大儒，受人尊敬。現在先殺了他，將使全國都陷入恐怖之中。”董卓這才停止動手，只是免去盧植的官職。於是，盧植逃到上谷郡隱居起來。董卓派人把廢立皇帝的計劃送到太傅袁隗看，袁隗回報同意。
甲戌，卓復會群僚於崇德前殿，遂脅太后策廢少帝，曰：“皇帝在喪，無人子之心，威儀不類人君，今廢為弘農王，立陳留王協為帝。”袁隗解帝璽綬，以奉陳留王，扶弘農王下殿，北面稱臣。太后鯁涕，群臣含悲，莫敢言者。
九月甲戌（初一），董卓又在崇德前殿召集百官，威脅何太后下詔廢黜少帝劉辯，詔書說：“皇帝為先帝守喪期間，沒有盡到作兒子的孝心，而且儀表缺乏君王應有的威嚴。如今，廢他為弘農王，立陳留王為皇帝。”袁隗把少帝劉辯身上佩帶的璽綬解下來，進奉給陳留王劉協。然後扶弘農王劉辯下殿，向坐在北面的劉協稱臣。何太后哽咽流涕，群臣都心中悲傷，但沒有一個人敢說話。
卓又議：“太后迫永樂宮，至令憂死，逆婦姑之禮。”乃遷太后於永安宮。赦天下，改昭寧為永漢。丙子，卓鴆殺何太后，公卿以下不布服，會葬，素衣而已。卓又發何苗棺，出其屍，支解節斷，棄於道邊，殺苗母舞陽君，棄屍於苑枳落中。
董卓又提出：“何太后曾經逼迫婆母董太皇太后，使她憂慮而死，違背了兒媳孝敬婆母的禮制。”於是，把何太后遷到永安宮。大赦天下，把年號昭寧改為永漢。丙子（初三），董卓用毒藥害死何太后。公卿及以下官員不穿喪服，在參加喪禮時，只穿白衣而已。董卓又把何苗的棺木掘出來，取出屍體，肢解後砍為節段，扔在道邊。還殺死何苗的母親舞陽君，把屍體扔在御樹籬牆的枳苑中。
＇13＇詔除公卿以下子弟為郎，以補宦官之職，侍於殿上。
＇13＇下詔，任命朝中公卿及以下官員的子弟為郎官，以填補原來由宦官擔任的職務，在宮殿侍侯皇帝。
＇14＇乙酉，以太尉劉虞為大司馬，封襄賁侯。董卓自為太尉，領前將軍事，加節傳、斧鉞、虎賁，更封侯。
＇14＇乙酉（十二日），任命太尉劉虞為大司馬，封襄賁侯。董卓自己擔任太尉，兼前將軍，並加賜代表皇帝權力的符節，以及作為儀仗的斧鉞和虎賁衛士，進封為侯。
＇15＇丙戌，以太中大夫楊彪為司空。
＇15＇丙戌（十三日），任命太中大夫楊彪為司空。
＇16＇甲午，以豫州牧黃琬為司徒。
＇16＇甲午（二十一日），任命豫州牧黃琬為司徒。
＇17＇董卓率諸公上書，追理陳蕃、竇武及諸黨人，悉復其爵位，遣使吊祠，擢用其子孫。
＇17＇董卓率領三公等大臣上書，請求重新審理陳蕃、竇武以及黨人的案件，一律恢復爵位，派使者去祭悼他們的墳墓，並擢用他們的子孫為官。
＇18＇自六月雨至於是月。
＇18＇自六月到九月，大雨連綿不斷。
＇19＇冬，十月，乙巳，葬靈思皇后。
＇19＇冬季，十月，乙巳（初三），安葬何太后。
＇20＇白波賊寇河東，董卓遣其將牛輔擊之。
＇20＇白波叛軍進攻河東郡，董卓派部下將領牛輔率軍討伐。
初，南單于於扶羅既立，國人殺其父者遂叛，共立須卜骨都侯為單于。於扶羅指闕自訟。會靈帝崩，天下大亂，於扶羅將數千騎與白波賊合兵寇郡縣。時民皆保聚，鈔掠無利，而兵遂挫傷。復欲歸國，國人不受，乃卡河東平陽。須卜骨都侯為單于一年而死，南庭遂虛其位，以老王行國事。
當初，南匈奴單于於扶羅繼位後，謀殺他父親的南匈奴人於是叛變，共同擁立須卜骨都侯為單于。於扶羅到洛陽向朝廷控告他們。正趕上靈帝駕崩，天下大亂，於扶羅便率領數千騎兵聯合白波叛軍共同攻擊郡、縣。當時百姓都聚集在塢堡裡自守，於扶羅沒有搶掠到什麼東西，自己的部隊卻有不少傷亡。他想再回到自己的領地去，但南匈奴人不接納他，他便停留在河東郡的平陽縣。須卜骨都侯做了一年單于後就去世了，南匈奴於是空下王位，而由須卜骨都侯的父親代行單于職權。
＇21＇十一月，以董卓為相國，贊拜不名，入朝不趨，劍履上殿。
＇21＇十一月，任命董卓為相國。允許他在參拜皇帝時不唱名，上朝不趨行，佩劍穿鞋上殿。
＇22＇十二月，戊戌，以司徒黃琬為太尉，司空楊彪為司徒，光祿勳荀爽為司空。