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周憲章把伏見宮送給神尾光臣，是送給了他一份大禮。
神尾光臣接受了周憲章的大禮，但是，他也知道，天上不會掉餡餅，周憲章很可能是透過伏見宮這份大禮，向他提出有損日本利益的要求。而且，經歷了這場戰爭，神尾光臣身心疲憊，他已經決定退出軍界。
周憲章笑了笑：“神尾君請放心，我只是想和神尾君交個朋友，沒有別的意思。”
十天後，神尾光臣乘坐日本商船，帶著伏見宮貞愛親王回國。
滯留在臺灣的日軍，經過一個多月，才全部遣返完畢，他們留下了全部的武器裝備，包括整整一個艦隊。
臺南大戰，張勳所部居功至偉，當吳佩孚第一師外圍城防被日軍突破後，張勳的直屬旅憑藉臺南城裡的街巷房屋，與日軍展開激烈的巷戰，把日軍三萬人死死脫在臺南城裡，同時，力保赤崁樓不失，為章軍聚殲日軍創造了條件。大戰結束後，周憲章信守諾言，任命張勳為臺南知府，並允許他把赤崁樓作為自己的府衙，同時，兼任直屬旅旅長，直屬旅駐守臺南、西崗、安平。張勳實現了他上馬管軍下馬管民的願望，一時間風光無限。
周憲章以大清國總理衙門大臣的名義，要求閩浙總督端明，向章軍開放馬尾軍港，把章軍囤積在馬尾的物資，運到臺南來。章軍攜戰勝日軍之威，虎視福建沿海，大清國朝廷見勢不妙，急忙做出一副笑臉來，不敢回絕周憲章的要求，慈禧太后和光緒皇帝，雙雙向章軍發來賀信，同時，命閩浙總督端方，立即向章軍開放馬尾軍港。
端方早就和周憲章暗中來往，此時樂的做個順水人情，讓章軍的艦隊進入馬尾，把堆積如山的物資運到了臺南，同時，以犒賞三軍的名義，從福建籌集了一批錢糧，一併交給章軍艦隊。
物資錢糧送到臺南後，周憲章命人把武器彈藥運到了臺北儲備起來，錢糧藥品全部交給了張勳，讓他以臺南知府的名義，賑濟臺南、太保、嘉義、彰化等經受戰火襲擾的地區民眾。臺南大戰，民眾犧牲巨大，整個臺南被打成了一片廢墟，百業俱廢，民眾傾家蕩產。這筆錢糧發給民眾後，民眾一片歡呼，更加死心塌地的擁戴章軍。有了這筆錢，臺南民眾得以重建家園。
隨後，周憲章對臺灣章軍進行了重新部署。
吳佩孚第一師駐軍臺北和基隆。
那哈五的第二師駐軍臺中、彰化一帶。韓令準則是率領朝鮮團，回到了朝鮮，加入了章軍朝鮮方面軍。
張作霖第三師駐軍花蓮，負責臺灣東部沿海的安全。
其他師直屬部隊，全部隨周憲章駐紮在臺北一帶。
郭二杆的獨立旅加上李國革的海軍陸戰隊，以及部分海軍艦船，駐守琉球列島，對日本本土形成攻擊之勢。
章軍海軍擁有了四十多艘戰艦，而且，絕大多數都是世界上最為先進的戰艦。這支龐大的艦隊被分成了三部分，海軍司令蔡挺幹率二十多艘戰艦組成的主力駐守基隆港。濟遠艦管帶程碧光率濟遠等八艘戰艦，組成朝鮮支隊，駐守仁川，配合朝鮮方面軍守衛朝鮮。對日本形成北方攻勢。其他的戰艦，則是以定遠艦為旗艦，組成東方艦隊，駐守琉球，配合獨立旅完成對琉球的佔領。
臺南的善後事宜處理得差不多了，周憲章啟程前往臺北。
按照歷史淵源，周憲章把臺北定為臺灣首府。章軍總部和臺灣巡撫衙門，都將設在臺北。吳佩孚率第一師已經在半個月前到達臺北，這一次，周憲章兵分兩路。
周憲章任命的臺灣巡撫劉永福率文官們，走嘉義、彰化大路，前往臺北打前站。在這之前，周憲章已經任命丘蓬甲為臺北知府，吳彭年為彰化知府，丘蓬甲已經把日本人的臺灣總督府打整一新，準備迎接周憲章入住，另外新建了一座巡撫衙門，供劉永福入住。
周憲章本人則是和章軍阿里山縱隊一起，從東北方向沿著張作霖第三師曾經走過的迂迴線路，進入阿里山。
他要親自向鄒族同胞表示謝意，並把梅里溪送回白鹿寨。按照他和梅里溪的約法三章，要等到趙巧兒來到臺灣後，迎娶金姝之後，才能正式迎娶梅里溪。
第209章 嫂子坐鎮
阿里山地區鄒族是臺南大戰的堅強後盾。有了他們的支援，獨立旅在玄月湖一帶立足，出兵彰化，斷了日軍的後路，迫使臺南日軍陷入孤軍作戰的境地。此外，阿里山地區成為章軍第二師和第三師的戰