軍的兵力將大大超過從前，會有兩萬多人。
但對於補充兵員，朱永興還有自己的原則。對於輔兵，因為沒有什麼罪惡，便採取自願加入的方式。很多輔兵都是清軍在雲南強行抓來的，家中或者有老有小，或者有父母妻兒，強行編入部隊，其心難安，對軍隊也是個不穩定因素；而對於俘虜的清軍戰兵，則還是歷數罪惡，促其悔悟，並殺官絕後路。然後，態度較好的編入軍隊，較為猶豫遲疑的則服苦力贖罪。
而對於清軍俘虜中的傷病，朱永興則派人盡力醫治，並讓前期編入軍隊的表現較好的俘虜兵前去安撫宣傳。為此，他還寫了不少後世政治思想工作的要領和方法，由新成立的宣教機關學習傳達。
張勇留糧，不過是小恩小惠。治傷療病，卻是救命之恩。兩下相比，高低立見。除了那些親兵，被將領餵飽了，或者說是視將領為恩主，比較死塌地之外。大多數清兵只是為了吃糧拿餉，並不是為了什麼崇高偉大的理想。但人心換人心，朱永興不相信忘恩負義會是很多人的心理。
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