所以他在一方面發兵武力侵佔濟州島的同時，回到圍頭灣之後，下令陸軍方面繼續擴兵，再次徵兵組建起十個新的步兵營，三個標準炮兵營，將部分兵力，先行投往越南黎朝那邊，最好是能把黎朝給幹掉，將整個越南北部，先控制在手中。
至於其他人高興不高興，樂意不樂意，就不是他關心的事情了。
當時間又過去了幾個月之後，獨眼龍從廣西雷州傳回了一個訊息，他在經過幾個月的窮追猛打之後，兩廣沿海一帶的大股海盜勢力，在於家軍的兵鋒之前，一股一股的冰消瓦解，不少海盜無處可去，只得投降了於家軍，被解除了武裝，大批轉運到了香港那邊，成為了籌建香港的基礎勞力。
但是鄭一官這傢伙，卻油滑油滑的，眼瞅著擋不住於家軍大軍南下，經過兩次和海狼的艦隊交手之後，都敗得一塌糊塗，他手頭上僅有的幾條西式大夾板船，也在兩次交戰之中，損失殆盡。
於是鄭一官立即就在雷州那邊宣佈接受招安，投降了廣西官府，被廣西巡撫授了個海防守備的官職。
這件事鄭一官做的很突然，意圖透過投降官府，來獲得一個官面上的身份洗白他的賊身，阻止於孝天繼續對他進行打擊。
可是獨眼龍把訊息送到於孝天手頭之後，於孝天當即回覆他了幾個字“趕盡殺絕！”
獨眼龍接到命令之後，立即繼續率領艦隊，將鄭一官的船隊堵在了欽州灣之中，一通猛打，將鄭一官殘存的一百多條船隻，差不多盡數殲滅在了欽州灣之中，可以說是將鄭一官的全部實力，透過這一戰徹底肅清。
而鄭一官這個時候身在桂林授官，沒有在欽州灣之中，所以僥倖得以逃了一命，但是在此不久之後，鄭一官得知手下全軍覆沒之後，掛印而去，從此不知所蹤，再也沒有人見過鄭一官。
後來對鄭一官有很多傳言，有的人說鄭一官是被於孝天派人暗中綁架殺掉了，也有人說鄭一官心知手頭已經無兵無卒，自知罪孽深重，不敢再留在廣西，化妝成了一個商賈，出海下了南洋，後來逃至了暹羅隱姓埋名定居在了暹羅。
但是也有人說鄭一官被於孝天搞得一文不名之後，不甘心失敗，隱姓埋名化妝到了圍頭灣，試圖刺殺於孝天，但是事敗之後，被於孝天的親衛擊殺。
更有人說後來鄭一官投靠了紅毛人，到了巴達維亞當了個通譯，總而言之，沒有人真正說得清楚，鄭一官到底最後落得了一個什麼下場，這件事於孝天后來也閉口不談，所以從此鄭一官的去向就成了一個不解之謎。
崇禎九年期間，於孝天重新整合了兩廣海上的各方勢力，採取了很多極端手段，打擊了兩廣沿海一帶的那些士紳大戶人家，兩廣沿海表面上看來，似乎平靖了很多，但是卻又新生了幾股大股海盜，繼續在兩廣一帶活動。
而這些海盜裝備精良，不單單隻在海上活動，而且還經常性的會侵入陸上，甚至還會深入兩廣內地很深的地方，襲擊一些大型的莊堡村寮。
在這一年之中，兩廣一帶起碼有數百名劣紳土豪，要麼是家園被毀，要麼是莫名失蹤，要麼就是莫名被暗殺，在兩廣一帶掀起了一場有針對性的腥風血雨。
可是卻很少有人知道，這些人最終是為何遭此劫難，搞得整個兩廣一帶的許多鄉紳是人人自危，甚至於許多鄉紳連家門都嚇得不敢出，整日裡躲在自家的深宅大院之中禱告，祈求蒼天保佑。
但是實際情況卻是於孝天透過這種手段，始終遲滯著整個兩廣沿海的所謂剿匪程序，透過養賊自重的辦法，不斷扶植一股股新生海盜勢力為之所用，並且透過所謂的“海盜”襲掠，來把勢力逐漸滲透到了兩廣各地，特別是沿海一帶之中，徹底將兩廣沿海控制在了他的手中。
而最重要的是他透過平定兩廣沿海的海盜，徹底將整個南方的海上控制在了他的手中，在這場平叛的活動之中，於孝天不單單只是在和各方海盜勢力在進行戰鬥，同樣於孝天也在挑戰這麼多年來兩廣一帶形成的黑暗秩序，徹底切斷了很多地方官府和士紳土豪們和海盜之間建立起來的那種暗中合作的關係。
他這樣的行動，無疑挑戰了不少人的底線，觸動了不少人的實際利益，令很多既得利益者對他非常不滿，也針對他採取了不少抵制的措施。
這些浮出水面的人，自然也成了於孝天的敵人，成為了他必須清除的物件，而於孝天暫時還身負大明總兵的身份，自然不能赤膊上陣，去把這些敵人進行剪除，所以便只能暗中使用代理人，或者是見不得光的手段，將其一一剪除。
透過這樣