新政，並宣告與他斷絕父子關係。譚嗣同知道自己的事必定要牽連到父親，身為巡撫的老父到時便可以藉此而減輕責任。到了傍晚還不見有人來抓他，便將自己的詩文手稿和一疊家書放進一口小木箱裡，提著這口小木箱來日本使館會梁啟超。託梁啟超替他妥為保管。梁啟超要他留在使館裡不要到會館去了。譚嗣同再次堅決地謝絕，說：“不有行者，無以圖將來；不有死者，無以酬聖主。今南海先生生死未卜，程嬰、杵臼、月照、西鄉，吾與足下分任之。”
說罷二人相與擁抱而別。
這時，恰好日本駐天津領事館領事鄭永昌正在使館裡，林權助便和鄭永昌商量了一個逃跑路線和接頭的辦法。
次日，鄭與梁化裝成外出打獵的樣子，揹著兩支雙筒獵槍，使館的汽車把他們送到前門火車站。二人上了車後，林又給有關方面掛了電話。他們在天津站下了車。剛一出現在月臺，梁啟超便被一個人認出來了。那人立即告訴天津站的巡邏人員，巡邏員馬上跟蹤他們。當發現有人跟蹤時，鄭急中生智，帶著梁跳上海河岸邊的一條帆船。這時已是深夜十二點鐘了。鄭拿出十塊銀元給船老闆，請他趕快開船去塘沽。帆船開出不久，巡邏員坐了一隻小汽船追了上來。當時塘沽的上游方向停泊著日本的軍艦，下游方向停泊著日本的一隻商船，巡邏員以為他們會逃向商船，遂在商船旁邊等著。就在這時，帆船開到軍艦邊，按照預先約好的訊號，鄭領事挽著白手帕，艦長把他們接上了軍艦，立即啟航。就這樣，梁啟超僥倖地逃到了日本。不久康有為透過英國的幫助逃離虎口也到了日本。在伊滕博文和首相大隈重信的照顧下，梁啟超和康有為在日本住了下來。梁為自己取了一個日本名：吉田晉。康也取個日本名：夏木森。
後來，梁啟超得知六君子被殺於菜市口的噩耗，心中悲憤不已，尤其是譚嗣同能逃而不逃，甘願以一己之流血來喚醒國民的崇高獻身精神，更令他又敬又嘆。為了紀念譚嗣同，紀念他們所共同建立的那番為國家和人民造福的轟轟烈烈的新政，梁啟超含淚撰寫了著名的《 譚嗣同傳 》，刊登在他主辦的《 清議報 》上。這份報紙傳到國內後，引起了輿論界的巨大反響。
五年來，梁啟超除受康有為之命在日本及檀香山、新加坡、澳洲等地建立保皇黨組織外，他的絕大部分精力是用來辦報紙，以此來喚起民眾，鼓吹自由、進步、民主、民權、憲政等一系列新思想。他先在東京辦《 清議報 》，繼而去橫濱辦《 新民叢報 》，又辦《 新小說報 》。他所主辦的《 新民叢報 》風靡海內外，是所有報刊雜誌中最受中國民眾尤其是知識青年所歡迎的宣傳品。賦閒在家的黃遵憲寫信給梁啟超，說《 清議報 》遠勝《 時務報 》，《 新民叢報 》又遠勝《 清議報 》。《 新民叢報 》上的文章驚心動魄，一字千金，為人人筆下所無，卻又為人人意中所有，雖鐵石人亦應感動。從古至今，文字之力之大，無過於此。
梁啟超學識淵博，精力過人，除辦報寫政論文章外，他還寫了不少學術著作。古今中外的各種流派思想，傑出人物，都在他的研究範圍之內。梁啟超成了日本留學生心中的偶像，大家出自內心地敬仰他，願意與他交往。一段時期裡，孫中山與梁啟超過從甚密。梁表示贊成孫的革命主張，甚至有意將兩派合為一個會，推孫為會長，梁自任副會長，只是由於康有為的堅決反對沒有實現。正是從那時開始，康梁之間的思想分歧便越來越大了。
梁啟超回到橫濱，得知楊度已來到東京後，便作書一封。信上說：五年未曾晤面，時常想念，知已到日本，不勝欣慰。本欲到東京來把酒暢談，無奈外出日久，報館事務繁多，一時不能抽身。過幾天是明治節，特為邀請令兄弟郎舅同來橫濱過節，以慰雲樹之思云云。梁啟超不知楊度的寓所，便將信寄給住在東京的王照，託他轉給楊度。
二 王照的一句話，道出了戊戌政變的真正原因
王照字小航，乃是戊戌變法運動中的風雲人物。他原是禮部的一個主事，卻不料一封參劾將六個堂官一齊參倒，這是清朝自開國以來沒有過的怪事，一時間轟動全國。事情是這樣的。
新政推行不久，禮部尚書許應騤上了一折，說經濟特科考試時務策論，為非常之舉，不妥，宜與正科一樣，改試八股。這是明目張膽地與新政唱反調，御史楊深秀、宋伯魯合詞劾之。光緒皇帝很討厭許應騤阻撓新政，想罷黜他。協辦大學士剛毅出面為之說情。這是新舊兩派正面交鋒的第一次。
到了七月中旬，禮部主事王照寫了一個摺子，