亞就這樣在歷史上第一次被分割，就在亨萊因的追隨者歡慶他們與一個他們及其祖先從未隸屬過的帝國團聚的同時，捷克斯洛伐克的南北邊界卻都在向境內縮排。歷史又倒退到1919…1920年，當時捷克斯洛伐克所獲得的領土又從它手中被奪走了。當波蘭看清捷克斯洛伐克已被遺棄而屈服時，便立即於9月30日提出最後迪牒，要求交出切欣區，這是捷克斯洛伐克在1920年乘波蘭無力兼顧時吞併切欣區的歷史重演，捷克斯洛伐克於10月1日讓步，在10月2日至12日之間波蘭佔領的那一塊領土，據捷克估計，那兒的捷克人佔百分之五十三點五，波蘭人只佔百分之三十三點五。匈牙利於10月1日對捷克斯洛伐克提出關於舉行修改邊界的談判。自10月9日至13日由斯洛伐克人和匈牙利人舉行的談判是在科馬爾諾（科馬羅姆）進行的，因匈牙利人提出的要求過高而告破裂。匈牙利在10月12日便已採取軍事行動，在東斯洛伐克和盧西尼亞進行了幾個星期的小規模非正規戰爭，這又是1919年的匈牙利和捷克斯洛伐克戰爭的重演。同1919年一樣，衝突並不是由於兩個小國之間的直接問題而要打出一個結果來，兩個小國之一在軍事上佔優勢，另一個則有大國的支援，取得勝利的乃是後者。在經過進一步無結果的直接談判之後，捷克斯洛伐克政府和匈牙利政府將爭端提請德國和義大利仲裁，因此裡賓特洛甫和齊亞諾於11月2日在維也納的貝爾維德雷宮劃出了新的匈牙利…捷克斯洛伐克邊界線，完成了對捷克斯洛伐克的瓜分。為了矯正過去把百分之六的馬扎爾民族併入捷克斯洛伐克的不公正行為，現在將百分之二十的斯洛伐克民族併入了匈牙利。
在維也納和在慕尼黑一樣，都有重要的缺席者，最顯著的缺席者是慕尼黑會議的兩個西方國家，這和慕尼黑協定附件的規定是相違背的，附件規定由四國來解決波蘭和匈牙利提出的要求。現在將英、法排除於東歐之外是在外交上第一次出現。匈牙利曾要求波蘭和德國、義大利一同作為仲裁者，捷克斯洛伐克則提出，如果有波蘭，也應有羅馬尼亞作為仲裁者。因此小國又一次被排除在外，而波蘭也又一次成為小國之一。維也納議定書所要解決的問題是，是否要建立波蘭和匈牙利的共同邊界，和1919年一樣，這再一次意味著要處理盧西尼亞。匈牙利和波蘭的目的是由匈牙利恢復昔日的喀爾巴阡山邊界，並作有利於波蘭的小小修正，它們兩國得到義大利的支援，羅馬集團的政策和波蘭集團的政策攜起手來了。波蘭想拉羅馬尼亞一起瓜分盧西尼亞，可是羅馬尼亞卻有顧慮，深怕匈牙利的修改和約的主張下一回便要輪到特蘭西瓦尼亞了，這是當初建立小協約國的共同利益的最後一次消極表現。衛星國的加強聯合又一次出現了相互矛盾：對德國說來，波蘭和匈牙利的共同邊界可以加強一個從屬於德國政策的反蘇集團，但這一集團的主要動機或許也是反德的，因為它攔住了德國向東發展的道路。維也納會議暴露了軸心國家內部的潛在矛盾，義大利支援匈牙利，德國則支援斯洛伐克，但德國具有更大的發言權。維匹納議定書對斯洛伐克和盧西尼亞的宰割較之分割波希米亞更武斷，但是還儲存了一部分殘餘的盧西尼亞，正如它依然是其一部分的剩餘的捷克斯洛伐克那樣，作為德國實現其目的的工具。
新的捷克斯洛伐克一開始就是德國的傀儡國。它的天然防線和建築的防禦工事都交出去了，在戰略上和經濟上它都無法維持，它的生存只能聽命幹德國，而德國從一開始就準備全部併吞它。捷克斯洛伐克政府利用人民群眾對西方國家的憤怒情緒同軸心國合作。10月5日貝奈斯辭去了總統職務並於10月22日離國出走。緊接著慕尼黑事件之後，在捷克斯洛伐克國內出現了兩種事態發展，都是在德國鼓勵下促成的具有煽動性的急進主義。第一種是國家聯邦化，第二種是部分建立了法西斯體制。在德國控制下，捷克斯洛伐克分解成為各該組成的民族，它們迄今潛在而受到抑制的自治傾向現在實現了。10月6日成立了斯洛伐克的自治政府，10月11日成立了盧西尼亞的自治政府，後者的古老首府烏日戈羅德已割讓給匈牙利，現在只好在窮村胡斯特建立新首府。11月17日透過了全國新憲法，國名由捷克斯洛伐克改為捷克…斯洛伐克，11月21日又正式制定了斯洛伐克和盧西尼亞的自治法規。捷克各州的憲法也有了變革：各政黨合併為兩個集團，其餘一律解散，權力集中在行政部門。可是兩個新的自治政府既無獨立基礎，又沒有獨立傳統，所以德國對它們的影響遠勝於布拉格。斯洛伐克一向有教權和專制的傳統，所以在斯洛伐克民粹