森堡委派波特去做實驗，他的結果錯了好幾倍，顯示石墨不適合用在反應堆中，於是德國人只好在重水這一棵樹上吊死。這又是一個懸案，海森堡把責任推到波特身上，說他用的石墨不純，因此導致了整個計劃失敗。波特是非常有名的實驗物理學家，後來也得了諾貝爾獎，這個黑鍋如何肯背。他給海森堡寫信，暗示說石墨是純的，而且和理論相符合！如果說實驗錯了，那還不如說理論錯了，理論可是海森堡負責的。在最初的宣告中海森堡被迫撤回了對波特的指責，但在以後的歲月中，他，魏扎克，沃茲等人仍然不斷地把波特拉進來頂罪。目前看來，德國人當年無論是理論還是實驗上都錯了。
對這一公案的爭論逐漸激烈起來，最有影響的幾本著作有：robertjungk的《比一千個太陽更明亮》（brighterthanathousandsunds，1956），此書讚揚了德國科學家那高尚的道義，在戰時不忘人類公德，雖然洞察原子彈的奧秘，卻不開啟這潘多拉盒子。1967年davidirving出版了《德國原子彈計劃》（thegermanatomicbomb），此時德國當年的秘密武器報告已經得見天日，給作品帶來了豐富的資料。irving雖然不認為德國科學家有吹噓的那樣高尚的品德，但他仍然相信當年德國人是清楚原子彈技術的。然後是margaretgowing那本關於英國核計劃的歷史，裡面考證說德國人當年在一些基本問題上錯得離譜，這讓海森堡本人非常惱火。他說：“（這本書）大錯特錯，每一句都是錯的，完全是胡說八道。”他隨後出版了著名�