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這是一個重大的發現！
調查人員開始按圖索驥，進行全面的調查。
他們找到了這輛汽車的主人：與紐約州一河相隔的澤西市肯尼迪大道1558號賴特卡車出租公司。該公司證明，這輛汽車確實是它的，但已在一週前祖給了一個名叫穆罕默德·薩拉馬的男子，而且，薩拉馬還三番五次來公司糾纏，說他的汽車被盜，要求退還他的400美元押金。薩拉馬丟車之說，沒有得到警方的證明，因此，賴特公司也無法退還他的押金。
調查小組在獲悉這一情報後立即設下圈套，等待薩拉馬再次前來索款。3月4日，薩拉馬果然打來電話，這次，公司職員沒有拒絕他的要求。原來，偽裝成公司職員的聯邦調查局特工在電話中告訴他，雖然沒有警方的證明，但他仍然可以取回一半押金，讓他隨時來取。薩拉馬不知其中有詐，興沖沖地趕到賴特公司，聯邦調查局的特工有意與他周旋，詢問了一些有關丟車的情況，薩拉馬不疑有詐，只想取回自己的押金。他取錢後準備乘計程車離開，正在這時，一群聯邦調查局特工截住了他。
隨後，聯邦調查局對他的住所進行了搜查。結果，儘管警犬在他的房間中嗅到了強烈的炸藥氣味，但特工費盡九牛二虎之力，還是沒有找到炸藥，只是找到了一些與製造炸彈有關的材料，如天線、電路圖、接線說明書。這些材料不能證明薩拉馬與炸彈直接有關，但已經足以將他列為重大嫌疑犯了。
警方認為，如果爆炸真與薩拉馬有關，那麼，薩拉馬絕對不會單槍匹馬，因為爆炸世界貿易中心是一件舉世震驚的大事，而薩拉馬卻為他那區區幾百美元押金斤斤計較。因此，薩拉馬背後必定有一條大魚。警方隨即圍繞薩拉馬進行了周密的調查，凡是與薩拉馬有接觸的人都脫不了干係。
在爆炸案發生的前一天，有人發現薩拉馬與其他幾個人一起出入澤西市的一間倉庫，並向一個名叫尼達爾·阿亞德的人打過電話。於是，警方對那個倉庫進行了突擊搜查，這次搜查發現了不少物證，倉庫裡有幾包尿素、數瓶硝酸，還有一些燒瓶、試管和引線。這些東西已經足以製成炸彈了。
至於那個阿亞德，警方也根據薩拉馬提供的線索，找到了他。原來他是一名有巴勒斯坦血統的科威特人，不過，他目前已經向星條旗效忠，歸化為美國公民了。他與薩拉馬不一樣，來美后取得了化學工程學位，現供職於某訊號公司。警方認為他的專業知識已經足以製造一枚炸彈了。他和薩拉馬關係極佳，兩人認識已有一年，且共同擁有一個帳號。在薩拉馬租車後，他也開著一輛紅色的汽車與其同行。
3月10日，聯邦調查局直奔阿亞德的寓所，從被窩中請出了阿亞德，並對他的寓所進行了搜查，結果在他的個人電腦裡發現了一封信，信中他對第一次行動表示不滿，並準備再次行動，炸燬世界貿易中心大樓。他在信中說：“很不幸，這次我們的計算不精確，不過我們可以保證，下一次行動將非常精確。除非我們的行動成功，否則世界貿易中心將始終是我們在美國的目標。”信未還附有“解放軍第五連”的簽名。
聯邦調查局將此信與《紐約時報》接到的信件相比，發現兩者有相似之處，再對《紐約時報》那封信的信封和信紙進行化驗檢查，結果發現，這封信就是阿亞德所寫。
真兇終於露面了！
聯邦調查局還發現，阿亞德和薩拉馬製造炸彈需要的錢，都是由一個外國組織資助的，幾個月來，至少有8000美元從歐洲匯到阿亞德和薩拉馬的帳戶裡，使用這筆經費的，除了薩拉馬和阿亞德外，還有4個人，結果就引出了穆罕默德·阿布哈里馬。
與薩拉馬和阿亞德等人相比，阿布哈里馬的記錄可是不太好。在紐約他以開出租汽車為生，闖紅燈對他來說是家常便飯，在記程器上做手腳也是常有的事。為此，他的駕駛執照被沒收過十多次。
他絲毫不隱瞞自己極端的宗教熱情，並積極投入了當地穆斯林組織為“兄弟的阿富汗穆斯林”進行的募捐活動，並親自到巴基斯坦與阿富汗交界處的一個軍事基地接受軍事訓練，成績絕對優秀。
在那裡他結識了拉赫曼教長，教長的兩個兒子也在那裡受訓。後來，他還跑到阿富汗去，與阿富汗的伊斯蘭同胞一