，與威爾…特納關在一起的黑珍珠號船員告訴他，那是因為食人族很快就要把他們的神“從**的桎梏中解放出來”。這也意味這，傑克…斯派洛的生命也危在旦夕。
伊莎貝拉…斯旺在父親的幫助下，也離開了監獄，並與上將卡特勒…貝克特達成了交易，出發前往拯救未婚夫威爾…特納。
黑珍珠號的船員們被掛在了懸崖半空的一個球形藤籠裡，正在想方設法逃出生天，而傑克…斯派洛船長被逃跑失敗，被食人族綁起來，架到了火堆之上。還好，在火堆生起之前，黑珍珠號船員和威爾…特納成功逃脫，並且作為大目標將食人族都吸引走了。傑克…斯派洛船長利用他柔軟的腰腹力量也順利從火架上跳了下來，並且以兔子蹦跳的姿態成功逃離。
待所有人都重新回到黑珍珠號上之後，傑克…斯派洛和威爾…特納達成了協議，如果威爾…特納能從戴維…瓊斯的幽靈船上拿到聚魂棺的鑰匙，那麼他就把羅盤交出來。
為了找到幽靈船飛翔荷蘭人號，還有埋葬聚魂棺的小島地址，傑克…斯派洛和威爾…特納找到了女巫提亞…朵瑪，七年前就是她把那個能指示一個人內心最深渴望的羅盤給了傑克…斯派洛。此時觀眾才明白，為什麼這個羅盤無法指南，因為它是指向內心渴望的。那麼，卡特勒…貝克特想要這個羅盤也就得到了解釋。
但傑克…斯派洛卻無法利用這個羅盤尋找到聚魂棺或者開啟聚魂棺的鑰匙，也讓女巫提亞看破了他的偽裝：此時他心神不寧，根本無法辨識自己他想要的是什麼。這對於傑克…斯派洛船長來說，是絕對十分罕見的！
傑克…斯派洛用黑珍珠之前那個船長巴博薩的不死猴子作為交易籌碼，交換到了戴維…瓊斯的資訊，知道戴維…瓊斯當年為愛獻出了自己心臟的故事，這也成為了他的致命弱點，誰掌握了聚魂棺裡的心臟，就能夠掌握戴維…瓊斯，成為新的海上霸主。提亞…朵瑪最後給了傑克…斯派洛一罐泥土，來自於埋葬戴維…瓊斯心臟的小島。因為戴維…瓊斯無法登陸那片海域，所以這罐泥土在關鍵時刻就能夠保護傑克…斯派洛。
於是他們再次踏上了尋找幽靈船飛翔荷蘭人號的征途。
發現海面上的一艘殘骸之後，威爾…特納就單獨划船上去找鑰匙，結果發現這居然是陷阱。在經歷頑強抵抗之後。威爾…特納還是被戴維…瓊斯抓住了。而傑克…斯派洛搭乘著黑珍珠號在不遠處用望遠鏡看著這一切，誰知道下一秒就發現戴維…瓊斯出現在了自己的面前。
“無恥”的傑克…斯派洛在試圖以威爾…特納被抓住了作為交換，讓自己得以脫身，未果之後，與戴維…瓊斯達成了協議，三天之內，他拿一百條靈魂來代替自己的靈魂作為報酬。傑克…斯派洛想起戴維…瓊斯是為了愛挖出自己的心臟。於是就告訴戴維…瓊斯，威爾…特納就要結婚了，這成功打動了戴維…瓊斯。戴維…瓊斯把威爾…特納留在了飛翔荷蘭人號上作為水手，而傑克…斯派洛則出發去收集靈魂剩下的九十九條靈魂，從而使自己能夠順利脫身。
由於戴維…瓊斯沒有規定九十九條靈魂的種類，於是傑克…斯派洛來到了龜島——這是一個海盜港口，有著無窮無盡的海盜。在這裡，傑克…斯派洛招聘到九十九名水手似乎並不是困難的事。
在這裡。傑克…斯派洛遇到了假扮成為水手搭乘官方船隻抵達龜島的伊莎貝拉…斯旺，以及伊莎貝拉…斯旺的前未婚夫，如今為了追捕傑克…斯派洛而墮落成為海盜的詹姆斯…諾林頓准將。傑克…斯派洛說服了這個小妮子一起出發去尋找戴維…瓊斯的心。而詹姆斯…諾林頓也一起同行登上了黑珍珠號。經過交談之後，他們發現了上將卡特勒…貝克特的真實目的，他也希望找到聚魂棺，然後透過聚魂棺裡的心臟控制戴維…瓊斯，從而達到控制海域的目的，讓東印度公司的海上事業蓬勃發展起來，同時剿滅所有的海盜。詹姆斯…諾林頓在一旁不僅聽到了這個訊息，還得知，卡特勒…貝克特的交換條件就是一紙大赦文書，並且承諾持這個文書的人能夠成為東印度公司的僱員。
與此同時。在飛翔荷蘭人號上，威爾…特納和父親比爾…特納想用賭sè子的方法把鑰匙從戴維…瓊斯那裡贏過來，可惜失敗了。不過，最後威爾…特納在父親的幫助下，還是成功偷到了鑰匙，並且和一幫人划船逃走。此時。戴維…瓊斯這才意識到，傑克…斯派洛的目標是他的心臟，頓時大怒。戴維…瓊斯再次召喚了章魚海怪出現，把威爾…特納的船擊沉，除了威爾…特納逃生之外，全軍覆沒。然後，戴維…瓊斯飛快地朝聚魂棺所在的海域前進。