始皇帝大為震怒，下詔，藍田大營統率、臨洮侯羌廆率五萬大軍進駐函谷關，大監軍、舞陽侯楊端和率藍田大營三萬軍進駐武關，名為加強京畿鎮戍，實則威脅關東。
京畿鎮戍軍尚未抵達關隘，關東地區的奏章雪片一般飛來，各地的叛亂愈演愈烈，封國和郡縣迫於危機，不得不緊急徵發兵役以補充地方鎮戍力量進行平叛。這其中以吳王公子高最為猖狂，一口氣在江東征發了五萬兵役。據黑冰密報，江東地方軍早在初春就開始了兵役徵發，此時已經完成了整編，具備了一定的戰鬥力。
關東地方勢力利用了當前的危機，明裡暗裡抗衡中央，不但截留賦稅，還擅自徵發兵役擴建地方軍，形勢已經對咸陽極度不利。
太傅、上將軍、武烈王公子寶鼎親自給關東四大鎮戍統率寫信，詢問關東局勢的發展情況，徵詢處置危機的意見。四大鎮戍統率在回覆中倒是沒有故意隱瞞或者誇大，實事求是的述說了地方郡國所面臨的困難。
關東士人的影響力太大，他們把關東六國逃亡貴族、圖謀復國的叛逆和關東庶民拉到了一起，利用關東人對大秦人的仇恨，形成了一股非常強悍的叛亂力量，而各郡國因為鎮戍力量太弱，無法及時平叛，只有堅守重要城池等待鎮戍軍主力，但鎮戍軍主力因為錢糧不足，又無法四處東征西討，由此就出現了各地（暴）亂愈演愈烈的局面。
始皇帝面臨兩難選擇。
他若想打擊關東士人，就必須贏得關東郡國的支援，而若想贏得關東郡國的支援，就必須下放權力，讓關東郡國拿到足夠多的軍政財大權，而關東郡國一旦拿到更多的權力，關東地方勢力必然迅速發展壯大，對抗中央，由此導致中央對關東的控制力更弱。這樣發展下去，要不了多久，關東的某些實力強勁的地方勢力就會形成割據事實，而這是始皇帝所不願看到的。
但問題上，始皇帝統一中土文化的策略已經引發了關東危機，在關東各地的叛亂愈演愈烈的情況下，關東郡國迫於現實，不經中央同意，已經公開奪權中央權力，正在迅速走上發展壯大之路，假如這時候不與他們妥協，不向地方放權，等於逼迫他們與關東士人聯手，這樣關東地方勢力會發展得更快，割據事實會出現得更早。
始皇帝和公子寶鼎、李斯、趙亥、甘羅、趙高、周青臣等支援“獨尊法學”的大臣們經過反覆磋商後，最終不得不決定向關東郡國妥協。
始皇帝下詔，考慮到關東局勢的緊張，各地叛亂此起彼伏，特授權關東各郡國徵發兵役擴充鎮戍力量。關東各郡國要平叛，當然需要錢糧和武器，所以始皇帝又授予他們一定的財政許可權，允許他們自籌錢糧用於平叛，但上繳中央的賦稅不能少。
此詔一下，關東各郡國立即做出反應，紛紛改弦易轍，堅決支援咸陽打擊關東士人。
九月，始皇帝下詔焚書。
焚燒《秦記》以外的列國史記，對不屬於博士館的私藏《詩》、《書》等六經典籍限期交出燒燬。三十日不燒者，黥為城旦。有敢於談論《詩》、《書》者處死，以古非今者滅族。（禁）止私學，想學法令的人則以官吏為師。
城旦：城旦是秦漢時的一種刑罰名，到邊疆服四年兵役。
第456章 坑儒
關東博士集團遭到致命打擊。
淳于越鬱憤而死。伏生、羊子等博士慘遭（禁）錮。還有一些博士既不願意供職於朝堂，又無法離開關中，無奈之下只好出走咸陽隱居山林，比如崔廣、唐秉、吳實、周術等四位博士就帶著一些弟子隱居於商山，後被人稱為商山四皓。
短短時間內，大秦七十博士存者寥寥，始皇帝用來融合中土文化的博士參政制度名存實亡。
大秦本土研習的是法家學術，各級學府遵從的是“以吏為師”的教育制度，所以《焚書》令對大秦本土影響甚小，但在關東郡國卻掀起了血雨腥風。
在激烈對決過程中，做為弱者一方的關東士人在生死存亡之刻也出現了分裂。
信奉變通之術者或者居心叵測者，馬上向秦人“繳械投降”，先保住性命再說。留得青山在，不怕沒柴燒，只要性命保住，一切均有可為，而關東郡國的秦人當然不會趕盡殺絕，他們還需要這些關東士人的幫助以穩定地方和發展地方勢力。
還有一部分關東士人則誓死抗爭到底，不但不遵令焚書，還繼續聚眾叛亂。關東郡國的官長們當然不允許這些人與自己作對，損害到自己的利益，所以痛下殺手，堅決鎮壓。
中原、河北、山東、兩淮和江