，而且也可以看作是天皇的想法。
第10軍第6師團的隨軍攝影記者在該師團司令部裡看到一份傳達檔案，內容是：“不容許共產主義的暴虐，為粉碎共匪的猖獗活動，農民，工人自不待言，直到婦女兒童皆應殺戮之。”（《太平洋戰爭文獻，最前線情況異常》）該師團在向崑山進攻時又接到命令說：“不論婦女兒童，凡中國人一概都殺，房屋全部放火焚燒。”洞富雄先生深入研究了所有資料後認為：“上海派遣軍或第10軍，或雙方發出瞭如此殘酷的命令，那是千真萬確的。”（引自《大屠殺》第225頁）
所以，一些目睹南京大屠殺的外僑得出結論說：南京事件等所見到的日本兵的殘暴行為，完全是日本軍事最高當局所採取的恐怖政策的反映。德國駐南京的代表向本國外交部報告中說：“犯罪的不是這個日本人那個日本人，而是整個日本皇軍……它是一部正在開動的野獸機器。”
第三，南京大屠殺反映出日本軍國主義最野蠻的軍事教育。南京大屠殺暴露了日本帝國主義的本性，反映了日本最高軍事當局蔑視國際法的極端錯誤的指導思想，也反映出日本極端錯誤的軍國主義教育和軍事訓練，導致了日本軍隊的野蠻和殘忍，形成當時日本軍隊侵略成性的本質。
軍國主義教育以天皇至上為主線，成為日本軍人的精神支柱。日本建立強大的海陸空三軍的目的在於強力向外推行殖民地政策，與這個目的相適應，或者說相配套的是“以在國土內外，發揚光大皇威之榮譽”為宗旨的軍國主義教育。天皇至上，崇拜天皇，天皇凌駕一切之上。在日本軍隊裡出現了許多為天皇戰死而感到“光榮”的軍人。
日本雖然沒有公開宣佈他們奉行天皇主義，實際上他們透過種種步驟在日常生活中形成了天皇主義。比如松井石根統任上海派遣軍司令長官之後一段文字記載。
8月17日上午10時，餘於宮中拜謁陛下，並拜受如下敕語：
朕委卿以統率上海派遣軍，宜細察宇內大勢，以速勘定敵軍，揚皇軍威武於內外，以應朕之倚重。
餘奉答如下：
臣石根拜領上海派遣軍之大命，受賜優渥敕語，誠惶誠恐，不勝感激之至，惟仁惟威，發揚皇軍之宗旨，以安宸襟。（《虛構》第102至103頁）
以上完全以皇帝身份對臣子。君要臣死，臣不得不死。君要臣亡，臣不敢不亡。這就是極端天皇主義和對天皇崇拜的表現。
宣揚天皇至上的思想，逐步形成日本軍人毫無畏懼、敢於殘酷戰鬥的精神支柱。竹內實在《觀察中國的出發點》一文中說：“在實際侵略中國的過程中，天皇的存在使平凡、膽怯的日本有了勇氣和信念，有可能說服自己去進行侵略和殺戮，這是無可否認的事實。天皇本人是否喜歡這樣做，這個問題這裡避而不談。在日本人一般精神狀態中，天皇的存在就是如此。”（載日本《中央公認叢書》，1975年，第177頁）在確立天皇制的過程，天皇至上的思想已經深入到當時所有日本人的意識中。
在日本崇拜天皇和軍國主義教育從少年時代便形成了牢靠的基礎。學生都要參加升太陽旗，唱《君之代》
我皇御統傳千代，
一直傳到八千代，
直到鵝石變岩石，
直到岩石長鮮苔。
在參加升太陽旗唱《君之代》時要求絕對嚴肅，在操場上自不待言，哪怕是隔牆聽到軍樂隊奏國歌曲調，意識到在升太陽旗，都要肅立致敬，表示對天皇的絕對崇拜。
教科書課本上向學生灌輸侵略意識。“欲征服中國，必先征服滿蒙；欲征服世界，必先征服中國”，規定學生要背熟、記牢。同時鼓勵學生直接進入預備軍官學校，並從各方面給予照顧，使進入預備軍官學校的人得到實惠，在社會生活方面起到感召作用，把“優秀”人才集中於海陸空三軍之中，以便用於對外侵略。
入伍後的軍人教育首先要發揚崇拜天皇的精神。軍歌《跨過大海》歌詞中說：“跨過大海，屍浮海面，跨過高山，屍橫遍野。為天皇捐軀，視死如歸。”露骨地鼓勵軍人為天皇賣命，軍人的頭腦中已經形成在侵略他國的道路上不住手地殺人的意識，主張只有殺絕對手才能掃除佔領他國領海領土的障礙，取得殖民地的可能。前面提到的“不論婦女兒童，凡中國人一概都殺，房屋放火焚燒”便是日本軍殺絕他國人民的根深蒂固的意識中的反映。
軍人教育中又把“武士道”精神引向崇拜天皇，忠於天皇，把“忠君、節義、廉恥、勇武、堅忍”誘導為