不久，最高統帥部和黨衛隊保安處便達成一項協議，由保安處“甄別”俄國戰俘。保安處的大劊子手奧托·奧侖道夫在一份供詞中透露了“甄別”的意圖何在。奧侖道夫與希姆萊手下許多人一樣，是個不務本業的知識分子，他曾得過兩個大學學位（法學和經濟學），並曾在應用經濟科學學院當過教授。
＇ 奧侖道夫說＇ 所有猶太人和共產黨幹部都要調出戰俘營，處以死刑。據我所知，在對俄國作戰的整個期間，一直採用這種辦法。
但是這樣做也不無困難。俄國戰俘的身體往往衰弱得連上刑場都走不了。為此，秘密警察頭子海因裡希·繆勒提出了抗議，此人短小精悍，也是個殺人不眨眼的劊子手。* 他說：集中營長官不滿地說，預定要被處決的蘇聯人在到達集中營時，已有5 ％到10％的人死亡或瀕於死亡……特別值得注意的是，在前往集中營的途中，譬如從火車站走向集中營的途中，就有相當多的戰俘由於疲憊不堪倒在路上，有死了的，也有半死的，因此護迭時後邊還得跟上一輛卡車裝運這些人。要想不讓德國人看到這種場面是不可能的。
秘密警察對俄國戰俘餓死累死絲毫也不在乎，他們遺憾的只是每死一個戰俘就使劊子手們少一個行刑的物件，但是他們不願意德國人民看到倒斃於途的慘象，因此“秘密警察繆勒”——他在德國以此著稱——下令：自即日起（1941年11月9 日），俄國戰俘凡顯然無活命希望因而連短途旅程也不能走動者，以後無需運到集中營處死。
＇954＇ 死了的戰俘不能勞動自不必說，甚至餓壞累壞的戰俘也都失去勞動能力了。到了1942年，德國人已清楚地意識到戰爭將長期拖下去，比他們原先設想的時間要長得多；同時也已看出，他們的後備勞動力十分缺乏，被俘蘇軍已成為德國後備勞動力的重要組成部分。因此納粹放棄了屠殺戰俘的政策，而採取利用他們從事勞動的辦法。1943年，希姆萊在波森對黨衛隊人員作了一次講話，解釋了為什麼要改變這項政策的道路。
當時＇1941 年＇ 我們對這麼一大批人沒有像今天這樣，把他們當作原料和工人。戰俘餓死累死幾萬幾十萬，從幾個世代那樣長遠的意義上看，是沒有什麼可遺憾的；但是在目前，由於喪失了勞動力，這種情況卻是可惜的。
現在必須讓戰俘們吃得足以使他們有力氣幹活了。到1944年12月，已有75萬戰俘在兵工廠、礦山（分配了20萬人）和農場勞動，其中包括不少軍官。他們的待遇是苛刻的，但是總算可以活命。甚至凱特爾元帥建議在戰俘身上打烙印的辦法也廢除了。* 德國人對待西方戰俘，特別是英美戰俘，比對待俄國人相對地來說好一些。雖然屠殺英美戰俘的事也偶然發生過，但一般都是由於個別戰俘營長官個人的極端殘暴和虐待狂所致。1944年12月17日比利時凸出地帶戰役中，在馬勒梅第附近的田野中血腥屠殺71名美國戰俘，便是一個例子。
希特勒也曾親自下令殺害西方戰俘。例如他曾下令屠殺50名英國飛行員，這些人於1944年春被俘，後來在薩崗的一個集中營逃跑未成。戈林在紐倫堡說，他“認為這是整個戰爭時期最嚴重的一次事件”，約德爾將軍則稱之為“不折不扣的謀殺”。
1943年英美對德國加緊轟炸以後，德國便有意鼓勵殺害盟軍在德國跳傘降落而被俘的飛行人員，上述事件實際上似乎是他們這個政策的一部分。德國鼓勵一般平民在抓到跳傘降落的盟軍飛行員後，立即私刑處死。戰爭結束以後，不少犯有這種罪行的德國人受到審判。（1944年英美轟炸德國達到高潮時，裡賓特洛甫主＇955＇ 張對被擊落的英美空軍人員立即處死，但希特勒則採取比較溫和的態度。）
1944年5 月21日，他在與戈林會商以後，只是釋出這樣一項命令：英美飛行人員凡曾掃射過客車、平民以及緊急著陸的德國飛機者，可不經軍法審判即予槍決。
被俘的空軍人員有時則被直接交由黨衛隊保安處進行“特別處置”。
1944年9 月，約有47名美英和荷蘭的飛行人員（全都是軍官）在毛特豪森集中營慘遭殺害。集中營中有一個法國戰俘莫里斯·拉姆普是目擊者之一，他在紐倫堡敘述這次屠殺的情況時說：47名軍官光著腳，被帶到石坑裡……在石坑的最下一層階梯上，警衛人員把石頭放到這些可憐的人們背上，要他們扛到上邊去。頭一趟扛的石頭約60磅重，一面扛著一面捱打……第二趟扛的更重，什麼時候被石頭壓垮了，就遭到腳踢棒打……到了晚上，路