指令對“公共機構”和“政府機構”下了明確的定義。它列舉了七種人，這七種人當然地成為解除公職或從其他重要的或有影響的職位上清除的物件。前三種應予免職和清除的人是日本的軍事領導人，包括因戰犯嫌疑而逮捕起來的人、陸海軍職業軍人、特別高等警察以及陸軍省和海軍省的主要官員。後四種人包括極端民族主義的、恐怖主義的或秘密愛國主義的團體和戰時全國性的政治團體中的成員，海外開發公司的高階職員，佔領區的長官及其直屬部下，以及“其他的軍國主義者和民族主義者”。最後，指令要求對眾議院所有的候選人立即進行甄別。這個指令還附有調查表的樣張，供目前在職人員、競選人員或求職人員填寫。
這個整肅指令對日本政治生活當然有深遠的影響。這個指令釋出後不久，許多必定屬於整肅範圍的主要官員辭職了。由於幣原內閣裡有三名內閣大臣和六名內閣官員受到牽連，連幣原內閣能否存在下去也成問題了。但是內閣總理大臣於1946年1月11 日宣佈說，他寧願改組內閣而不願辭職。新上任的內務大臣三土忠造對省內受影響的人員進行了調查，在兩週不到的時間內，他的主要官員中有三十二人自願離職，十人被撤去職務。這時，內閣向盟軍最高統帥報告說，他們