推舉黃興代替吳紹霆成為軍事部部長的事，是由廖仲愷在幕後策動的。他並不是不相信吳紹霆，也不是認為吳紹霆資歷尚淺，只不過相比較之下黃興肯定要比吳紹霆更可靠。廣州革命政府成立之後的首要之事，就是調動革命軍掃清省內、出兵北上，推動革命的火焰燒遍全中國。所以把革命軍掌握在自己人手裡，才能更容易的執行這項命令。
至於吳紹霆，他在光復廣州之後就一直在埋頭整編軍隊，絲毫沒有出兵的打算，單單就是這一點讓廖仲愷有些放心不小。
這次會議就卡在了軍事部的問題上，從上午一直糾結到下午，依然沒有結果。
胡漢民是支援吳紹霆的，他一直應該按功分配，這樣才能體現革命事業的光明磊落，不能什麼事都任人唯親。雖然胡漢民說的大義凌然，也得到了一部分人的支援，在這些支援人當中大部分是同盟會廣州本地的會員，他們一方面是強調地域政治，另外一方面是擔心得罪了吳紹霆會引來大禍。
支援黃興的人，則正好是原來華興會的幾個骨幹成員，如宋教仁、章士釗等人。宋教仁是上個月剛從日本回國，正好就到了惠州與黃興會面，並且中途參加了這次起義行動。另外的幾個人就是廖仲愷安排的幾個香港同盟會成員了。
雙方各持一詞，僵持不下。大家都覺得厭煩了，認為胡漢民完全可以拿出都督的威信，直接決議人事任命的問題，不要再在這個問題上糾纏下去。可是胡漢民想法中的不確定因素太多，又要顧慮到廖仲愷的意思，所以遲遲拿不出都督的作派來。
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