是以建元曰洪憲。”
章太炎到唐繼堯處遊說唐，發現唐沒有出兵誠意，而且唐治下秩序混亂，烏煙瘴氣，頗為失望。於是，他在白晝手提燈籠，漫步街市，燈籠上書“大元帥府秘書章”的字樣，引起圍觀如堵。有人問他為何，他道：“此地種鴉片，漆黑一片，不照明何以舉步？”也有說法稱章在門口點著紅燈籠，別人問起，他答：“四海茫茫，到處黑暗。”
1920年，章太炎由最初的反對軍閥割據轉變為贊成軍閥割據，提出“聯省自治，虛置政府議”的主張。次年，黎元洪就任總統，章太炎受勳一枚，到處宣講“聯省自治”，還主張首都“南遷武漢”。
1923年9月，《華國月刊》在上海創刊，章太炎任社長，該刊宗旨為發揚“國故”，挽救“人心”。
1924年，中國國民黨第一次全國代表大會召開，發表宣言，實現國共合作。在國民黨右派馮自由、居正等人的慫恿下，章太炎公開發表言論，反對國共和作。章太炎說蔣介石執行的三民主義是“賣國主義、黨治主義與民不聊生主義。”
1925年3月，孫中山病逝，靈柩運到南京，奉安中山陵。章太炎專程來到南京弔唁，參加奉安大典。章太炎到南京後，達官貴人們設宴為他接風洗塵。席間，有人請章題字留念。章想起沿途見聞，深感許多革命黨人已腐化變質，有感而發，揮筆寫下對聯一副：“諸君鼠竊狗跳，斯君痛哭；此地龍盤虎踞，古之虛言。”眾人見了，面面相覷。
章太炎曾作一聯挽孫中山：“舉國盡蘇聯，赤化不如陳獨秀；滿朝皆義子，碧雲應繼魏忠賢。”因為碧雲寺，明天啟年間由太監魏忠賢擴建，並在此建墳，準備死後葬此。魏忠賢自縊後，他的黨羽葛九思於1644年隨清軍入京，在此建魏的衣冠冢。1925年，孫中山在京逝世後，曾在該寺的後殿停過靈柩，因而此殿後改為名為中山堂。後又在該寺金剛寶座塔下建孫中山衣冠冢。章太炎反對共產黨，對國共合作不滿，於是以此聯罵那些尊崇孫中山的人盡是魏忠賢的義子。
1927年，章太炎被國民黨上海市黨部臨時執委會點名稱為第一號學閥，呈請國民黨中央加以通緝。
1935年，國民政府代表何應欽與日本梅津美治郎簽訂《何梅協定》，章太炎對此喪權辱國的協定十分憤慨，當即作詩寄於友人，曰：“淮上無堅守，江心尚苟安。憐君未窮巧，更試出藍看。”諷刺國民政府在淮河一帶不設防堅守，竟把中原輕易丟掉，而仍無動於衷。
【囚禁】
1898年秋，戊戌變法失敗後，章太炎力主革命，時蔡元培請章到愛國學社做排滿革命的講演，講演內容隨後發表在《蘇報》上，引起清政府的震怒。恰巧當時鄒容寫《革命軍》一書，請章太炎為之作序。清廷便查封《蘇報》和愛國學社，沒收財產。因章太炎在序言中毫不客氣地稱光緒帝為“載湉小丑”，清廷便以大逆不道罪將太炎告上法庭。以一國訟一人，近代以來，不知有第二人。
因訟案發生在上海租界，當時，滿清政府曾向西方列強許下了滬寧鐵路的特權、白銀10萬兩引渡章太炎、鄒容，但在輿論重壓下，西方列強稱：“租界事，應當在租界處理。”章太炎等人的案件仍由列強的會審公廨審理，得以不被清廷引渡。
當時被清政府通緝的共有六人：蔡元培、章太炎、鄒容、吳稚暉、陳範、宗仰。其他人聽到訊息後，紛紛出逃，蔡元培避難青島，吳稚暉逃往歐洲，陳範東渡日本，宗仰則躲在上海的哈同花園。但章太炎哪裡也不去，這晚，有人告訴他巡捕前來抓人的訊息，章太炎毫不在乎，只說“小事擾擾”，隨即就回屋睡覺。他還勸鄒容不要躲，他說：“革命沒有不流血的。我被清政府查拿，現在已經第七次了。”第二天，外國巡捕再到愛國學社緝捕時，章太炎指著自己的鼻子對巡捕說：“章炳麟就是我。”然後痛快地被巡捕抓走了。當時鄒容已成功地從後門逃脫，但章太炎在獄中寫信勸他自首。鄒容不忍結義大哥一人患難，第二天便前去自首。
章太炎被捕後，上海《新聞報》上有文章，嘲笑章太炎主動送上門，“不去為愚”。章看見此文後，寫下《獄中答新聞報》一文，刊登在最後一期《蘇報》上。章在文中稱：在當今的時代，必須實行革命，而“吾輩書生，未有寸刃尺匕足之抗衡，相延入獄，志在流血，性分所定，上可以質皇天后土，下可以對四萬萬人矣！”最後，章太炎嘲諷《新聞報》的記者說：“斥鵪井蛙，安足與知鯤鵬之志哉！”“滾開吧！新聞記者。請看50年後，巍巍矗立於雲表的銅像到底