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雖然莫臥兒帝國全境目下尚未完全底定，然而一應善後安民事宜早已經在運轉或者籌備。
已經控制的疆土，尤其是南寧經略府與雲南經略府最初所攻克佔領的一些行省、土邦，不僅設官分職、安撫地方、整修水利、築路通郵、勸導農牧、扶持工商等諸項治民理政舉措已經頗見成效，境內黎庶安然，百業興旺，而且融入西北的步伐，甚至一般人都可以明顯感覺得到，畢竟在那些地方，湧來西域淘金的中土華夏人口已經佔據優勢。
然而，在目前尚處於經略府駐軍管制之下的新拓疆土，卻是百廢待興，民心不安，其善後安撫、農牧屯墾、水利郵驛諸事皆為急務，然最根本的還是設官分職以治民。
目前，已經設立的‘北寧總督區’，管轄原莫臥兒帝國北印度地區的土邦和行省；除此之外，在中印度地區，西北幕府已經確定要在該地區設立‘中州總督區’，由幕府派駐‘總督’，代表平虜公管轄督察中印度地區的土邦、行省；而在南印度地區則設立‘南華總督區’，在東印度地區設立‘東洲總督區’、‘東安總督區’、‘下恆河總督區’，在西南印度沿海地區設立‘西南海岸總督區’；此外，還單獨設立‘河漕總督’暫時管轄七大總督區境內所有內河水師、漕運、水利及水驛商貿等，以及設定‘兩海總督’總攬各總督區的海防事務。也就是說，西北幕府將在原莫臥兒境內設七大總督區，置九大總督。同時還要附帶提一下的是，西北幕府已經確定要在緬地設立三大駐緬總督區。
那麼，如何擇人任事就是關鍵，總督人選將關乎南略成敗西北氣數，焉可不慎？
如果說，駐緬的三位總督人選尚可在雲南經略府、南寧經略府的文武官僚中簡選一二的話，那麼莫臥兒這邊的九位總督人選就必須慎之又慎了，南寧經略府、雲南經略府的文武官員能在其中佔據兩三席就是極限了，所謂獨食不肥，就是這個道理。
雷瑾還打算向朝廷請封庶子雷洹（生母即為公府側室夫人綠痕）為‘南寧伯’，在將來代表平虜公府永鎮南疆之土暗埋伏筆，當然雷瑾將來亦不可能只讓雷洹一子‘就藩’於莫臥兒；同時雷瑾還打算授綠痕‘使持節假黃鉞特命宣撫制置使’的特命差遣頭銜，只待莫臥兒全土賓服之後，即進駐‘底裡’，宣撫南疆，總制軍政，總攬監察糾劾南疆九大總督之權，一待南疆局面安定則予召還，這卻是因事而設，事畢即予撤回的差遣。
軍憲令署也要在同時向各總督衙門派駐‘軍憲官’、設‘憲官部’、建置緹騎，掌軍法軍紀諸事。
至於長史府、審理院、監察院、審計院等其他府院衙署，如何向南方新設總督區及其下轄的各個行省、土邦派駐官吏的詳情則不一一細表。
還有一件，就是地名的改換，這雖然不是什麼大事，卻也不能輕忽視之。畢竟與人名不同，這地名一改，那就是以千百年計的事情，而且南疆七大總督區治下屬地的地名，關涉到南疆大勢的穩定，雖然不能操切於此，但是全然沿用原來的地名，於治理上也是不利，也不便於施政和同化，總要先改換一小批，其他的再酌情慢慢的改換，積少成多就是既定策略。因此，這件事情，幕府已經擬定的地名，卻也是最終需要雷瑾作一個定奪取捨，正如孔聖人所言：“必也正名乎”，改換地名就是要在這片疆土上烙下深深的西北印記，等到百十年以後，人人習以為常，潛移默化的效果才能慢慢生髮出來，所以事雖小，裁決定案卻須直接上報西北幕府予以稽核批覆。
除了七大總督區的命名之外，行省和土邦原來的命名，改換不多，除了總督區所駐的行省與總督區同時改為同一地名之外，其他約三分之二的行省大都暫時沿用原名，而土邦及部落的命名一個都沒有變動；另外在‘府’一級的地名，有的是依據中土以往所譯佛經所記述的古天竺國地名而定，比如鹿野苑府、靈鷲府、福城府（屬‘榜葛剌’）、舍衛府、那爛陀府、王舍府、雙林府、菩提伽府、藍毗尼州、阿旃陀府、曲女府、廣嚴府、樂授寺府、阿逾陀府、光明府、師子府、焉荼府等；有的是依據史有記載的古天竺佛教高僧出生、得道、講法或駐錫地來命名，比如月胄府、達摩府、龍樹府、阿底峽府等；有的則是依據原有地名的諧音，比如佈德灣（佈德萬），總的看來，改換得並不算多。
西北幕府改換的地名，主要集中在‘縣’這一