但當六月二十二日的太陽落山後，這接近百條的戰艦，只有四艘巡洋艦和十三艘驅逐艦，勉強逃過了日本海軍的追殺，至於三十多條的輔助補給艦，在當日白天的戰鬥中，也大都被蜂擁而來的日本海軍俘虜。少量因為頑抗而被擊沉。而損失的戰艦中，除了被俘的旗艦南達科他號外，還有一艘布魯克林級輕巡洋艦和一艘驅逐艦也被日軍俘虜。
在這十六小時的海戰中，美國海軍損失水兵超過三萬人（包括被俘及輔助補給艦上人員），十八條主力戰艦（包括空母）戰沉或被俘。
而聯合艦隊自身，僅有八條魚雷艇被擊沉，二十餘條受傷，少量艦艇在海戰中遭遇炮擊受到一定的輕創，被擊落飛機十架，擊傷數十架，另有十多架飛機在航母空上著陸時因為損壞嚴重而必須大修，死傷人數加起來不過四百人。
戰鬥結束後，旗艦大和號上，海圖室指揮中心裡的軍官紛紛向聯合艦隊最高司令長官的山本五十六慶祝聯合艦隊取得了人類歷史上規模最大海戰的大勝。
山本五十六並沒有表現大勝後的喜悅，反而象歷史上一般地對部下嘆息道：“我們只是喚醒了一個沉睡中的巨人而已。”
而另一旁，以神明一般的姿態存在於大和號上的“大和撫子”，也對海圖室裡一班鬼子高官道：“這場戰爭，會比諸君想象中還要艱苦，還要漫長。我們最少要象今天這般，再毀滅美國艦隊兩次，才有可能將他們逼到談判桌前。”
六月二十二日的海戰，日本海軍在關島附近摧毀了第二大白艦隊，而位於菲律賓的馬尼港的太平洋艦隊分艦，其毀滅的時間和“第二大白艦隊”幾乎是同步的。
第二大白艦隊出發前，為了滿足威爾基總統“裝逼”的需要，原本停在菲律賓的幾艘戰列艦也返回珍珠港，一方面是為了維護，另一方面卻是為了出行時規模更大以便“裝逼需要”，此外還有一個要素，卻是為防萬一避免被英日海軍各個擊破。
所以駐馬尼拉的分艦此時僅有一艘列剋星敦號航母，當時他的任務是在五月份時運送一批P40戰鬥機到馬尼拉以便增強這兒的空軍實力。
結果在六月22日“第二大白艦隊”毀滅的當晚，在關島海戰開始後不到一個小時，戰前已秘密行進到馬尼拉外海的四艘“神鷹級”護航航母，在當晚先後起飛上了百架攻擊機，攻擊了馬尼拉港。
雖然攻擊前十五分鐘，美國人設定在馬尼拉周邊的雷達站發現了日軍飛機的蹤跡。但時值凌晨，和平時期懈怠慣了的雷達員，拖拖拉拉地過了五分鐘才報告上級，上級又磨磨噌噌地向他的上級再請示，情報傳到防空軍手中時，日本的攻擊機群距離馬尼拉已不足五分鐘的航程。
這個時候，太平洋艦隊在關島遇襲的情報也已傳到馬尼拉，當美國海陸空三軍急急忙忙地發出戰鬥警報時，從神鷹級航母上起飛的上百架飛機已經飛臨港上空，開始投彈。
列剋星敦號航母當時就停泊在馬尼拉港的泊處，完全處於無生火無加掛防魚雷網的狀態。
先是日軍領頭的攻擊機投下照明彈，照亮整個港口，然後其餘的飛機以列剋星敦號為目標，投下十餘枚重型航彈和放出十餘發航空魚雷。
由於夜晚原因，日機投下的航彈全部失的，但十二架魚雷攻擊機以打死靶的方式射出的魚雷，卻前後命中列剋星敦號一側六發，在該艘航母身體一側開出一大排巨型破洞。
剛從夢鄉被防空警報驚醒的艦長下令給另一側緊急放水妄想改平，但是該艦還是由於進水太多，直接一個猛子紮下去坐沉泊地。短時間內，列剋星敦號變成了一塊在泊位坐沉動彈不得的廢鐵。
在廢掉了列剋星敦號後，剩餘的日機又轟炸了當地的機場和軍營。在此次轟炸期間，日本飛機還擊傷了兩艘停在港內的美國驅逐艦。而在接下來的日子，位於臺灣的日本海軍帶著陸軍南下，發動了奪取菲律賓的戰役。身受重傷列剋星敦號最後的結局是軍方在撤退前將炸藥安放在軍艦的龍骨上“自火暴”，炸斷龍骨自我報廢以阻止日軍俘獲此艦後再利用。菲律賓戰役結束後，日本人打撈起了該艦殘骸拆解進行回收處理。
至此，美國海軍在太平洋上的主力艦，在二十四小時內完全消失。六月二十二日過後，一天之內，美國海軍也從世界第一的王座上重重地摔掉了下來，掉到了和義大利海軍差不多的地步。而將美國海軍拉下王座的日本海軍，這一天過後，也暫時搶得了世界第一的皇冠。
不過在戴上海軍世界第一的皇冠的同時，“大日本帝國”還要承受的，是世界第一工業國的憤怒