訓練，可以在很短的時間裡提高特工們對圖紙、檔案、照片的記憶力。
被招募人員還要練習如何進行跟蹤而不被發現，或讓別人跟蹤自己，再如何甩掉“尾巴”。如果學員輕鬆的完成任務，教管就會派出更有經驗的對手以增加訓練的難度。
經過6個月的訓練考察後，大約三分之一的不合格者被淘汰出局，他們不是自動放棄，就是被教官勸退了。
在最後的半年裡，剩下的學員將接受更為全面的訓練，使他們能更適應派往國家的生活環境。首先，他們必須掌握派往國的語言，並從外表上看與當地人沒有明顯的區別。摩薩德招募成員的一個極為有利的條件就是以色列人的多國家性，在來自世界各地的猶太移民中，它可以輕而易舉地挑選到熟悉所在國情況的間諜人才，等等。例如，從來自德國的猶太人中，招募到一個會說地道德語的間諜就十分容易；同樣，在來自世界各地的猶太移民中，摩薩德可以招募到大批熟悉所在國情況的間諜人才。
訓練的最後一個階段是適應間諜生活的關鍵時刻。在這段時間的主要學習內容是：在可能被派往從事間諜活動的國家和地區應該怎樣穿著？與人們談些什麼？付多少小費？例如，那些有可能被派往德國的情報人員，必須記得德國足球甲級聯賽的戰況；有時候，教管甚至還要求他們知道德國國家足球隊主力球員的姓名、身體狀況、技戰術水平和特點。
這個階段的訓練不僅是在訓練營地進行的，還包括到物件國家和地區的實地考察。一位已退休的摩薩德間諜回憶說：“他們把我派到英國的曼徹斯特，一個聯絡人員把我從機場接回來，並約定了當晚和我碰頭的地點和時間，告訴我碰頭時我將領受任務並得到錢。但是，當我按時到達碰頭地點後，那裡根本沒有人，後來我又去了一次，依然撲了空。這下子我明白了，摩薩德給我設了一個圈套，讓我一文不名地呆在英國，看看我將如何應付。”他說，他完全可以去找警察局，或者到當地的以色列領事館去，不過這樣就會暴露身份。最後，他沒有去找任何人，而是在夜間砸開了一家超級市場的收款處，弄到了錢，乘飛機回到了特拉維夫，向他的教官做了彙報。就這樣，他終於透過了考試。據他講，其他人也許還要接受更困難的“反應能力”考試，例如，有個情報人員在法國被“敵國”間諜組織的人抓住了（其實，這些人是以色列的特工偽裝的），他們對他進行了嚴刑拷打，如果這個人經受不了，說了實話，那麼，他的考試就失敗了。
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摩薩德的訓練與工作方式（2）
在結束了所有的訓練科目之前，每一個參加訓練的預備間諜都會獲得一個新的身份，以完成畢業考試或在將來從事間諜活動時使用。為了避免複雜的具體背景到來的麻煩，他們的新身份一般都是“孤兒”。
訓練結束後，摩薩德會根據每一個參訓人員的成績分配給他們的相應工作：那些成績一般的人會留在總部辦公室工作。例如，在情報蒐集處收集、分析情報；在政治行動與聯絡處負責和友好國家的情報部門保持聯絡，或在秘密的外交部裡工作（這個秘密的外交部負責處理與以色列沒有外交關係的國家之間的非外交渠道事宜）；只有那些成績特別優異的、大約佔總數八分之一的人，才有幸被分配到負責向國外派遣行動和暗殺小組的協調、計劃行動處。
被分配到協調、計劃行動處的人員，還要在海爾茨呂阿海濱浴場附近的別墅裡接受為期三個月的特別強化訓練，學習各種謀殺手段。
摩薩德大多在一些合法機構的掩護下進行活動，如大使館、公司、商務處、旅遊局、航空公司、航海公司等。這些合法機構主要有：扎伊姆航海公司、阿爾航空公司、安德庫農業——動物原料公司、齊菲特工程投資公司、什菲尤消費品貿易公司、迪齊格進出口公司等。
摩薩德還在幾個大國建了名義上的合法機構，掩護它的間諜活動，並從這些國家招募情報人員。這項工作主要是透過物件國人員或第三方來進行的。
摩薩德所直接從事的特殊行動五花八門：既有暗殺、劫持和破壞，也有騙誘、恐怖和偷竊等等。每一次行動之前，個個行動處室都要準備幾套行動方案，然後交給突擊隊員根據情況選擇實施：首先，對行動的地點、人物及其習慣、設施狀況都有詳細的情報；然後再根據情報列出周密的計劃，設想所有可能發生的情況，賦予行動負責人果斷處理一切變化的權力；接下來就是用最少的人和最快的速度，對目標進行閃電般的攻擊，並盡力避免衝突擴大。