土耳其——埃及部隊。
“說在真主面前人人品等，人與人之間只有聰明、才智和品德上的差別。但是，馬穆魯克有些什麼樣的聰明、才智和品德，他們卻獨佔了使生活滿意和美好的一切手段呢？……
“埃及人應該被召喚來擔任所有公職；最有智慧、最有學問和最有德行的人應該執行政務，人民應該得到安樂。
“你們有過一些大城市、大運河和巨大的貿易。如果不是馬穆魯克貪婪、不公正和推行苛政，是什麼東西把所有這一切都毀壞了呢？
“律法師們、酋長們、阿訇們，請告訴人民：我們是穆斯林的真正朋友。……
“極其幸福的人將是那些為我們效力的人！他們將在事業和地位兩個方面都取得成功。
幸福的人將是那些保持中立的人！他們將有時間學習，以便了解我們，而他們將使自己站在我們一邊。
“可是，災殃——成3倍的災殃將降臨到那些為馬穆魯克拿起武器同我們作戰的人身上！他們不會有任何希望，他們將滅亡。
“第一條，位於部隊經過的地方9英里內的所有村莊應派一名代表報告指揮軍隊的將軍：他們是忠順的，並且已經懸掛了藍、白、紅的部隊旗幟。
“第二條，所有拿起武器與部隊為敵的村莊將被焚燬。
“第三條，所有投誠的村莊應把我們部隊旗幟與蘇丹的旗幟一起懸掛。
“第四條，各個部落的酋長應把屬於馬穆魯克的貨物、房屋和財產封存起來，並注意不得有任何侵吞。
“第五條，部落酋長、律法師和阿訇應繼續履行自己的職責。所有居民應留在家裡，並照常祈禱。大家應為消滅馬穆魯克而感謝真主，並高呼：'光榮歸於蘇丹！光榮歸於他的朋友法蘭西部隊！把馬穆魯克逐出教門，幸福屬於埃及人民！'”
6天之後，拿破崙命克萊貝爾為當地和全省司令官，率約9000衛戍部隊留守亞歷山大，自己則率其餘軍隊向開羅進發。
這是一年中最炎熱的季節。全軍要在幾乎是無水的沙漠裡作長達60公里的行軍，官兵們第一次真正認識到這場戰爭的艱苦性。浩翰的沙漠烤灼在直射的驕陽下，水成了最珍貴的東西。鄉村居民在慌亂中起家出走，臨走時往井裡下了毒或將泉水掩蓋起來。法軍沒有準備熱帶服裝，甚至連水壺也沒帶，部隊渴得要命，可除了令人噁心的鹹水塘外，找不到任何解渴的東西。空氣中充滿了毒蟲，黃沙的灼光減弱了大多數人的視力，許多人因此而失明，路途中不見人蹤獸跡和草木，只有阿拉伯騎兵神出鬼沒，不時地襲擊掉隊的法軍。士兵們怨聲載道，難道司令許給每人的6畝土地就在這裡？軍官們也無法忍受這惡劣的環境，被派往貝達的狄舍將軍寫信給拿破崙說：“我求求你，別再讓我們留在這個地方，士兵們已經灰心喪氣、竊聲抱怨了。命令我們前進或者後撤吧。各個村莊盡是小茅屋，一點財源也沒有。”就連繆拉和拉納這樣英勇無畏、久經考驗的將領也忍不住發起牢騷，他們憤怒地把帽徽踩入沙中。惟有拿破崙一人超然於這一切災難之上，他是下了決心要把這場戰爭進行到底。
儘管整個部隊疲憊不堪，但部隊每到一個城鎮都不得有一分鐘的休息，拿破崙的目標是繼續行軍，立即挺進開羅。法軍入侵的訊息傳到開羅，開羅張燈結綵，貝伊們和他們的將軍們發出一陣陣歡呼聲，他們把法軍視為〃待切的西瓜〃，並保證每個馬穆魯克將帶回成百顆人心。於是，穆拉德貝伊率領2000名馬穆魯克、2000名土耳其步兵和60艘船的小艦隊從開羅出發。
7月13日夜間，拿破崙率軍沿尼羅河左岸向南進發，同時由卑雷指揮的一支法國艦隊也沿河上駛。拂曉時分，法軍抵達肖布臘克希，在這裡遇上了穆拉德貝伊率領的馬穆魯克騎兵團。拿破崙立即將他的每個師都組成方陣。方陣裡刺刀林立，寒光逼人。方陣的四角都設有火炮。為了能與河上的艦隊保持接觸，其中一個師的方陣緊靠尼羅河。日出之時，各團的樂隊在方陣中央奏起《馬賽曲》，準備迎接戰鬥。
面對法軍方陣厚密的刺刀，馬穆魯克騎兵毫無懼色，他們喊叫著，發起了勇猛的衝擊，但很快就遭到法軍槍彈和葡萄炮彈的還擊，不得不敗下陣來。馬穆魯克騎兵再次衝鋒，但毫無戰果，法軍的方陣猶如銅牆鐵壁一般，紋絲不動。在法軍強大火力的逼迫下，馬穆魯克騎兵不得不退向開羅。
與此同時，尼羅河上的法國艦隊因遭到馬穆魯克艦隊的攔截而處境危險。法方死傷30多人。正在這關鍵時刻，法國炮艇有一炮擊中