會清除異己的行動也就更加名正言順了。1939年3月，在蘇聯共產黨（布）第十八次全國代表大會上，貝利亞當選為政局候補委員。
客觀地說，到了30年代末期，尤其是1939年以後，蘇聯秘密政治警察機關對國內和黨內的清洗、迫害行動已有所收斂（儘管逮捕蘇###內高階幹部和普通黨員的事件仍然時有發生），許多在葉若夫時期已經被立案收審的蘇聯共產黨和國家政府機關的高階幹部獲得了平反，中下級普通黨員幹部中有數萬人被宣佈無罪釋放。特別時在蘇聯紅軍中，一大批高階將領被恢復了職務和工作。
1939年9月，法西斯德國軍隊進入波蘭，第二次世界大戰爆發。儘管《蘇德互不侵犯條約》剛剛於同年的8月23日在莫斯科簽字生效，但是德國、義大利以及日本的結盟和西方陣營竭力將法西斯勢力向社會主義蘇聯誘導的“禍水東引”行動，已經對蘇聯的國際安全環境構成了嚴重的現實威脅。為此，有效地防範來自法西斯陣營和西方國家的間諜和情報滲透，成為蘇聯內務人民委員會的首要任務之一。同時，為了在隨時可能發生鉅變的國際陣營對壘中佔據最主要的地位，掌握更多的王牌，蘇聯內務人民委員會和總參謀部情報總局一直聯手，積極向蘇聯境外派遣和發展情報人員，努力編織跨國間諜網。
1941年2月，在歐洲戰事對蘇聯的威脅日益