傑克和艾利克斯將神秘人的事情處理完後，城市迎來了一段平靜的日子。但他們沒有放鬆警惕，依舊密切關注著城市中的任何風吹草動。
一天，傑克在基地裡整理資料時，發現了一份關於近期城市邊緣一些異常土地活動的報告。報告顯示，城市邊緣有幾塊荒地出現了奇怪的凹陷和隆起，附近的居民還時常聽到地下傳來沉悶的聲響。
傑克拿著報告找到艾利克斯，“你看這個，這些異常狀況可能預示著有什麼大事情要發生。”
艾利克斯接過報告仔細檢視，眉頭皺了起來，“這有點像大型挖掘工程或者是某種地下生物的活動跡象。不管是哪一種，我們都得去調查一下。”
他們隨即帶領一支小隊前往城市邊緣的荒地。到達目的地後，眼前的景象讓他們感到十分詫異。原本平坦的荒地出現了一個個巨大的坑洞，周圍的土地也像是被什麼巨大的力量翻攪過一樣，雜亂不堪。
傑克走到一個坑洞邊緣，蹲下身子檢視泥土的質地。“這些泥土很新鮮，挖掘的時間應該不長。而且這不是普通的挖掘工具造成的痕跡，更像是某種大型機械或者生物的爪子。”
艾利克斯則拿著探測儀器在周圍檢測，突然儀器發出強烈的訊號。“傑克，下面有巨大的金屬結構和能量波動，像是一個龐大的基地之類的東西。”
就在他們準備進一步探索時，天空中突然傳來一陣巨大的轟鳴聲。眾人抬頭望去，只見幾架巨大的黑色直升機朝著他們飛來。直升機的艙門開啟，一群身著黑色作戰服、手持重型武器的人順著繩索快速降落到地面。
一個看起來像是首領的人走到傑克和艾利克斯面前，冷冷地說：“你們不應該出現在這裡，這是我們的地盤。”
傑克毫不示弱，“你們是誰？在城市邊緣做這些危險的事是想幹什麼？”
首領冷笑一聲，“我們是‘新秩序聯盟’，我們在這裡做的事不需要向你們解釋。你們現在離開，還可以保住性命。”
艾利克斯站到傑克身邊，“想讓我們離開，沒那麼容易。你們這種偷偷摸摸的行為肯定有不可告人的目的。”
戰鬥一觸即發，“新秩序聯盟”的人率先開火。子彈如雨般朝傑克他們射來，傑克和隊員們迅速找掩體躲避。
“這些傢伙火力很猛，我們得找機會反擊。”傑克大聲喊道。
艾利克斯發現敵人的火力分佈有個薄弱點，他對傑克說：“我們兵分兩路，從側面繞過去攻擊他們的薄弱之處。”
傑克同意了艾利克斯的計劃。他們帶領隊員分成兩組，悄悄地朝著敵人的兩側移動。
當他們靠近敵人後，突然發起攻擊。傑克像一頭勇猛的獵豹，衝入敵陣，他的拳頭和腳不停地攻擊敵人的要害。艾利克斯則利用地形優勢，準確地射擊敵人。
在激烈的戰鬥中，傑克發現“新秩序聯盟”的這些人訓練有素，而且他們的武器裝備比之前遇到的敵人都要先進。
“他們不是普通的犯罪組織。”傑克心中暗想。
經過一番苦戰，他們終於將這群敵人擊退。但是傑克知道，這只是個開始。他們需要深入瞭解這個“新秩序聯盟”，搞清楚他們在地下建造基地的目的。
他們繼續探索地下的結構。透過一個被炸出的洞口，他們進入到地下巨大的建築內部。裡面到處是複雜的管道、巨大的機器和一些奇怪的實驗裝置。
在一間密室裡，他們發現了一些檔案和設計圖紙。檔案上的內容顯示，“新秩序聯盟”正在策劃一個驚天陰謀，他們試圖利用一種強大的能源來控制城市，進而掌控整個世界。
艾利克斯看完檔案後，臉色凝重地說：“我們必須阻止他們，這個陰謀一旦得逞，後果不堪設想。”
傑克點點頭，“沒錯，我們得儘快把這個訊息傳出去，同時想辦法破壞他們的計劃。”
於是，傑克和艾利克斯帶著新的使命，在這個充滿危險的地下基地中開始尋找阻止“新秩序聯盟”陰謀的方法，而城市的命運再次懸於一線。