會引發核心星球的不滿，導致新的矛盾。秦宇陷入沉思，他必須找到一個既能安撫偏遠星球，又能維持聯盟整體穩定的辦法。
而在應對內部矛盾的同時，那股神秘的黑暗能量也在不斷壯大，宇宙的和平看似穩固，實則如履薄冰。秦宇能否化解內部危機，又能否提前察覺黑暗能量的威脅，再次拯救宇宙？
秦宇深知平衡各方利益迫在眉睫，經深思熟慮，他提出“互助共榮計劃”。計劃核心為，核心星球憑藉技術與資源優勢，與偏遠星球建立一對一幫扶關係。不僅提供物質資源，還分享先進技術與管理經驗，協助偏遠星球發展特色產業，實現經濟自主增長。
為確保計劃公平公正，設立獨立監督委員會，由各族代表組成，負責資源分配與專案進展監督。秦宇在聯盟議會上詳細闡述計劃，耐心解答各方疑問，最終獲得多數代表支援，得以順利推行。
在“互助共榮計劃”推動下，核心星球的工程師與科學家奔赴偏遠星球。在科技落後的格林星，來自科技發達的賽博星團隊，幫助其建立太陽能收集站，解決能源短缺問題，還傳授農業種植新技術，提高糧食產量。而在資源豐富但加工技術欠缺的巖晶星，聯盟協助建設現代化礦產加工廠，提升資源利用率，創造大量就業機會。
隨著一個個專案落地，偏遠星球逐漸恢復生機，民眾對聯盟的不滿情緒開始緩解。星球間交流合作日益頻繁，文化相互交融，聯盟凝聚力進一步增強。
然而，秦宇並未放鬆警惕。他深知，內部穩定只是暫時成果，宇宙深處那股神秘黑暗能量依舊是懸在頭頂的達摩克利斯之劍。他一邊關注“互助共榮計劃”實施，一邊督促監測站升級裝置，提高對異常能量的監測精度。
與此同時，神秘文明傳來訊息，他們在古老文獻中發現與這股黑暗能量相似的記載，雖資訊模糊，但提及黑暗能量可能與一種古老邪惡力量有關，這種力量妄圖重塑宇宙秩序，以滿足自身統治慾望。秦宇意識到，即將面臨的挑戰比想象中更嚴峻，必須爭分奪秒，在黑暗能量發動攻擊前，找到應對之策。
：()黑暗終章：靈疫紀